专业数据库在药学课程教育中的应用.doc
《专业数据库在药学课程教育中的应用.doc》由会员分享,可在线阅读,更多相关《专业数据库在药学课程教育中的应用.doc(10页珍藏版)》请在三一文库上搜索。
1、专业数据库在药学课程教育中的应用随着计算机技术的不断发展,基于互联网的数据库在内容和功能上均有了较快的发展。数据库除了在科研方面起到重要作用以外,在教学方面也日益成为一项重要的工具。传统的数据库主要具有文献检索功能,随着文献检索型数据库规模扩大,跨专业趋势明显,使用已经较为简便和普及,一些大型的文献数据库已为广大师生所熟知。而一些以具体数据和信息为主要检索对象的数据库则向着更专业的方向发展,不断增加专业信息的存储量,并提供与专业相关的计算与分析功能,在药学科研和教学领域起到重要的作用。药学人才培养可定位为研究型人才、应用型人才和服务型人才1。药学专业的学习跨越化学、生物学和医学三大领域,所涉及
2、的知识面宽,在学习中所需掌握的知识点多,特定的机理也较为复杂。在药学院的课程中利用专业数据库对特定的知识点进行讲解,将有助于学生加深对课本知识的理解,增加学生对知识掌握的深度。在药学教育中加入对药学相关数据库的学习,将有助于培养学生自己动手解决具体问题的能力、自我学习能力和创新能力。 一、药学相关数据库及其在药学教育中的应用 1.有机化学类相关数据库 在学习有机化学中立体化学相关知识时,一些概念比较抽象,仅通过二维的图像不容易使学生理解。ChemBioFnder 数据库2和PubChem数据库3是常用的化学数据库,这两个数据库均提供以化学式检索的功能。可检索到化学药品的2D 结构式和3D模型。
3、化合物的3D模型可以帮助学生更好的理解立体化学中的相关概念。数据库提供了大量的化合物的相关信息,这使得学生可以在书中的例子外,检索感兴趣的化合物,分析实践中遇到的问题。ChemBioFnder 数据库还提供化学专业软件ChemOffice 系列工具包的链接,其中的ChemDraw可以帮助教师绘制化合物的标准结构图,Chem3D还可绘制化合物的3D图形,有助于课堂讲解。PubChem数据库还提供化合物的生物活性,生物检定法等信息,对化合物相关实验有较为详细的描述,并列出引用文献,有助于学生了解该化合物较全面的信息。 2.生物化学与分子生物学相关数据库 生物化学中代谢途径是重要的知识点,代谢途径之
4、间的联系十分复杂,在课本中仅对主要的代谢途径进行介绍,并不能掌握分支途径之间的联系和代谢途径的全貌。KEGG数据库4是一个大型综合数据库,主要内容包括系统信息、基因信息、化学信息和健康信息。KEEG数据库中最独特的数据模块是分子网络,对细胞和组织的系统功能、分子间相互作用、反应和关系网络以关系图的方式进行展现。它的图形界面十分便于分析和解读。通过对该数据库的学习,可以加深学生对代谢途径的认识,拓展主要代谢途径以外其它代谢途径的学习,更有助于提高学生对整个生物系统复杂性的认识。 基因是生物化学和分子生物学中的重要概念。GenBank数据库5、EMBL核酸库6和DDBJ数据库7是国际上著名的三大核
5、酸序列数据库。通过对这些数据库的学习可以加深对基因概念的认识。学生可以通过检索获得特定基因的序列,在实验课程中设计特定引物通过聚合酶链式反应(PCR)的方法检测相应的基因序列。通过检索人类基因组,细菌基因组等数据,可以使学生在整体上对基因组的概念有更好的认识。蛋白质也是生物化学中的一个重要的知识点。蛋白质序列数据库有SWISS-PROT8、PIR-PSD9和PDB10等。在讲解相关知识点时,可以查询蛋白质数据库,将蛋白质结构以图片形式在课堂直观地展现,有助于学生对蛋白质作用位点的认识。如有教师通过检索PDB数据库,查找卡托普利与人血管紧张素转化酶的晶体复合物,通过相关专业软件将其转换成图片格式
6、,再对作用方式加以讲解说明,相关知识点就变得直观,而且易于理解11。在生物化学领域有一些较新的概念,课本中对于其功能的描述仅限于前期的研究,但由于是研究热点问题,新的作用机理也在不断被发现,有必要对这种知识点进行跟踪。如MicroRNAs(miRNAs)是在真核生物中发现的一类内源性的具有调控功能的非编码RNA,最近的研究表明miRNA参与各种各样的调节途径,包括发育、病毒防御、造血过程、器官形成、细胞增殖和凋亡等。由于其重要的作用,在生物化学课程中也是一个较为重要的知识点。miRBase数据库12作为目前最权威和完整的miRNA数据库,已经收录了一百余个物种中超过10000个miRNA记录。
7、这对学生深入了解miRNA的概念,跟?最新的miRNA研究提供了帮助。病毒的结构是分子生物学中与药学专业结合较紧密的知识点。VIPR数据库13可以检索病毒的基因组、免疫表位和3D蛋白结构,并提供核酸序列对比,系统发育关系分析等功能。这些数据有助于学生深入理解病毒的结构,对比不同病毒的结构差异。 3.药理学与药物毒理学相关数据库 药理学研究药物与机体(含病原体)相互作用规律及其原理。药理学课程对主要药物类别的药理作用,不良反应等内容进行学习。药品的作用机理十分复杂,具体药品有着自己的药理学特性。在授课中使用专业数据库查询某种具体药物的药理学特性,并进行讲解,可以使学生更深入地了解药理学特性的复杂
8、性。Drug Information 数据库14可提供全面的药品药理学特性,包括药物的概述、不良反应、剂量、药品与其它药品同时使用时可能产生的不良作用等方面内容。该数据库对药理特性的记录十分详细,可以达到数万字,这样可以使学生更深入地了解药物的作用机理及应注意的事项,有助于帮助学生拓展对药理学的学习。具有相似功能的数据库还有RxList15数据库,RxList数据库是美国的一个处方药物查寻网址,该数据库对具体药物有详细的介绍,在医院药师面对快速更新的新药市场时,该网站由于更新速度快,成为广泛使用的处方药物查询手册。DrugBank数据库16可以检索多种药物的靶点,这个功能在研发新药上有着重要的
- 配套讲稿:
如PPT文件的首页显示word图标,表示该PPT已包含配套word讲稿。双击word图标可打开word文档。
- 特殊限制:
部分文档作品中含有的国旗、国徽等图片,仅作为作品整体效果示例展示,禁止商用。设计者仅对作品中独创性部分享有著作权。
- 关 键 词:
- 专业 数据库 药学 课程 教育 中的 应用
链接地址:https://www.31doc.com/p-1593281.html