【医药健康】光合细菌分类、鉴定及保存-精选文档.ppt
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1、,光合细菌应用中存在的问题 光合细菌分类学进展 宁波大学在光合细菌方面的研究 第二届分子微生物生态研讨班,光合细菌应用中存在的问题 菌种不纯 菌种鉴定不准 实验环境因子复杂,实验数据缺乏统计学分析 应用效果评价困难 光合细菌分类学进展 宁波大学在光合细菌方面的研究 中国生态学会微生物生态专业委员会宁波大学培训基地,光合细菌分类鉴定研究进展,伯杰细菌鉴定手册 Bergeys Manual of Determinative Bacteriology 1923年第1版 1974年第8版 1994年第9版 都停留在对光合细菌的形态生理描述上,所有的光合细菌都被单独放到红螺菌目1个目中,红螺菌目 红螺菌
2、科 外硫红螺菌科 绿硫菌科 绿色丝状细菌,伯杰氏系统细菌学手册,近年的分子系统学研究表明,紫色非硫细菌的系统发育是多起源的,分散在变形菌门和两个纲的多个科中,与非光合细菌的系统发育混杂在一起。现在认为,光合器官的性质对种的鉴定还是重要的,但对较高分类阶元,如科、目等则没有太大意义。 伯杰氏系统细菌学手册 Bergeys Manual of Systematic Bacteriology 1989年,第1版 2001年,第1版 以后的国际分类学权威书籍中,光合细菌的分类采用了完全不同的分类系统。,产氧光合细菌 蓝细菌门 (产氧光养细菌) 光合细菌,所有的紫色非硫细菌分属于变形菌门的、两个纲的5个
3、目8个科中,共21个属:,红假单胞菌属(Rhodopseudomonas): 沼泽红假单胞菌 (Rps. palustris) 荚膜红假单胞菌 (Rps. capsulata) 球形红假单胞菌 (Rps. sphaeroides) 胶质红假单胞菌 (Rps. geletinosa) 绿色红假单胞菌 (Rps. viridis) 嗜酸红假单胞菌 (Rps. acidophila) 粪红假单胞菌 (Rps. faecalis) Rps. Rhenobacensis,红长命菌属(Rubrivivax),红细菌属(Rhodobacter),红芽生菌属(Rhodoblastus),芽生绿菌属 (Blas
4、tochloris),红螺菌属 (Rhodospirillum) 深红红螺菌 (Rsp. rubrum) 度光红螺菌 ( Rsp. photometricum) 黄褐红螺菌 ( Rsp. fulvum) 莫氏红螺菌 ( Rsp. molischianum) 中盐红螺菌 (Rsp. mediosalina),Phaeospirillum(褐螺菌属),Roseospira (玫瑰螺菌属),1999.3.中国科学院微生物研究所博士论文:紫色非硫细菌资源分类学研究. 2001. 第一章,光合细菌. 东秀珠、蔡妙英主编。常见细菌鉴定手册。 2004.第一章,光合细菌的培养. 成永旭主编,饵料培养学。 2
5、009. 杨素萍。微生物学报。,宁波大学在光合细菌方面的研究,中国科学院微生物菌种保藏中心的绝大多数光合细菌菌种 发表2个新种,有4个可能新种待发表 应用DGGE跟踪确定单菌落的纯培养 应用分子指纹技术标记重要光合细菌菌种 应用分子指纹技术检测养殖水体种光合细菌群落演替 光合细菌菌种质量及应用效果评价体系 环境细菌菌种资源库 养殖废水和河道废水处理菌剂开发,第二届分子微生物生态研讨班,中国生态学会微生物生态专业委员会宁波大学培训基地 第二届分子微生物生态研讨班 主要培训研讨内容: 原位杂交(FISH) 环境样品DNA提取及其杂质去除 定量PCR技术及其应用,变形菌纲 红螺菌目(Rhodospi
6、rillales) 该目有2科7属。 红螺菌科(Rhodospirillaceae)6个属 醋酸杆菌科(Acetobacteraceae)1个属 红细菌目(Rhodobacterales) 有1科4属 红细菌科, ( Rhodobacteraceae) 根瘤菌目(Rhizobiales) 有3科7属 慢生根瘤菌科(Bradyrhizobiaceae)2个属 生丝微菌科(Hyphomicrobiaceae)3个属 红游动菌科(Rhodobiaceae)2个属 变形菌纲(Betaproteobacteria) 伯克霍尔德氏菌目(Burkholderiales) 1科 丛毛单胞菌科Comamonad
7、aceae2个属 红环菌目(Rhodocyclales) 1科 红环菌科Rhodocyclaceae,变形菌纲 3个目6个科 (1) 红螺菌目(Rhodospirillales) 该目有2科7属。 红螺菌科(Rhodospirillaceae) 红螺菌属(Rhodospirillum) 褐螺菌属(Phaeospirillum) 红螺细菌属(Rhodospira) 红弧菌属(Rhodovibrio) 玫瑰螺菌属(Roseospira) 红篓菌属(Rhodocista) 醋酸杆菌科(Acetobacteraceae)只有红球形菌属(Rhodopila)1个属。,(2) 红细菌目(Rhodobact
8、erales) 有1科(红细菌科,Rhodobacteraceae)4属: 红细菌属(Rhodobacter)、红海菌属(Rhodothalassium)、小红卵菌属(Rhodovulum)和最近才发现的Rhodobaca。,(3) 根瘤菌目(Rhizobiales) 有3科7属。 慢生根瘤菌科(Bradyrhizobiaceae)有红假单胞菌属(Rhodopseudomonas)、红芽生菌属(Rhodoblastus)2个属。 生丝微菌科(Hyphomicrobiaceae)有芽生绿菌属(Blastochloris)、红微菌属(Rhodomicrobium)、红菌属(Rhodobium)3个
9、属。 红游动菌科(Rhodobiaceae)有红游动菌属(Rhodoplanes)和Roseospirillum 2个属。,2变形菌纲(Betaproteobacteria) (1)伯克霍尔德氏菌目(Burkholderiales) 1科(丛毛单胞菌科Comamonadaceae)2个属:红长命菌属(Rubrivivax)、红育菌属(Rhodoferax)。 (2)红环菌目(Rhodocyclales) 1科(红环菌科Rhodocyclaceae) 红环菌属(Rhodocyclus)。,西医学是最近三四百年来建立在解剖学、生物学及现代科学技术基础上、发展起来的一门以“解剖人、肉体人”为概念的、
10、新兴的现代医学科学理论体系。主要采用科学实验方法,从宏观到微观,直至目前的分子基因层次水平,发展极为迅速,超过其它任何一门医学科学,成为世界医学史上的主流。 可见中西医学,一个是以“功能人”为概念的独特的哲学医学理论体系,一个是以“解剖人、肉体人”为概念的新兴的现代医学科学理论体系,二者都不是以完整人为研究对象的科学,从理论讲二者都不是科学的,势必影响各自发展。事实也证明这一切,中医长期停滞不前、疗效也不确实。西医尽管发展到目前的基因分子层次,但疾病发病率居高不下,对绝大部分疾病发病原因认识不清、发病机理弄不明白,治疗受到制约,在小小SARS、禽流感面前竟束手无策,在糖尿病、癌症、心脑血管疾病
11、、尿毒症等相当多疾病面前更是不得不求助或借助中医治疗。一个是疗效不确实,一个是有些甚至相当多疾病无法治疗,这就是中西医学结合的缘由。然而,由于二者是两套理论、两股道上跑的车,风马牛不相及,从理论上讲就没有结合的可能,只是形式上的融合罢了。故出现西医对治疗不了的疾病只好求助中医,而中医则往往采用西医诊断中医治疗,以及中西治疗法一块用的局面。 至于循证医学、比较医学、后现代医学、行为医学等所谓“医学”,都称不上一门独立的医学科学,关于这一点在灵魂医学有关章节中将有相关点评。 现今医学分为传统医学、基于“生物-医学模式”近代发展起来的西医,20世纪西医又发展到“社会-心理-生物医学” (df高血压9
12、58心脏病983u6糖尿病87fr)或综合医学模式,后基因组时代系统生物学的兴起,(45传染病q566丙肝964jo乙肝28jgsx甲肝gh)形成了系统医学在全球的迅速发展,成为继传统医学、西医学之后中、西医学汇通的未来医学。当代中国医学类专业比较优秀的学校有北京大学、(4f肿瘤fbb癌症yuw3胃癌d65io肠癌.f2tr肺癌65ff) 华中科技大学、郑州大学等学校。 (df肺25s血液f369血小板t5172红血球gdf55m白血球fd2) 中医即中国传统医药学,是形成于数千年前的中国,是建立在人们与疾病长期斗争的经验总结及阴阳五行、八纲脏腑辨证基础上,运用朴素辩证法及思辨推理方法,认识机
13、体、自然、疾病三者关系,发展起来的(45传染病q566丙肝964jo乙肝28jgsx甲肝gh)一门以“功能人”包括功能脏器为概念的独特的医学哲学理论体系。(df4肺炎88gdg青霉素d25f肝炎df6) 在治疗上,除了药物外,还有针灸、推拿气功、(df高血压958心脏病983u6糖尿病87fr)耳针等特殊疗法,它是世界传统医学中最完善的一种医学理论体系。它为人类尤其为中国人民(4f肿瘤fbb癌症yuw3胃癌d65io肠癌.f2tr肺癌65ff) 健康和民族繁衍做出了巨大贡献。 (df肺25s血液f369血小板t5172红血球gdf55m白血球fd2) 西医学是最近三四百年来建立在解剖学、生物学
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