国家超级计算长沙中心用户手册.ppt
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1、国家超级计算长沙中心 用户手册,如何使用中心资源,申请账号 首先进入中心网站www.nscc-,了解中心提供的计算资源和服务,然后联系中心工作人员,获取用户上机申请表,按照用户上机申请表填写说明完成填写,经单位领导签字加盖公章后送至中心才能完成最后注册。 中心对用户上机申请表进行审查后,为用户开通账号,用户即可使用中心资源了。,如何使用中心资源,使用形式 内网登录:在中心终端机房,采用X windows、SshClient、putty等远程登录工具直接登录使用中心资源; 外网登录:在可以连接Internet的终端机上,在IE浏览器中输入https:/222.247.53.61,通过SSLVPN
2、用户登录系统使用中心资源,外网登录另外的方法:在本机上安装SSL VPN独立客户端,然后打开。如图所示,机群基本操作,远程登录 step1:利用putty进入登录服务器(以计算阵列(ip:25.8.2.2)为例):,机群基本操作,step2:点击open后进入以下界面 :,机群基本操作,step3:输入你的用户名及密码:,机群基本操作,用户登录服务器后,默认进入到与用户名同名的目录下,进入到/vol6/home/user_name,机群基本操作,基本操作 1)进入目录:cd 2)建文件夹:mkdir 3)查看目录信息:ls ll 4)删除文件:rm 文件名 5)拷贝文件:cp options
3、source dest 6)改变文件/目录属性:chmod 7)设置文件/目录拥有者:chown 8)搜索文件:find ,grep 9)进程管理:ps top w who 10)压缩解压缩:tar, gzip 11)修改密码:passwd,机群基本操作,vi编辑器 Vi提供三种操作模式:命令模式、插入模式、末行模式,三种模式可通过ESC键进行相互转换。 :q! 离开vi,并放弃刚在缓冲区内编辑的内容 :wq 将缓冲区内的资料写入磁盘中,并离开vi :x 同wq :w 将缓冲区内的资料写入磁盘中,但并不离开vi :q 离开vi,若文件被修改过,则会被要求确认是否放弃修改的内容,机群基本操作,:
4、set nu 设定资料的行号。 :set nonu 取消行号设定。 :10,20w test 将第10行至第20行的资料写入test文件。 :10,20wtest 将第10行至第20行的资料加在test文件之后。 删除、复制及搬移 :10,20d 删除第10行至第20行的资料。 :10d 删除第10行的资料。 :%d 删除整个编辑缓冲区。 :10,20co30 将第10行至第20行的资料复制至第30行之后。 :10,20mo30 将第10行至第20行的资料搬移至第30行之后。,用户作业管理,作业提交基本流程 Step1:用户准备数据输入与作业脚本文件; Step2: ftp上传数据文件至用户目
5、录; 用户可用任意ftp工具将数据上传或下载数据,用户名密码即为你登录机群时使用的用户名和密码,用户作业管理,Step3:登录机群服务器,用yhinfo命令查看节点的信息:,用户作业管理,yhinfo可以显示节点的一些信息,具体说明如下 : (1)PARTITION:表示节点的分组情况;默认的组会有组名前加上*号,例如:以上情况下,work就是默认的组,若不指定,作业会自动加载到默认组中的节点,如需要到将作业加载到特殊的组别需要添加相应参数; (2)AVAIL:表示节点默认的状态,up表示可用; (3)NODE:表示作业占用的节点数; (4)STATE:表示节点目前的状态; (5)NODELI
6、ST:表示作业占用的节点列表;,用户作业管理,下表是节点状态的具体信息:,用户作业管理,Step4:编译,调试作业; 集群上安装了包括gcc,icc等常用的编译器,用户可以根据自身的需要进行选择。如果是并行程序,编译命令应使用以下命令: mpicc:用于对c语言写的并行程序; Mpicxx:用于使用c+语言编写的并行程序; Mpif77,mpif90:用于使用fortran语文编写的程序;后缀的选择与你使用的fortran语言版本有关 ; 具体命令(以C语言程序为例): mpicc o cpi(编译后的可执行代码) cpi.c(原程序),用户作业管理,Step5:利用命令yhrun/yhbat
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