如何使用GeneOntology.ppt
《如何使用GeneOntology.ppt》由会员分享,可在线阅读,更多相关《如何使用GeneOntology.ppt(9页珍藏版)》请在三一文库上搜索。
1、如何使用Gene Ontology,網址:http:/www.geneontology.org/,在首頁的GO website 底下的ontology files 點進去,在GO format 底下四個資料夾 function 、process、comnpent、defs 按右鍵另存新檔下載,二、下載GO 對應的Swiss-Prot,在首頁的GO website 底下的annotations點進去,找到Homo sapiens GO Annotations,按右鍵另存新檔下載,以下是程式使用說明 依照step逐一執行 紅色 表示功能及目的 棕色 表示要執行的程式檔 藍色 表示是輸入的程式檔 藍
2、色 表示是輸出的程式檔,程式使用順序,GO_格式化 Step1:run GO的格式化.cpp(把字元取代成%字元) Input file: 下載下來的process.ontology.txt檔 output file:定為000 Step2 runGO_id 中的go.cpp(擷取2個欄位) Input file: 下載下來的gene_association.goa_human output file: 定為001 Step3:run 刪除多餘的GO.cpp(刪除兩列或多列相同的字串) Input file: 上步驟的 001 output file: 定為002,Step4:run GO_term中的GOid的F&P&C的term.cpp (擷取出term關鍵字和goid關鍵字 ) Input file: 下載下來的component.ontology.txt 裡面的GOID先截取出來,再加上 下載下來的GO.defs檔 output file: 定為003 Step5:run GO_statement中的: GO的功能.cpp (印出Swissprot 和GO的id關鍵字以及%開頭的字串) Input file:用step3的002 以及下載下來的function.ontology output file: 定為004,
- 配套讲稿:
如PPT文件的首页显示word图标,表示该PPT已包含配套word讲稿。双击word图标可打开word文档。
- 特殊限制:
部分文档作品中含有的国旗、国徽等图片,仅作为作品整体效果示例展示,禁止商用。设计者仅对作品中独创性部分享有著作权。
- 关 键 词:
- 如何 使用 GeneOntology
链接地址:https://www.31doc.com/p-2590721.html