酶工程课件整理.doc
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1、第一章 绪论1.酶的概念:具有生物催化功能的生物大分子。2.酶的来源:适宜的细胞,在人工控制条件的生物反应器中生产各种所需的酶。3.主要目标:经过预先设计,通过人工操作,获得人们所需的酶,并通过各种方法使酶发挥其催化功能。4.酶分类可采用4位标码:第一位:属于六大类中的哪一类;第二位:属于该大类中的哪一亚类;第三位:该亚类中的哪一小类:第四位:具体酶在该小类中的序号。5.六大类酶:(1)氧化-还原酶 :氧化-还原酶催化氧化-还原反应。主要包括脱氢酶(dehydrogenase)和氧化酶(Oxidase)。另有过氧化物酶,氧合酶,细胞色素氧化酶等(2)转移酶 :转移酶催化基团转移反应,即将一个底
2、物分子的基团或原子转移到另一个底物的分子上。(3)水解酶 :水解酶催化底物的加水分解反应。主要包括淀粉酶、蛋白酶、核酸酶及脂酶等。(4)裂合酶:它能催化一个分子分成两个或多个分子,当然也可将两个或多个分子变成一个分子。裂合酶催化从底物分子中移去一个基团或原子形成双键的反应及其逆反应。主要包括醛缩酶、水化酶及脱氨酶等。(5)异构酶:异构酶催化各种同分异构体的相互转化,即底物分子内基团或原子的重排过程。与转移酶不同,异构酶催化的是分子内部的基团转移( 注意!)(6)合成酶 :又称为连接酶,能够催化C-C、C-O、C-N 以及C-S 键的形成反应。这类反应必须与ATP分解反应相互偶联。 特点是需要三
3、磷酸腺苷等高能磷酸酯作为结合能源,有的还需要金属离子辅助因子。6.核酸类酶的分类与命名:核酶本身是一种RNA,但它可特异性催化某个反应,特别是识别和剪切RNA的某个位点。据酶催化反应的类型分为:剪切酶、剪接酶、多功能酶据酶催化的底物分为:分子内催化(自我剪切酶、自我剪接酶)、分子间催化(RNA剪切酶、DNA剪切酶、多糖剪接酶、多肽剪切酶、氨基酸酯剪切酶、多功能R酶)7.酶分析 :以酶为分析对象,目的是检测食品、药物体液等生物样品中酶的含量或活性。8.酶分析包括两种类型:一是以酶为分析对象的分析,即一般所说的“酶活力测定”;二是以酶为分析工具或分析试剂的分析,称为“酶法分析”。前者的目的在于检测
4、生物样品中某种酶的含量或活性;后者则主要用于测定与生物学有关样品中酶以外其他物质的含量。(1)原理:都是利用酶的专一性、高效催化反应,通过酶反应速度的测定而检测相应的含量;在方法上也都有一个选择适宜反应条件和测定方法,以获得准确可靠的结果的问题。酶法分析:是一种以酶为分析工具(分析试剂)的分析法,分析的对象可以是底物、辅酶、活化剂、酶抑制剂。主要用于测定与生物样品有关的样品中酶以外其他物质的含量。酶活力:是指酶催化一定化学反应的能力,其大小可用在一定条件下酶所催化的反应初速度。(单位时间底物减少或产物增加).(2)酶活力的测定通常包括两个阶段:首先在一定的条件下,酶与底物反应一段时间,然后再测
5、定反应液中底物或产物的变化量。一般经过如下几个步骤:据酶催化的专一性,选择适宜的底物,并配置成一定浓度的底物溶液;据酶的动力学性质,确定酶催化反应的温度、pH值、底物浓度、激活剂浓度等反应条件;在一定的条件下,将一定的酶液和底物溶液混合均匀,适时记下反应开始的时间;反应到一定的时间,取出适量的反应液,运用各种生化检测技术,测定产物的生成量或底物的减少量。(3)终止酶反应的方法很多,常用的有:反应时间一到,立即取出适量反应液,置于沸水浴中,加热使酶失活加入适宜的酶变性剂,如三氯醋酸等,使酶变性失活加入酸或碱溶液,使反应液的pH值迅速远离催化反应的最适pH值而使反应终止将取出的反应液立即置于低温冰
6、箱或冰粒堆中,使反应液的温度迅速降低至10以下而终止反应。9.有两种酶活力的标准单位P17:开特(kat):是酶活力的国际单位(SI),它规定在特定的体系下,反应速度为每秒转化1mol 底物所需的酶量在两种不同的酶活力单位之间换算:1Kat = 6X 107 U酶的一个活力单位:在该酶的最适条件下,在250C,一分钟内催化1mmol(微摩尔)底物的酶量。 酶活力:是指在一定条件下,酶所催化的反应初速度 比活力:特定条件下,单位重量(mg)蛋白质或RNA所具有的酶活力单位数。是酶纯度的量度,在酶的纯化过程中它的比活力增高,当酶提纯时,其比活力成为极大和恒定的值。酶活力(或总活力)涉及在样品中酶的
7、总单位,而比活力是每毫克蛋白质中酶单位的数量(U/mg) 10.测定酶活力的基本要求:(1)要使反应系统中除待测酶浓度是影响反应速度的唯一限制性因素(反应速度定量酶活力);(2)其余一切均应最适合于酶发挥作用(表现最大能力);11.测定条件选择: (1)底物 种类选择:最适底物a)对于绝对专一的酶无可选择;若相对专一则选Km最小的底物,即所谓最适底物;一般选工作底物;b)要求反应前后有可测定的理化性质变化 c)稳定浓度选择: a) s=100Km; b) 有时不宜采用高底物浓度(有毒性、价高、溶解度小、抑制 酶反应等)则根据具体条件,通过实验选一适当浓度。(2)最适pH a)选择最适pH并维持
8、在这一范围。 b)pH稳定常借助缓冲系统来控制,要求稳定、无干扰、价廉。 C)离子种类和强度。(3) 最适温度 酶反应温度系数为每变化 1 摄氏度,反应速度相差10%以上。所以测酶活力时温度保持恒定十分重要,一般应控制在正负1摄氏度以内。多数哺乳动物的酶,其最适温度为37左右,但有些生物机体的酶适应在极端条件下起催化作用,这些酶称极端酶。 (4)样品对某一待测样品测定前,除了上述因素需考虑外,还要确定样品中有无干扰测定结果的因素(与待测酶作用同一底物或生成同一产物的其它酶)。下面介绍几种常用的测定方法:化学法:是取样法的一种,比较古老,但目前仍普遍使用。一是因为此法不需要特殊仪器,而且几乎所有
9、的酶反应都可以根据产物或底物的化学性质找出具体的有特异性的测定方法。(工作量大、误差大、不够准确)光学法:它是一种连续测定法,是根据底物和产物在某一波长或波段上有明显特征吸收差别而建立起来的方法。(灵敏度高、快速、简便)。光学法又可分为三种:光吸收法;荧光法;旋光测定法。 光吸收法:这是几乎所有氧化还原酶都可采用的方法。许多酶本身不能采用光吸收法,但其产物中有脱氢酶底物,则因此可用酶偶联进行测定。荧光法:其原理是酶反应的底物或产物具有荧光性,用荧光变化速度即可测出反应速度。荧光法的灵敏度比光吸收法高2-3个数量级,特别适于酶或底物量低的分析。但荧光法干扰多,需要校正。 旋光测定法:某些酶反应过
10、程中常伴随有底物或产物旋光性质变化。可用自动旋光仪来测定这类酶的反应。此法准确度、灵敏度不高,不方便,但在没有其它更好的方法时,可考虑采用此法。 电化学法:也是一类连续测定法,其灵敏度和准确度都很高,可和光学法相比;而且测定系统被污染也不会影响结果,主要用电极进行测定,常用的是离子选择性电极和氧电极。气体检测法:主要用于有气体吸收或释放的反应,如氧化酶反应耗气、脱羧酶、脲酶等催化的产气反应。常用瓦氏呼吸仪测定恒定体积内压力变化。此法主要缺点是准确度、灵敏度不高,操作麻烦。放射化学测定法:测定时用同位素标记底物,在酶反应进行中,导致放射性标记产物定量形成,分离产物与底物,进行产物的放射性测定或未
11、反应底物的放射性测定,这样就可测知反应进行的速度或酶的活性。酶偶联分析法:某些酶本身不能应用上述几种方法测定时,则可偶联一个酶反应进行测定。12.酶的转换数与催化周期:酶的转换数(KP),又称摩尔催化活性,是指每个酶分子每分钟催化底物转化的分子数。即每摩尔酶每分钟催化底物转化为产物的摩尔数,是酶催化效率的一个指标,一般酶的转换数103min-1催化周期:转换数的倒数固定化酶的活力测定:振荡测定法、酶柱测定法、连续测定法。固定化酶的概念:与水不溶性载体结合,在一定的空间范围内起催化作用的酶。固定化酶的比活力测定:一般采用每克(g)干固定化酶所具有的酶活力单位数表示。相对酶活力的测定:相对酶活力的
12、高低表明了固定化酶应用价值的大小。(1)酶标免疫分析法:它是将免疫学方法的抗体、抗原专一且定量结合的特点和酶的高效专一催化特点有机地结合在一起建立的一种高度特异、灵敏的分析方法。(2)放射免疫分析:是用放射性同位素标记抗原Ag*,该抗原与未标记抗原Ag竞争结合抗体(Ab)结合位点时的能力相同,所以反应生成的Ag*-Ab复合物与Ag的量呈负相关。Ag*-Ab的生成量可通过测定其放射活性得到,然后根据已知浓度抗原的标准曲线就可以计算出样品中抗原浓度,这种分析方法称为放射免疫分析。酶标免疫测定优点:不需要特殊复杂的设备和仪器;灵敏度高;重复性好;对健康无害(无放射污染)。(3)酶标免疫测定的几个操作
13、问题:酶的要求:专一性强、活性高;在标记测定储存条件下稳定; 测定方法简单、快速、灵敏;纯度高而价廉易得;在被测液中无干扰酶活性测定的因素。酶的标记(1)标记方法:不影响酶活性和免疫活性、操作简便、产量高且稳定;现在最常用的是交联法特别是戊二醛交联法。(2)标记物纯化:酶标反应后必须除去未被标记的抗原或抗体以及未被结合的酶。 (3)免疫活性和酶活性测免疫原的制备 特异性抗体制备 抗体固定定第二章 微生物发酵产酶(1)1.发酵动力学主要研究发酵过程中细胞生长速度、产物生成速度、基质消耗速度以及环境因素对这些速度的影响等。2.细胞在一定条件下培养生长, 其生长过程一般经历调整期、生长期、平衡期和衰
14、退期等4个阶段。 3.根据酶的合成与细胞生长之间的关系,可将酶的生物合成分为3种模式,即生长偶联型同步合成型、中期合成型;部分生长偶联型延续合成型;非生长偶联型 滞后合成型。(1)同步合成型:酶的生物合成与细胞生长同步。特点:酶的合成可以诱导,但不受分解代谢物阻遏和反应产物阻遏。这类酶所对应的mRNA很不稳定。(2)延续合成型:酶的生物合成在细胞的生长阶段开始,在细胞生长进入平衡期后,酶还可以延续合成一段较长时间。特点:可受诱导,一般不受分解代谢物和产物阻遏。所对应的mRNA相当稳定。(3)中期合成型:该类型的酶在细胞生长一段时间以后才开始,而在细胞生长进入平衡期以后,酶的生物合成也随着停止。
15、特点:酶的合成受产物的反馈阻遏或分解代谢物阻遏。 所对应的mRNA是不稳定的。(4)滞后合成型:此类型酶是在细胞生长一段时间或者进入平衡期以后才开始其生物合成并大量积累。又称为非生长偶联型。许多水解酶的生物合成都属于这一类型。特点:受分解代谢物的阻遏作用。所对应的mRNA稳定性高4.影响酶生物合成模式的主要因素1)mRNA的稳定性(好、差) 2)培养基中阻遏物的存在不受阻遏:随着细胞的生长而开始酶的合成。受阻遏:细胞生长一段时间或平衡期后,酶才开始合成。5.细胞生长动力学主要研究细胞生长速度以及外界环境因素对细胞生长速度影响的规律。6.产酶动力学主要研究细胞产酶速率以及各种环境因素对产酶速率的
16、影响规律。7.产酶动力学的研究可以从整个发酵系统着眼,研究群体细胞的产酶速率及其影响因素,这称为宏观产酶动力学或非结构动力学。也可以从细胞内部着眼,研究细胞中酶合成速率及其影响因素,这谓之微观产酶动力学或结构动力学。8.固定化细胞:固定化活细胞、固定化增殖细胞。指采用各种方法固定在载体上,在一定空间范围进行生长、繁殖和新陈代谢的细胞。特点:产酶率提高;可以反复使用或连续使用较长时间;基因工程菌的质粒稳定,不易丢失;发酵稳定性好;缩短发酵周期,提高设备利用率;产品容易分离纯化;适用于胞外酶等胞外产物的生产。9.固定化细胞发酵工艺条件及其控制:(1)固定化细胞的预培养(固定化细胞制备好以后,一般要
17、进行预培养,以利于固定在载体上的细胞生长繁殖。)(2)溶解氧的供给:由于受到载体影响, 氧的供给成为主要的限制性因素。增加溶解氧的方法主要是加大通气量(3)温度的控制(固定化细胞对温度的适应范围较宽,在分批发酵和半连续发酵过程中不难控制 )(4)培养基组分的控制10.固定化细胞生长和产酶动力学:固定在载体上的细胞以一定的速度生长。在达到平衡期以后的相当长的一段时间内,固定化细胞的浓度基本保持恒定。同时,随着细胞的生长和繁殖,有一些细胞泄漏到培养液中,这些泄漏细胞则是游离细胞,它们也在培养液中生长繁殖。 11.固定化微生物原生质体发酵产酶固定化原生质体:是指固定在载体上, 在一定的空间范围内进行
18、生命活动的原生质体。利用固定化原生质体,在生物反应器中进行发酵生产,可以使原来属于胞内产物的胞内酶等,分泌到细胞外,这样就可以不经过细胞破碎和提取工艺直接从发酵液中得到所需的发酵产物。固定化原生质体的特点:变胞内产物为胞外产物;提高酶产率:稳定性较好;易于分离纯化。12.固定化原生质体发酵产酶的工艺条件及其控制在工艺条件控制方面需要注意下列问题:(1)渗透压的控制;(2)防止细胞壁再生; (3)保证原生质体的浓度。第二章 微生物发酵产酶(2)1.优良的产酶微生物(酶产量高、产量稳定性好、易培养和管理、利于酶的分离纯化、安全可靠无毒性)2.酶的生物合成(细胞内RNA和蛋白质的合成过程) (1)R
19、NA的生物合成-转录定义 :以DNA为模板,以核苷三磷酸为底物,在RNA聚合酶(转录酶)的作用下,生成RNA分子的过程。反意义链:指导转录作用的一条DNA链有意义链:无转录功能的一条DNA链.(2)蛋白质的生物合成-翻译 定义 :以mRNA为模板,以氨基酸为底物,在核糖体上通过各种tRNA、酶和辅助因子的作用,合成多肽链的过程过程:氨基酸的活化、 肽链合成的起始、 肽链的延伸、 肽链合成的终止与释放。肽链合成的起始阶段:mRNA与小亚基结合:形成30S-mRNA-IF3复合物。AUG与蛋氨酰-tRNA结合。大小亚基结合。肽链合成的延伸阶段:进位:氨基酰-tRNA进入受位;转肽:形成肽键,在转肽
20、酶作用下,给位与受位结合; 移位:核蛋白体向3端移动一个密码子的位置,空出受位,不断地进位、转肽、移位,使肽链延长。肽链合成的终止阶段:出现终止密码并与终止因子结合;肽键水解,多肽释放;tRNA,mRNA,大小亚基解离.3.酶生物合成的调节:通过调节酶合成的量来控制微生物代谢速度的调节机制,转录水平的调节对酶的生物合成是最重要的调节。意义:通过阻止酶的过量合成,节约生物合成的原料和能量。 4.调节基因:可产生一种阻遏蛋白 (一种变构蛋白),通过与效应物(effector) (包括诱导物和辅阻遏物)的特异结合而发生变构作用,从而改变它与操纵基因的结合力。5.启动基因(启动子)有两个位点:(1)R
21、NA聚合酶的结合位点(2)cAMP-CAP的结合位点。CAP:分解代谢产物基因活化蛋白,又称环腺苷酸受体蛋白。只有cAMP-CRP复合物结合到启动子的位点上,RNA聚合酶才能结合到其在启动子的位点上,酶的合成才能开始。 6.操纵基因:位于启动基因和结构基因之间的一段碱基顺序,能特异性地与调节基因产生的变构蛋白结合,操纵酶合成的时机与速度。7.结构基因:决定某一多肽的DNA模板,与酶有各自的对应关系,其中的遗传信息可转录为mRNA,再翻译为蛋白质8.酶合成调节的类型 (1)诱导 组成酶:细胞固有的酶类。 诱导酶:细胞为适应外来底物或其结构类似物临时合成的一类酶。 (2)阻遏 :分解代谢物阻遏、反
22、馈阻遏 9.酶合成的调节机制酶合成的诱导:加进某种物质,使酶生物合成开始或加速进行。反馈阻遏作用:由某代谢途径末端产物的过量累积引起的阻遏。分解代谢物阻遏:是指某些物质分解代谢的产物阻遏某些酶生物合成的现象。分解代谢物的阻遏作用,并非由于快速利用的甲碳源本身直接作用的结果,而是通过甲碳源(或氮源等)在其分解过程中所产生的中间代谢物所引起的阻遏作用。分解代谢物阻遏现象:葡萄糖效应10.优良产酶菌种应具备的条件:(1)酶产量高 (2)易培养(生长速率高、营养要求低)(3)遗传性能稳定,不易退化(4)易分离提纯(最好是产生胞外酶的菌种)(5)安全可靠(不是致病菌)11.发酵工艺条件及其控制细胞活化:
23、保藏的菌种在用于发酵生产之前,必须接种于新鲜的固体培养基上,在一定的条件下进行培养,使细胞的生命活性得以恢复。(1)培养基的设计原则:1、选择适宜的营养物质 2、营养物的浓度及配比合适3、物理、化学条件适宜 4、经济节约 5、精心设计、试验比较培养基:是人工配制的,适合微生物生长繁殖或产生代谢产物的营养基质。五大要素:碳源、氮源、无机盐、生长因子、水(2)生长因子:指某些微生物不能用普通的碳源、氮源物质进行合成,而必须另加入少量的生长需求的有机物质分类:化学结构分成维生素、氨基酸、嘌呤(或嘧啶)及其衍生物和类脂成分等四类。功能:以辅酶与辅基的形式参与代谢中的酶促反应 (3)实验室的常用培养基:
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