第十章蛋白质的酶促降解和氨基酸代谢.doc
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1、 第十章 蛋白质的酶促降解和氨基酸代谢第一节 蛋白质的酶促降解生物体内的蛋白质是经常处于动态的变化之中,一方面在不断地合成,另一方面又在不断地分解。例如,当种子萌发时,蛋白质发生强烈的水解,将胚乳或子叶中的储藏蛋白质分解,形成氨基酸和其他简单含氮化合物,供幼苗形成组织时用。在植物衰老时,蛋白质的分解亦很强烈,将营养器官的蛋白质分解成含氮化合物,转移到繁殖器官中,供幼胚及种子的形成之所需。蛋白质的分解对机体生命代谢的意义并不亚于蛋白质的合成。植物体为了进行正常的生长和发育,为了适应外界条件的变化,必须经常不断地形成具有不同结构与功能的各种蛋白质。因此,早期合成的蛋白质在完成其功能之后不可避免地要
2、分解,其分解产物将作为合成新性质蛋白质的原料。蛋白质的分解是在蛋白(水解)酶催化下进行的,蛋白水解酶存在于植物所有的细胞与组织中。大量蛋白酶已被人们从植物种子、果实的生长器官中分离出来并进行了研究,如番木瓜汁液中的木瓜蛋白酶,菠萝茎和果实中的菠萝蛋白酶,花生种子中的花生仁蛋白酶,豌豆种子中的豌豆蛋白酶,小麦、大麦、燕麦籽粒中的相应蛋白酶。其中许多酶已制成结晶。蛋白水解酶可分为内肽酶(肽链内切酶)和端肽酶(肽链端解酶)两大类。()蛋白酶的种类和专一性 蛋白酶即内肽酶(endopeptidase),水解蛋白质和多肽链内部的肽键,形成各种短肽。蛋白酶具有底物专一性,不能水解所有肽键,只能对特定图9-
3、1 几种蛋白酶的专一性的肽键发生作用。如木瓜蛋白酶只能作用于由碱性氨基酸以及含脂肪侧链和芳香侧链的氨基酸所形成的肽键。几种蛋白水解酶的专一性见图9-1、表9-1。表9-1 几种蛋白酶作用的专一性酶对R基团的要求作用部位胃蛋白酶R1 ,R1:芳香族氨基酸或其他疏水氨基酸 (NH2端及COOH端)胰凝乳蛋白酶R1:芳香族及其他疏水氨基酸(COOH端)胰蛋白酶R2:碱性氨基酸(COOH端)枯草杆菌蛋白酶木瓜蛋白酶R3:疏水氨基酸(NH2端)碱性氨基酸以及含脂肪侧链和芳香侧链的氨基酸羧肽酶ARm:芳香族氨基酸(COOH端)羧基末端的肽键羧肽酶BRm:碱性氨基酸(COOH端)羧基末端的肽键氨肽酶氨基末端
4、的肽键二肽酶要求相邻两个氨基酸上的-氨基和-羧基同时存在蛋白酶按基催化机理又可分为四类见表9-2。表9-2 蛋白酶的种类编 号名 称作 用 特 征例 子3.4.213.4.223.4.233.4.24丝氨酸蛋白酶类硫醇蛋白酶类羧基(酸性)蛋白酶类金属蛋白酶类活性中心含组氨酸和丝氨酸活性中心含半胱氨酸最适pH值在5以下含有催化活性所必需的金属胰凝乳蛋白酶、胰蛋白酶、凝血酶木瓜蛋白酶、无花果蛋白酶、菠萝蛋白酶胃蛋白酶、凝乳酶枯草杆菌中性蛋白酶、脊椎动物胶原酶表9-2中所列的木瓜蛋白酶、菠萝蛋白酶及无花果蛋白酶的活性中心均含有半胱氨酸,因此能被HCN,H2S、半胱氨酸等还原剂所活化,而被H2O2等氧
5、化剂及重金属离子所抑制。其余蛋白酶存在于大豆、菜豆、大麻、玉米、高粱的种子中。这些酶的性质与广泛分布的动物蛋白酶胰蛋白酶和胃蛋白酶等有很多共同之处。 ()肽酶的种类和专一性 端肽酶又称为肽酶(exopeptidase),从肽链的一端开始水解,将氨基酸一个一个地从多肽链上切下来。肽酶根据其作用性质不同可分为氨肽酶、羧肽酶和二肽酶。氨肽酶从肽链的氨基末端开始水解肽链;羧肽酶从肽链的羧基末端开始水解肽链(见表9-1、图9-1);二肽酶的底物为二肽,将二肽水解成单个氨基酸。肽酶又可分为六类,见表9-3。表9-3 肽酶的种类编 号名 称作 用 特 征反 应3.4.113.4.133.4.143.4.15
6、3.4.163.4.17-氨酰肽水解酶类二肽水解酶类二肽基肽水解酶类肽基二肽水解酶类丝氨酸羧肽酶类金属羧肽酶类作用于肽链的氨基末端(N末端),生成氨基酸水解二肽作用于多肽链的氨基末端(N-末端),生成二肽作用于多肽链的羧基末端(C-末端),生成二肽作用于多肽链的羧基末端生成氨基酸作用于多肽链的羧基末端生成氨基酸氨酰肽H2O氨基酸肽二肽H2O2氨基酸二肽基多肽H2O二肽多肽多肽基二肽H2O多肽二肽肽基-L-氨基酸H2O肽L-氨基酸肽基-L-氨基酸H2O肽L-氨基酸蛋白质的酶促降解 在内肽酶、羧肽酶、氨肽酶与二肽酶的共同作用下,蛋白质水解成蛋白眎、胨、多肽,最后完全分解成氨基酸,即 蛋白质眎、胨、
7、多肽氨基酸这些氨基酸可以转移到蛋白质合成的地方用作合成新蛋白质的原料,也可以经脱氨作用形成氨和有机酸,或参加其他反应。第二节 氨基酸的分解与转化氨基酸的分解反应包括脱氨基作用、脱羧作用与羟基化作用等。一、脱氨基作用高等植物的脱氨基作用在发芽的种子、幼龄植物及正发育的组织中最为强烈。脱氨基作用是氨基酸分解的最重要的一步,包括氧化脱氨基、非氧化脱氨基、转氨基、联合脱氨基、脱酰胺基等作用。()氧化脱氨基(oxidative deamination) 氧化脱氨基是高等植物最基本的脱氨基方式,氨基酸脱去-氨基后转变成相应的酮酸:禾本科、豆科作物幼苗及马铃薯块茎中,主要是二羧基氨基酸(天冬氨酸和谷氨酸)的
8、氧化脱氨。如谷氨酸在谷氨酸脱氢酶的催化下,氧化脱氨生成-酮戊二酸:谷氨酸脱氢酶分布很广,在动植物、微生物中都存在,广泛存在于高等植物的种子、根、胚轴、叶片等组织中。()非氧化脱氨基(nonoxidative deamination) 非氧化脱氨基也包括多种方式。直接脱氨基 是在氨基酸氨基裂解酶和辅助因子磷酸吡哆醛(PLP基)的催化下进行的:天冬氨酸在天冬氨酸氨基裂解酶的催化下,裂解成延胡索酸和氨。脱水酶脱氨基 脱水酶只作用于含有一个羟基的氨基酸,如L-丝氨酸在丝氨酸脱水酶(serine dehydratase)作用下发生脱氨:此酶以磷酸吡哆醛为辅酶,催化丝氨酸脱氨后发生分子内重排,生成丙酮酸。
9、解氨酶可催化氨基酸的非氧化脱氨反应,如苯丙氨酸解氨酶(Phenylalanine ammonia lyase,PAL)催化苯丙氨酸和酪氨酸脱氨:该酶也催化酪氨酸脱氨基并形成对香豆酸反式异构体:在高等植物中存在催化苯丙氨酸和酪氨酸脱氨基形成氨和不饱和芳香酸的酶,如在许多植物中发现有苯丙氨酸解氨酶。()转氨基(脱氨)作用(transamination) 一种-氨基酸的氨基可以转移到-酮酸上,而生成相应的-酮酸和-氨基酸,这种作用叫转氨基作用,也叫氨基移换作用。催化转氨基反应的酶叫转氨酶,其辅酶为磷酸吡哆醛或磷酸吡哆胺。转氨基作用的简式如下:转氨酶的辅酶为磷酸吡哆醛或磷酸吡哆胺,它们起氨基传递体的作
10、用,反应过程如下:转氨酶的种类很多,广泛分布于动植物及微生物中,因此氨基酸的转氨基作用在生物体内是极为普遍的。转氨基作用是氨基酸脱氨的一种主要方式,在氨基酸代谢中占有重要的地位。实验证明,除赖氨酸、苏氨酸外,其余-氨基酸都可参与转氨基作用,并各有其特异的转氨酶。()联合脱氨基作用 生物体内L-氨基酸氧化酶活力不高,而L-谷氨酸脱氢酶的活力很高,转氨酶又普遍存在,因此一般认为L-氨基酸往往不是直接氧化脱去氨基,而是先与-酮戊二酸经转氨作用变为相应的酮酸与谷氨酸,谷氨酸再经谷氨酸脱氢酶作用重新变成-酮戊二酸,同时放出氨。这种脱氨基作用是转氨基作用和氧化脱氨基作用配合进行的,所以叫联合脱氨基作用。其
11、反应式如图9-2。图9-2 联合脱氨基反应示意图()脱酰胺基作用(deamidation)酰胺也可以在脱酰胺酶(deamidase)作用下脱去酰胺基,而生成氨: 二、脱羧基作用()直接脱羧基作用 氨基酸在脱羧酶(decarboxylase)催化下脱去羧基生成胺。通式如下:氨基酸脱羧普遍存在于动植物及微生物组织中,其辅酶为磷酸吡哆醛。二羧基氨基酸主要在-位上脱羧,所生成的产物不是胺,而是另一种新的氨基酸。天冬氨酸脱羧后生成-丙氨酸:谷氨酸脱羧后生成-氨基丁酸:-氨基丁酸与-酮戊二酸进行转氨反应,生成谷氨酸和琥珀酸半醛,后者被氧化成琥珀酸后进入三羧酸循环:色氨酸在脱氨和脱羧后转变成植物生长素(吲哚
12、乙酸):丝氨酸脱羧生成乙醇胺;乙醇胺经甲基化作用生成胆碱:乙醇胺和胆碱分别是脑磷脂和卵磷脂的成分。某些胺的氨基酸前体见表9-4。表9-4 某些胺的氨基酸前体氨 基 酸胺结 构 式丝氨酸缬氨酸异亮氨酸甲硫氨酸赖氨酸鸟氨酸精氨酸苯丙氨酸酪氨酸色氨酸乙醇胺丁 胺异戊胺甲硫基丙胺尸 胺腐 胺精 胺亚精胺苯乙胺酪 胺色 胺 CH2CH2NH2 OH CH2CH2CH2NH2 SCH3 CH2(CH2)3CH2NH2 NH2 CH2(CH2)2CH2NH2 NH2 H2N (CH2)3NH (CH2)4NH (CH2)3NH2 H2N (CH2)4NH (CH2)3NH2这些胺类在植物体内进一步转化所形成
13、的产物都具有一定的生理作用。胺可经氨氧化酶氧化成醛和氨;醛经脱氢酶作用氧化成脂肪酸;脂肪酸经-氧化生成乙酰辅酶A而进入三羧酸循环彻底氧化:()羟化脱羟基作用(hydroxylation)酪氨酸在酪氨酸酶(tyrosinase)催化下发生羟化而生成3,4-二羟苯丙氨酸,简称多巴,后者可脱羧生成3,4-二羟苯乙胺,简称多巴胺:多巴进一步氧化聚合成黑素。马铃薯、苹果、梨等切开后由于形成黑素而变黑。人的表皮及毛囊有形成黑素的细胞,使皮肤及毛发呈黑色;在植物体内,由多巴和多巴胺可以生成生物碱;在动物体内可生成激素去甲肾上腺素和肾上腺素。三、氨基酸分解产物的去向氨基酸经过脱氨、脱羧作用所生成的-酮酸、氨、
14、胺和CO2,将进一步参加代谢或排出体外。()尿素的形成和尿素循环 氨基酸脱氨产生的游离氨,对植物组织是有毒害作用的,因此必须将氨转变为无毒的含氨化合物,以消除氨的毒害。高等植物均具有保留氨并重新利用氨的能力。植物可以通过尿素循环,将游离氨转变为尿素,其反应如下:尿素循环是消除植物体内过量氨毒害的重要途径,也是储备氮的主要形式。尿素循环见图9-3。图9-3 尿素循环当需要时,尿素可经脲酶水解放出氨,以供合成各种含氮化合物:()合成其他含氮化合物 植物可将游离氨转变成氨基酸、酰胺、有机酸铵盐及氨甲酰磷酸等含氮化合物,以消除氨的毒害和储存以备再度利用。如果植物组织中含有足够的碳水化合物,氨可与碳水化
15、合物转化的酮酸进行氨基化反应,重新生成氨基酸。在植物体中,消除氨的毒害作用的途径主要是生成酰胺化合物。天冬酰胺和谷氨酰胺是动植物共有的储氮形式。当体内酮酸增多时,再经转氨作用放出氨,生成氨基酸。有些植物组织中含有大量的有机酸,如秋海棠、酸模、大黄等含有柠檬酸、草酰乙酸、苹果酸等,氨便与有机酸形成有机酸的铵盐。氨与CO2(来自三羧酸循环)在ATP参与下,经酶催化形成氨基甲酰磷酸:氨甲酰磷酸是合成嘧啶、瓜氨酸、精氨酸和尿素的主要代谢物,也是植物和微生物保存氮的重要方式。()氨基酸碳架的氧化 氨基酸脱氨后余下的碳架要进一步转化,最后生成各种有机酸。各种氨基酸的代谢产物列于表9-5中。表9-5 氨基酸
16、代谢的终产物氨 基 酸终 产 物丙氨酸、丝氨酸、半胱氨酸、胱氨酸、甘氨酸、苏氨酸亮氨酸苯丙氨酸、酪氨酸、亮氨酸、赖氨酸、色氨酸甲硫氨酸、异亮氨酸、缬氨酸苯丙氨酸、酪氨酸精氨酸、脯氨酸、组氨酸、谷氨酰胺、谷氨酸天冬氨酸、天冬酰胺 丙酮酸 乙酰辅酶A 乙酰乙酸(或乙酰乙酰-辅酶A) 琥珀酰辅酶A 延胡索酸 -酮戊二酸 草酰乙酸从表9-5中氨基酸分解代谢的终产物可以看出,除乙酰乙酰辅酶A外,均是糖酵解和三羧酸循环的中间产物,而乙酰乙酰辅酶A也可以分解为乙酰辅酶A,所以这些中间产物最后均可通过三羧酸循环而氧化分解,如图9-4所示。()转变成糖和脂类 氨基酸脱氨后的碳架,根据有机体代谢的需要,即可经过三
17、羧酸循环彻底氧化。生成ATP供机体能量的需要,又可以转变成糖和脂肪。凡是形成丙酮酸、-酮戊一酸、琥珀酸、草酰乙酸的氨基酸都称为生糖氨基酸,因为这些有机酸经过转变都能生成葡萄糖。凡能生成乙酰辅酶A和乙酰乙酰辅酶A的氨基酸均能通过乙酰辅酶A转变成脂肪。有些氨基酸(如苯丙氨酸和酪氨酸)既可生成脂肪又可生成糖。图9-4 氨基酸碳骨架进入三羧酸循环的途径第三节 氨及氨基酸的生物合成氮素是组成生物体的重要元素,在生命活动中起重要作用,如蛋白质、核酸和核苷酸、某些激素和维生素、叶绿素和血红素等均含有氮元素。动植物在整个生长发育过程中均进行着氮素代谢。因此,氮素代谢与生物的生命活动过程有着极其密切的关系。一、
18、氮素循环在地球表面的氮分布在大气、陆地和海洋中。空气中含79的分子态氮气(N2)。此外,在空气中还含有微量的气态氮化物,如NO、NO2、NH3等。在陆地和海洋中也含有种类繁多的无机和有机氮化物,包括生物体内的含氮化合物。氮元素可以有多种不同的氧化水平,从3价到5价,如表9-6所示。自然界中的不同氮化物经常发生互相转化,形成一个氮素循环(nitrogen cycle)。大气中的氮气,通过生物固氮、工业固氮、大气固氮(如闪电)而转变为氨或硝酸盐,进入土壤中。土壤中的氨在硝化细菌(包括亚硝酸细菌和硝酸细菌)的作用下,发生硝化作用而氧化为硝酸盐。土壤中的氨和硝酸盐被植物吸收后,用以构成植物体内的蛋白质
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- 第十 蛋白质 降解 氨基酸 代谢
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