植物逆境.ppt
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1、基因芯片在植物逆境研究中的应用,主讲人:高丹 学 号:13090201210003,海南大学,基因芯片,基因芯片,基因芯片(gene chip),又称DNA微阵列(microarray),是由大量DNA或寡核苷酸探针密集排列所形成的探针阵列,其工作的基本原理是通过杂交检测信息。,基因芯片,基因芯片发展历史,基因芯片,6400点的基因芯片 (面积 12X14 mm),基因芯片,Example of an approximately 40,000 probe spotted oligo microarray with enlarged inset to show detail.,基因芯片,其中一类
2、是较长的DNA探针(100mer)芯片 这类芯片的探针往往是PCR的产物,通过点样方法将探针固定在芯片上,主要用于RNA的表达分析。 另一类是短的寡核苷酸探针芯片 其探针长度为25 mer左右,一般通过在片(原位)合成方法得到,这类芯片既可用于RNA的表达监控,也可以用于核酸序列分析。,基因芯片分为两类,基因芯片的原理,任何线状的单链DNA或RNA序列均可被分解为一个序列固定、错落而重叠的寡核苷酸,又称亚序列(subsequence)。例如可把寡核苷酸序列TTAGCTCATATG分解成5个8 nt亚序列:,基因芯片的原理,原理 - 通过杂交检测信息,基因芯片在植物逆境研究中的应用,利用基因芯片
3、研究植物在温度胁迫下的基因表达,利用基因芯片研究植物在温度胁迫下的基因表达,Changes in the steady-state level of transcripts encoding stress response and metabolic proteins and enzymes after different environmental stresses. RNA gel blots were used to assay the steady-state level of selected transcripts during different stresses. RNA is
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