电泳技术刘芸.ppt
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1、第七章 电泳技术 Electrophoresis,分析测试中心 刘芸,1,内容提纲,纸电泳 凝胶电泳 等电聚焦电泳 双向电泳电泳技术(DIGE) 毛细管技术,2,一、定义,电泳:带电粒子在直流电场中向着与其本身所带电荷电性相反的电极移动的现象。 电泳技术:生物样品在电泳过程中因各组分的移动快慢不同而被分离的技术。利用电泳现象进行物质分离的技术。,第一节 电泳技术概论,3,4,二、电泳分析技术发展概况,1809年 发现电泳现象 1937年 Tiselius 自由界面电泳 1948年 Wieland 滤纸电泳 1959年 聚丙烯酰胺凝胶电泳 1980s 毛细管电泳 (capiliary elect
2、rophoresis),Arne Wilhelm Kaurin Tiselius 蒂塞利乌斯(瑞典人)因研究电泳和吸附分析,特别是发现关于血清蛋白的复杂本质而获奖,1948,5,三、电泳分析技术的分类,1. 根据被分离样品的量多少 分析电泳 制备电泳 2. 根据电泳电压的高低 常压电泳 100500 V 高压电泳 50010kV,6,滤纸及其他纤维薄膜电泳,如醋酸纤维素、玻璃纤维、聚氯乙烯纤维 凝胶电泳,如琼脂、琼脂糖、硅胶、淀粉胶、聚丙烯酰胺凝胶电泳 粉末电泳,如纤维素粉、淀粉、玻璃粉电泳 丝状电泳,如尼龙丝、人造丝电泳,3. 根据电泳中是否使用支持物,自由电泳不使用支持物,在溶液中进行。
3、区带电泳使用支持物,(1) 按支持物的物理性状不同,可分为,7,(2) 按支持物的装置形式不同,可分为 平板式电泳 垂直板式电泳 垂直柱式电泳,8,9,10,11,12,13,14,连续pH电泳指电泳过程中pH保持不变,如滤纸电泳、醋纤膜电泳。 不连续pH电泳指电极缓冲液和电泳支持物的不同区段有不同的pH,如 PAGE、IFE。 优点:在不同 pH区之间形成高的电位梯度区,使蛋白质移动加速压缩为一极狭的区带而达到浓缩的目的。,4. 根据电泳系统pH是否连续,可分为,15,四、电泳技术的特点,凡是带电物质均可应用某一电泳技术进行分 离,并可进行定性或定量分析; 样品用量极少; 设备简单; 可在常
4、温进行; 操作简便省时; 分辨率高.,16,五、电泳技术应用,临床诊断 进行血清蛋白、血红蛋白、精蛋白、脂蛋白的分离、鉴定和含量测定以及血清学酶的检验、免疫化学检验等。 工业制造 用于提纯酶、激素及其它生化产品 基础理论研究,从分离与分析无机离子到复杂的生物高分子化合物,以及在放射化学和免疫化学中都占有重要的地位;在各类电泳技术中,尤以凝胶电泳在分离分析酶、蛋白质、核酸等生物大分子等方面分辨力为最高,为生物化学,分子生物学的发展作出了重大贡献。,17,六、电泳的基本原理,悬浮或溶解在电解质溶液中的带电粒子,在电场作用下以不同的速度向着与自身所带电荷极性相反的电极移动。在电泳过程中,带正电荷的粒
5、子向电场的负极方向移动,带负电荷的粒子向电场的正极方向移动。移动的带电粒子受到电场力和周围介质阻力的作用,当二力平衡时,粒子以稳定的速度向电极方向移动。由于电荷、质量等的差异,粒子将会有不同的质/荷比,使其在电场中具有不同的迁移速度。,18,以蛋白质分子为例:,19,V q M = = E 6r,迁移率(Mobility) 带电颗粒在单位电场强度下的泳动速度。,20,七、影响电泳速度的因素,1. 电场强度(E),E电流热效应支持介质上的水分蒸发样品的热变性 E电泳速度慢延长电泳时间样品扩散区带模糊不清分辨率下降,常压电泳 100500 V 1V/cm10V/cm 高压电泳 50010kV 20
6、V/cm200V/cm,21,溶液的I 越高,质点的泳动速度越慢,但区带分离度却较清晰。 I缓冲能力越大缓冲液所载的分电流增加,而样品所载的电流相应减少电泳速度减慢,2. 离子强度(I),(m:离子的摩尔浓度,Z:离子的价数),对于稀溶液:,22,pH值决定了化合物解离的程度,也决定了物质所带的净电荷。,3. 缓冲液的pH,23,氨基酸的两性解离性质及等电点(pI),NH2,(pK1),(pK2),等电点 (isoelctric point):当氨基酸溶液在某一定pH值时,使某特定氨基酸分子上所带正负电荷相等,成为两性离子,在电场中既不向阳极也不向阴极移动,此时溶液的pH值。,24,- + +
7、(液)- 负极 正极,4. 电渗效应,电渗(electro-osmosis)指在电场作用下液体相对于固体支持物的相对移动。,25,5. 分子筛,在凝胶电泳中,分离蛋白质等物质除了利用所带电荷的差异的效应外,还利用了其分子量的不同及形状不同。,6. 温度,电泳时电流通过支持介质会产生热量。按焦耳定律,电流通过导体时的产热与电流强度的平方、导体的电阻和通电的时间成正比(Q=I2Rt),26,第二节 常用电泳技术,(一)纸电泳,滤纸电泳 (paper electrophoresis)是指用滤纸作为支持载体的电泳方法。,滤纸水平地架设在支持板上。把样品以带状加在作为支持体的滤纸内来检测其移动和分离的方
8、法。最初用于蛋白质,后来也用于氨基酸、核苷酸一些低分子物质,其优点在于或采用滤纸与色素结合的直接电泳图,或剪下滤纸的任何部分来抽提其中的物质。,27,薄膜电泳(衍生),支持体:薄膜 优点: 1.吸附作用小;2.电渗作用小;3. 需加样量少;4. 亲水性小 应用:广泛应用于蛋白质和同工酶等的分离分析,Magnification of Cellulose Acetate filter,28,支持物:多孔凝胶。如聚丙烯酰胺凝胶、琼脂糖凝胶等,具有电泳和分子筛的双重作用,分辨力高。,(二)凝胶电泳,凝胶电泳 (agarose gel electrophoresis)是指用凝胶物质作为支持载体的电泳方法
9、。,最常用聚丙烯酰胺凝胶和琼脂糖凝胶电泳 原因:机械强度好,透明有弹性,稳定,无吸附作用和电渗作用,可制成不同孔径的凝胶。 分类:垂直管型盘状电泳、垂直板型电泳; 连续、不连续、梯度、SDS凝胶电泳,32,33,SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE),十二烷基硫酸钠-聚丙稀酰胺凝胶电泳不受蛋白质原有电荷影响,主要取决于蛋白质及其亚基分子量大小的方法,可对蛋白质的组分进行分离,并可精确测得蛋白质的分子量。,34,基本原理 SDS 即十二烷基硫酸钠,是一种阴离子去污剂,它能破坏蛋白质分子之间以及其它物质分子之间的非共价键 。在强还原剂如巯基乙醇或二硫苏糖醇的存在下,蛋白质分子内的二硫键被打开
10、并解聚成多肽链。解聚后的蛋白质分子与SDS充分结合形成带负电荷的蛋白质-SDS复合物,复合物所带的负电荷大大超过了蛋白质分子原有的电荷量,这就消除了不同蛋白质分子之间原有的电荷差异。,SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE),35,SDS-PAGE是一个不连续系统,由上层浓缩胶和下层的分离胶组成。 浓缩胶(pH6. 8,孔径大)主要作用是使样品浓缩,使样品在未进入分离胶前,被浓缩成很窄的条带,从而提高分离效果。 分离胶(pH8. 8,孔径小) 通过分子筛效应和电荷效应,把 样品中的各组分按分子量和电荷 的大小而分开。,SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE),36,SDS聚丙烯酰胺凝胶
11、电泳(SDS-PAGE),37,PAGE( polyacrylamide gel electrophoresis )即聚丙稀酰胺是由丙稀酰胺和N,N-亚甲基双丙稀酰胺共聚合而成。此聚合过程是由四甲基乙二胺(TEMED)和过硫酸胺(AP)激发的。,SDS-PAGE的有效分离范围,SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE),38,考马斯亮染色 银盐染色,SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE),39,琼脂糖凝胶电泳(Agarose gel electrophoresis),琼脂糖Agarose,缩写为AG,是琼脂中不带电荷的中性组成成份,也译为琼胶素或琼胶糖。是一种天然的线状高分子,是从琼脂
12、中分离制备的链状多糖,其结构单元是 D-半乳糖 和3 , 6- 脱水-L 半乳糖。一般情况下,它的结构是稳定的,可以在许多条件下使用(如水,pH4-9范围内的盐溶液)。琼脂糖凝胶在40以上开始融化,也不能高压消毒,可用化学灭菌处理。,40,琼脂糖凝胶是依靠糖链之间的次级链如氢键来维持网状结构,网状结构的疏密依靠琼脂糖的浓度。,琼脂糖凝胶电泳(Agarose gel electrophoresis),这类载体能使被筛分的物质保持活性,并能迅速活化并接上各功能基团,架构疏松,孔径大,是一种很好的电泳凝胶,刚性比聚丙烯酰胺大。,41,(一)优点 1.因不含硫酸根和羧基,几乎消除了琼脂的电渗 2.对蛋
13、白质吸附极微,故无拖尾现象。 3.凝胶结构均匀,孔径较大,可用来分离酶的复合物、核酸、 病毒等大分子物质。 4.透明度较好,可直接或干燥成薄膜后进行染色。 5.不吸收紫外光,可直接利用紫外光吸收法作定量测定 6.有热可逆性,琼脂糖凝胶电泳(Agarose gel electrophoresis),42,(二)缺点 1. 机械强度差,易破碎,浓度不能太低。 2. 易被细菌污染,不易保存,临用前配制。 3. 琼脂糖支持层上的区带易于扩散,电泳后必须立即固定染色。,琼脂糖凝胶电泳(Agarose gel electrophoresis),(三)应用,1. 适用于大分子的核酸、核蛋白等的分离、鉴定及纯
14、化 2. 临床生化检验中常用于LDH、CK等同工酶的分离与检测 3. 为不同类型的高脂蛋白血症、冠心病等提供生化指标,43,基本原理 pH为8.38.0时,核酸分子碱基几乎不解离,磷酸全部解离,核酸分子带负电,在电泳时向正极移动。采用适当浓度的凝胶介质作为电泳支持物,在分子筛的作用下,使得分子大小和构象不同的核酸分子泳动率出现较大差异,从而达到分离核酸片段检测其大小的目的。,例:琼脂糖凝胶电泳分离核酸,51,基本操作步骤:,例:琼脂糖凝胶电泳分离核酸,52,常用仪器设备,例:琼脂糖凝胶电泳分离核酸,53,常用仪器设备,例:琼脂糖凝胶电泳分离核酸,54,(三)等电聚焦电泳,等电聚焦电泳(isoe
15、lectric focusing electrophoresis,IEF) 是指电泳系统中加进两性电解质载体,当通以直流电时,两性电解质载体即形成一个由阳极到阴极连续增高的pH梯度。样品(蛋白质等)进入时,不同的蛋白质移动到与其等电点相当的pH位置上,从而使不同等电点的蛋白质得以分离。,55,优点:分辨率高,区带清晰、窄,加样部位自由,重现性好,可测定蛋白质或多肽的等电点。 缺点:需无盐溶液,不适用于在等电点不溶解或发生变性的蛋白质。,等电聚焦电泳的特点,56,等电聚焦电泳的基本原理,蛋白质具有许多可解离的酸性基团(COOH)和碱性基团(NH2)及其它基团,在一定溶液的pH条件下可解离成带正电
16、荷或负电荷的基团。 当蛋白质溶液处于某一pH时,蛋白质解离成正、负离子的趋势相等,成为兼性离子,净电位为零,此时溶液的pH称为蛋白质的等电点。,蛋白质分子在不同pH下的解离状态,57,等电聚焦电泳的基本原理,在电泳介质中放入载体两性电解质,当通入直流电时,两性电解质形成一个由正极到负极逐渐增加的pH梯度,正极附近是低pH区,负极附近是高pH区。,没通电时的变化,引入电场时的变化,电泳结束后的变化,58,+ pI1 pI2 pH=pI pI3 pIn - a b c 蛋白质分子在负极端 蛋白质分子在正极端 蛋白质样品中各组分聚焦成区带,在这个从正极到负极pH逐渐增加的直流电场中,当蛋白质进入这个
17、环境,不同的蛋白质带上不同性质和数量的电荷,向着一定方向移动,迁移到与其相同的等电点位置上停留下来,即被聚焦于一个狭的区带中 ,得以分离。,等电聚焦电泳的基本原理,59, 有一个在电泳条件下基本稳定、重复性良好的pH梯度 有一个抗对流的电泳材料,使已经分离的样品不再重新混合 电泳后有适当的方法来鉴定分离的区带,进行等电聚焦电泳必须具备三个条件:,60,Bio-Lyte 两性电解质,在测定未知蛋白时,可先采用pH3-10的载体,经初步测定后改用较窄的以提高分辨率。,等电聚焦电泳pH梯度的选择:,61,(四)双向电泳,双向电泳(two - dimensional electrophoresis,2
18、-DE)的广义定义是将样品进行电泳后针对不同目的在它的直角方向再进行一次电泳。目前双向电泳大多是指第一向为等电聚焦,第二向为SDS-PAGE电泳。,62,DNA RNA 蛋白质,3个层次的调控,转录水平调控,翻译水平调控,翻译后水平调控,蛋白质存在复杂的翻译后修饰,作为生命功能的行使者,它比基因更能直接地反映生理过程及其变化。蛋白质相互作用及空间构向等问题是生命现象复杂性的真实体现。,背景知识,(四)双向电泳,63,随着人类基因组计划重点由结构基因组到功能基因组的转移,生命科学开始进入后基因组时代。 研究基因终产物及生命活动直接功能执行者蛋白质的科学-蛋白质组学(Proteomics)应运而生
19、。,背景知识,(四)双向电泳,64,蛋白质组最早是由澳大利亚Macquarie 大学的Wilkins和 Williams在1994年的意大利举办的双向电泳会议上首次提出来的。,背景知识,(四)双向电泳,Proteome一词由“蛋白质(PROTEin)”与“基因组(genOME)”杂合而成,对于“基因组学(Genomics)”,“蛋白质组学”定义为一个基因组所表达的全套蛋白质。由Proteome进一步派生出Proteomics。,65,蛋白质组学概念:是通过大规模研究蛋白质的表达水平的变化、翻译后修饰、蛋白质与蛋白质之间的相互作用,以获取蛋白质水平上疾病变化、细胞进程及蛋白质网络相互作用的整体综
20、合信息的科学研究。,背景知识,(四)双向电泳,66,(四)双向电泳,蛋白质组分析的首要要求,将来自于全细胞、组织或生物体中所包含的多达几千种混合蛋白质进行分离、检测和分析。 2-DE技术依然是大多数蛋白质组研究中分离复杂蛋白质混合物的首选技术。,67,生物学问题的提出,实验模型的设计,实验组和对照组样品的制备,蛋白样品的IEF和PAGE电泳分离,图像扫描和初步分析,感兴趣蛋白点的切取,胰酶对脱色后蛋白质的消化,质谱的多肽指纹图、微测序分析,质谱结果的生物信息学分析和比对,新蛋白质的发现,其它实验的进一步验证,蛋白信息的初步获得,68,(四)双向电泳,69,IPGphor IEF Unit,DA
21、LT Six Unit,(四)双向电泳,70,双向电泳法是OFarrall和Klose分别在1975年根据不同组份之间的等电点差异和分子量差异建立的。 1. 第一向等电聚焦:IEF是根据蛋白质的等电点(pI)的不同而将他们分离的一种电泳技术。蛋白质在环境pH 值低于pI 时带正电,高于pI 值时带负电。在加上电压的情况下,蛋白质会向其最稳定的状态即等电点位置移动。,双向电泳的基本原理,71,2. 第二向SDS-PAGE:SDS PAGE是根据蛋白和多肽的分子量大小将其分离的。它是在含有十二烷基硫酸钠(SDS)的聚丙烯酰胺凝胶中进行的。由于SDS 掩蔽了蛋白本身所带的电荷,同时形成了阴离子复合物
22、,使单位质量的蛋白带有大约相等的阴离子电荷。,双向电泳的基本原理,72,等电聚焦流程图,水化,加样,聚焦参数设置,(四)双向电泳,73,第二向SDS-PAGE,SDS-PAGE 电泳由四步骤组成: 1) 灌胶 2) 在SDS 平衡缓冲液中平衡胶条 3) 将平衡好的胶条放置在SDS 凝胶上 4)第二向电泳系统的准备并进行电泳,(四)双向电泳,74,样品制备原则,样品制备是双向电泳中最关键的一步,质量的好坏将直接影响2-DE结果。尽管处理方法多种多样,但都遵循几个基本的原则:,1)尽可能的提高样品蛋白的溶解度,抽提最大量的总蛋白,减少蛋白质的损失; 2)减少对蛋白质的人为修饰; 3)破坏蛋白质与其
23、他生物大分子的相互作用,并使蛋白质处于完全变性状态。,75,样品制备需要的试剂,样品制备需要四种主要的试剂: 1. 离液剂:主要包括尿素和硫脲; 2. 表面活性剂,也称去垢剂:早期常使用NP-40、TritonX-100等非离子去垢剂,近几年较多的改用如CHAPS等双性离子去垢剂; 3. 还原剂最常用的是二硫苏糖醇(DTT),也有用二硫赤藓糖醇(DTE)以及磷酸三丁酯(TBP) 4. 其它:可以选择性的加入Tris-base,蛋白酶抑制剂(如EDTA、PMSF 或 Protease inhibitor cocktails)以及核酸酶。,76,一般样品处理过程,1. 细胞破碎、避免蛋白水解、样本
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