《微生物学教学课件》第十章微生物分类和鉴定.ppt
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1、第十章 微生物的分类和鉴定,第一节 通用分类单元 第二节 微生物在生物界的地位 第三节 微生物分类鉴定的方法,微生物分类学(Microbial taxonomy)是一门按微生物的亲缘关系,把其安排成条理清楚的各种各类单元或分类群的科学,包括分类(Classification)、鉴定(Identification)、命名(Nomenclature),第一节 通用分类单元,一 种以上的系统分类单元 二 学名 三 亚种以下的几个分类名词,一、种以上的系统分类单元 (一) 七级分类单元: 界(Kingdom)、门(Phylum)、纲(Class)、目(Order)、科(Family)、属(Genus)
2、、种(Species) (二)种的概念: 具体的种应具有相同的祖先和相同或相似的形态、生理特征,在特定的环境条件下具有相对的稳定性和一定范围内的变异性。 一个种只能用该种中的一个典型菌株作为具体代表,称为模式种或是模式标本,群:grow series E.Scherichia coli 与 Aerobacter 归为Coliform group 。两种以上及其过渡类型分归为一个群(一组具有相同性状的生物) 变种(Variety) : 发生变化了的种称为变种,具有典型的不同特征,且可以稳定遗传。 如Bacillus Subtilis Var asporous,二、学名 (一) 微生物通常采用双命
3、名法。 学名有属名和种名加词构成,用斜体表示。属名在前,而且第一个字母大写,种名在后,全部小写。学名可以附上首个命名者的名字、现名定名人和现名的定名时间。 学名=属名+种名加词+首次定名人+现名定名人+现名定名年份,如:Staphylococcus aureus Rosenbach 1884 (金黄色葡萄球菌 ) Escherichia coli(Migula) Castellani et Chalmers 1919(大肠埃希氏菌) Clostridium acetobutylicum Mccoy,Fred,Peterson et Hastings 1926(丙酮丁醇梭菌),(二)三名法 当某
4、微生物是一个亚种(subspecies 简称“subsp”)或变种(variety 简称“var”)时,学名就应按三名法拼写。 学名=属名+种名加词+ subsp(var)+亚种(变种)的加词 如:Bacillus thuringiensis ( subsp)galleria(苏云金芽孢杆菌醋螟亚种) Saccharomyces cerevisiae (var)ellipsoideus(酿酒酵母椭圆变种),三、亚种以下的几个分类名词,亚种:指除某一明显稳定的特征外,其余鉴定特征都与模式种相同的种。 变种:亚种的同义词。 型:曾用做菌株的同义词,仅用做若干型的后缀,如生物变异型、形态变异型、致病
5、变异型及血清变异型等 菌株:又称品系,表示任何由一个独立分离的单细胞繁殖而成的纯遗传型群体及其一切后代。,第二节 微生物在生物界的地位,一 生物的界级分类学说 二 三域学说及其发展,一 生物的界级分类学说 两界系统:植物界和动物界 三界系统:增加第三界原生生物界 四界系统:植物界、动物界、原始生物界(原生动物、真菌、部分藻类等)及菌界(细菌、蓝细菌等) 三总界五界系统,五界系统:包括动物界、植物界、原生生物界(原生动物、单细胞藻类及粘菌等)、真菌界和原核生物界。,纵向显示从原核生物向真核单细胞生物再向真核多细胞生物的三个近化阶段; 横向则显示光合式营养、吸收营养和摄食营养三大进化方向。,六界系
6、统 后生动物界、后生植物界、真菌界、原生生物界、原核生物界和病毒界等,二 三域学说及其发展,三个域指的是细菌域、古生菌域和真核生物域等,第四节 微生物分类鉴定的方法,一 微生物分类鉴定中的经典方法 二 微生物分类鉴定中的现代方法,一 微生物分类鉴定中的经典方法 一)经典的微生物鉴定指标 1、形态特征: 1)群体形态特征:菌落的形态、在半固体培养基或液体培养基中的生长状态。 2)个体特征: 显微镜观察其形态或是染色后再观察,包括细胞形状、大小、排列形式、运动性、特殊构造和染色反应等。,2、生理生化特征:,1)对营养的要求:如能源、碳源、氮源、生长因子等的要求。 2)代谢反应(酶):水解大分子的能
7、力(淀粉、油脂、明胶等)、分解糖或醇类产酸和产气、硝酸盐还原试验等。 3)代谢产物:包括产物的种类和数量等,通过颜色和显色反应等检测。 4)抗逆性试验:对包括温度、pH、药物等的抗性。,3、生态特征:微生物与溶解氧的关系、对温度、渗透压、盐度及pH等的要求、与其他生物之间的相互关系等。 4、生活史:繁殖方式、生长周期等 5、抗原特征:通过血清学反应检测。 6、对噬菌体的敏感性 7、其他:氨基酸顺序 蛋白质分析 细胞壁等细胞成分分析,生理生化特征,在以实用为主要目的表型分类中,生理生化特征往往是细菌分类鉴 定的主要特征。肠道菌科细菌属和种的分类鉴定就是如此。,肠杆菌,柠檬酸杆菌,沙门氏菌,志贺氏
8、菌,二 )微生物的微型、简便、快速或自动化鉴定技术。 1 API细菌数值鉴定系统:同时鉴定20项以上生化指标,因而可用作为快速鉴定细菌。 一种长形卡片,其上整齐地排列着20个小塑料管,其中加有适量糖类等生化反应底物的干粉和反应产物的显色剂。,API 细菌数值鉴定系统,适用于API鉴定细菌有700多种,菌悬液,菌种,基本培养基 (液体),检测、编码、查表、鉴定,2 Enterotube系统 又称肠管系统。一种用一条有812个分隔小室的划艇形塑料管制成,面上有塑料膜覆盖,可防止杂菌污染。每个小室中装有鉴定不同生化反应的固体培养基,通过将小室中的金属丝接触菌落,从对侧将金属丝拉出以接种。,3 Bio
9、log全自动和手动细菌鉴定系统 适用于动植物检疫,临床和兽医的检验,食品、饮用水卫生的监控、药物生产等。 关键部件为一块有96孔的细菌培养板,其中95孔中各加有氧化还原指示剂和不同的发酵性碳源的培养基干粉,另一孔为清水对照。鉴定前,将待检纯种微生物制成适当浓度的悬液,接种于96孔中,于37培养424h,将培养板放进检查室用分光光度计检测,再通过计算机统计即可计算该菌株属于何种微生物。,Biolog全自动或手动细菌鉴定系统,在96孔的细菌培养板上检测微生物对不同发酵性碳源利用情况进行的分类鉴定。,可鉴定细菌有1140多种、酵母菌267种、目前已经可用于丝状真菌。,每个孔中含有不同的底物,菌悬液或
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