统计应用软体StatisticalComputationsandAnalysis000002.ppt
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1、統計應用軟體 Statistical Computations and Analysis,台大農藝系生物統計組 劉力瑜,課程大剛,授課對象: 大三以上及研究生 先修科目: 生物統計學(或統計學)與試驗設計學 課程首頁: http:/homepage.ntu.edu.tw/lyliu/compstat/index.html 評分標準: (Mostly weekly) homework (40%) Midterm (30%) Final project (30%),授課教師,劉力瑜 TEL: 02-33664792 E-mail: lyliuntu.edu.tw Office: 五號館 (生工系館
2、) 二樓 202 室 Office Hour: Monday through Friday 12AM-1PM,注意事項,指定作業必須在規定日期當天下課前繳交, 逾期除依校規請假 (國立臺灣大學學生請假辦法), 一律不予接受, 該次作業則以零分計算。 作業與報告用 LaTEX 打字佔成績之 50% 兩次最低分的作業將不列入總成績計算,相關規定,http:/homepage.ntu.edu.tw/lyliu/compstat/syllabus.html,上課前的準備,前往課程網頁下載當天上課之powerpoint檔 http:/homepage.ntu.edu.tw/lyliu/compstat/
3、handout.html 隨時查閱課程網站以獲知最新公告訊息,學長姐的建議,“我未上過試驗設計, 這方面完全不懂, 學期後半段上起來很吃力” “很後悔沒有善加利用老師的 office hour” “統計與程式必需要多加練習才會熟練, 希望交作業的次數可以多一點”,課程內容,Installation / Introduction to R Installation / Introduction to LaTeX / cwTeX Writing Report with LaTeX Basic Statistical Concepts Probability and Distributions De
4、scriptive Statistics and Graphics Hypotheses Testing Tests for Central Tendency Tests for Dispersion,Analysis of Variance Post Hoc Tests Variable Transformation Completely Randomized Design (CRD) Randomized Complete Block Design (RCBD) Latin Square Design (LSD) Cross-Over Design Balanced Incomplete
5、Block Design (BIBD) Nonparametric Methods,Introduction to R,What is R?,R 並非專用統計軟體, 而是可用來執行統計分析的環境: 匯入適當的 package (套件) 應用套件內提供之 function (函式) Packages 由許多熱心人士編寫並免費提供學術使用。 You can make your own contribution in the future.,R的優缺點,優點: 免費軟體 完善的說明文件與討論區 漂亮的圖型介面 程式容易根據使用者需求做修改 缺點: 並無 user friendly 之使用者介面 需詳
6、知函式名稱與程式編寫邏輯 說明文件與討論區使用英文,下載與安裝,Step 1: 下載R程式 http:/cran.csie.ntu.edu.tw/bin/windows/base/ 下載目前最新版本 R-2.4.1-win32.exe,執行,Step 2: 執行 R-2.4.1-win32.exe 安裝完成後, 執行桌面上的截徑:,中文版本,如何切換至英文版本?,Step 1: 在R的截徑上按滑鼠右鍵, 選取“內容” 。,如何切換至英文版本?,Step 2: “目標” 欄位最後(雙引號之後)加入: LANGUAGE=en 再按“確定” 。,離開 R,Method 1: File - Exit
7、Method 2: q() Method 3: R 視窗上方,起始套件,當 R 啟動時, 有 7 個常用之 packages 會自動載入: base: 基本函式 (IO, 敘述統計, etc.) stats: 常用統計分析 (t.test, anova, etc.) methods: 定義 classes of objects utils: 基本程式編寫工具 graphics: 基本繪圖工具 grDevices:基本繪圖介面 datasets: 數據範例,使用介面 File 檔案,匯入已存在的檔案 (不開啟編輯視窗),編輯新程式或文件,編輯已存在的程式或文件,顯示已存在的檔案內容(無法編輯),
8、變更工作環境 預設: “C:/Program Files/R/R-2.4.1“, Example: 0302_File_example.r,使用介面 Edit 編輯,清除工作視窗畫面,使用介面 Misc 其它,中斷正在執行的工作 (ESC),立即顯示結果與否,顯示工作環境下的物件; ls( ),移除工作環境下的物件; rm(list=ls(all=T) ),使用介面 - Packages,在目前工作環境中載入套件library(package),設定下載 package 的網站(Taipei, etc.),設定下載 package 的搜尋範圍 (cran, etc.),package 網路安裝
9、,package 本機安裝(已下載),package 更新 (已安裝之package),使用介面 Windows / Help,Windows: 視窗排列方式 Help: Getting help from R ?command and help(command): 查詢特定命令 (名稱已知且package已載入) 的使用 apropos(“keyword ”): 已載入 package 中含有keyword字串的所有函數 Search help: 查詢未知名稱的命令(package未載入但已安裝) help.search(“keyword ”) search.r-project.org: 廣
10、義搜尋,R Console,R 的提示符號: 與 +,“” 為提示符號; 當提示符號出現時表示R正在待命中, 可以隨時鍵入下一個命令。當提示符號為“+”時, 表示程式正在執行中,或在等待未完成的指令。例如: (1.36 + 0.7 + ) 按“ESC”可強制退出未完成的工作。 可利用鍵盤上下鍵重複輸入指令或做小幅度修改,利用R進行簡單計算, 2 + 3 1 5 sqrt(3/4)/(1/3-2/pi2) 1 6.626513 exp(3.72) 1 41.26439 sin(pi); log(10); log2(10); log10(10),指定變數名稱,名稱 = 物件 或 名稱 物件 可由英
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