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1、中国生物医学文献数据库 (Chinese BioMedical Literature Database)简称(CBM),一、概述,中国生物医学文献数据库(CBMdisc)是中国医学科学院医学信息研究所开发研制的综合性医学文献数据库。该数据库收录1978年以来1600多种中国生物医学期刊、汇编和学术会议论文的文献题录,年报道量约40余万篇,总计350余万篇。该库涵盖了中文科技资料目录-医药卫生、中文生物医学期刊文献数据库(CMCC)中收录的所有文献题录。自1995年起,70%的文献带有文摘。文献内容涉及基础医学、临床医学、预防医学、药学、中医学及中药学等生物医学各个领域。,中国生物医学文献数据库
2、的全部题录均根据美国国立医学图书馆的医学主题词表(即MeSH词表),以及中国中医研究院图书情报研究所出版的中医药学主题词表进行了主题标引,并根据中国图书馆分类法医学专业分类表第四版R类进行了分类标引。,二、数据库结构与著录项目,CBMdisc数据库2007年有11个文档: CBMdisc07(2007.012007.8) CBMdisc06(2006.012006.12) CBMdisc05(2005.012005.12) CBMdisc04(2004.012004.12) CBMdisc03(2003.012003.12) CBMdisc02(2002.012002.12) CBMdisc0
3、1(2001.012001.12) CBMdisc2K(2000.012000.12) CBMdisc99(1998.011999.12) CBMdisc97(1995.011997.12) CBMdisc94(1978.011994.12),CBMdisc数据库的记录包括30多个可检索数据项,包括中文题目、英文题目、著者、第一著者、著者单位、期刊、核心期刊、出版年卷期、参考文献、资助类别、关键词、主题词、特征词、分类号等。,下面列出的是部分数据项(字段)的英文、中文检索标识符,以及注释:,CL 分类号 TI 中文题目 TT 英文题目 AU 著者 AD 地址 (第一著者地址) AB 文摘 IS
4、 ISSN (国际期刊代码) (SO) 出处 (复合字段:TA,PY,VI,IP,PG) MH 主题词 (MMH) MMH (主要概念主题词) TW 关键词,图A CBMWeb题录著录详细格式界面,三、检索功能、途径与方法(CBMwin4.0),(一)检索功能 1兼容性好 2词表辅助检索功能 3检索入口多 4检索功能完备 5全文获取,(二)检索途径与方法,1基本检索 2主题词检索 3分类检索 4期刊检索 5作者检索 6索引检索 7定题检索,四、检索结果的显示与输出,1显示结果 2输出与保存 3打印,五、CBMdisc检索实例分析,例(一)卡托普利治疗老年人高血压(检索年限:19782006.7
5、)见图37、图38、图39。 序号 命中文献数 检索表达式 #1 4359 卡托普利扩展全部树/全副主题词 #2 47870 高血压扩展全部树/ 全部副主题词 #3 1270 #1 AND #2 #4 174 #3限定老年人;人类 #5 92746 老年人 #6 180 #3 AND #5 #7 88678 CT:老年人 #8 175 #3 AND #7 #9 180 #4 OR #6 OR #8 #10 1660 卡托普利 AND 高血压 #11 210 卡托普利 AND 高血压 AND 老年人,图37 CBMWeb例(一)检索策略,图38 CBMWeb例(一)检索结果显示界面,图39 CB
6、MWeb例(一)检索结果全文显示界面,例(二)造血干细胞移植治疗白血病(检索年限:19782006.7)见图40、图41、图42。 序号 命中文献数 检索表达式 #1 27277 白血病扩展全部树/全部副主题 #2 2533 造血干细胞移植扩展全部树/全部副主题 #3 456 #1 AND #2 #4 674 白血病 AND造血干细胞移植 #5 31196 白血病 #6 2825 造血干细胞移植 #7 674 #5 AND #6 #8 674 #3 OR #4,图40 CBMWeb例(二)检索策略,图41 CBMWeb例(二)检索结果显示界面,图42 CBMWeb例(二)检索结果全文显示界面,
7、五、CBMdisc检索实习题,1心肌梗塞的血液动力学研究 2尼莫地平治疗老年人高血压 3小儿血液透析的护理 4口腔溃疡的遗传学研究 5甲硝唑治疗牙周炎 6壳聚糖抗幽门螺杆菌的实验研究 7抗菌新药甲磺酸加替沙星的药效学实验研究 8胃癌组织血管生长因子表达与微血管密度的关系 9胆管结石的腹腔镜手术治疗 10纳洛酮治疗蛛网膜下腔出血,The End,中国生物医学文献数据库检索系统与目前流行的MEDLINE光盘检索系统及相应的Internet 检索系统PubMed具有良好的兼容性。,返回,检索系统具有多种词表辅助检索功能,建有主题词表、中英文主题词轮排表、分类表、期刊表、索引词表、作者表等多种词表,且
8、有丰富的注释信息。,返回,检索入口有:主题词检索、分类检索、关键词检索、链接检索、著者检索地址、机构检索、期刊检索、文献类型检索、资助项目检索与参考文献检索 。,返回,CBM具有定题检索功能;限定检索功能;期刊库定制功能;截词检索、通配符检索,各种逻辑组配检索功能;多种排序、显示、拷盘、打印输出功能;支持检索策略的修改、保存、调用功能;具有选库及多文档检索功能。,返回,利用中文期刊文献数字对象唯一标识符技术和XML技术,与维普全文数据库链接,实现了全文获取功能,对于1989年以前的数据,提供人工全文服务。,返回,(1)任意字词检索 (2)字段限制符、范围运算符和通配符检索 (3)逻辑算符组配检
9、索 (4)限定检索,返回,主题词检索主要是根据美国国立医学图书馆的医学主题词表(即MeSH词表),以及中国中医研究院图书情报研究所出版的中医药学主题词表进行了主题分析、标引,主要主题词用*加以标识,词表对表达文献内容的主题概念、名词术语进行了规范化处理,还配备了副主题词表与主题词组配,检索时尽量采用词表的规范化主题词、副主题词进行检索,以提高查全率和查准率。,(1)主题词检索 (2)主题词轮排表检索 A中文主题词轮排表 B英文主题词轮排表 C主题词扩展检索和非扩展检索 D主题词加权检索和非加权检索 E主题词/副主题词组配检索 F副主题扩展检索 G主题词注释表检索,返回,分类表根据中国图书馆分类
10、法医学专业分类表第四版R类进行了分类标引。 部分类目根据需要依据中国图书馆分类法第四版进行了仿分。,(1)分类表使用注意几点 A仿分类目: 例如: R34 医学生物化学与分子生物学部分类目按Q5生物化学仿分,例如:蛋白质为Q51,仿分类号为R341。 R35人体生物物理学按Q6生物物理学仿分,例如:生物光学为 Q63,仿分类号为R353。 R725小儿内科学按R5内科学仿分,例如:小儿传染病为R725.1;小儿先天性心脏病为R725.411。 R726小儿外科学按R6外科学仿分,例如:小儿腹部外科学为R726.56;小儿肾脏手术为R726.992。 R932中药学用R28,例如:植物药为R28
11、2.71;中药化学成分为R284.1;人参汤为R289.5。,B交替类目 以“ ”标识交替类目,以注释说明采用的正式类目,例如:R214 气功保健宜入R247.44;性病淋巴肉芽肿入 R759.5 等。 C动物实验与实验动物 凡文献中涉及到动物、兽医学采用主类号R-332,这一类号可以单独检索,也可与主类号组配检索,例如:动物传染病,用R51和R-332检索。,D地理名称 地理名称为RZ类,排列在分类表的最后,中国地理名称包括各省(市)、自治区,例如:RZ2中国;RZ21北京市;RZ231辽宁省;等等。可以单独检索,也可以与主类号组配检索,例如:北京市病毒性肝炎的流行病学调查,采用 R512.
12、601 和 RZ21 检索。,(2)分类表检索 点击窗口“分类”按钮进入分类检索界面,可利用联机分类表进行检索,选择检索入口:分类导航、分类词和分类号。输入检索词,点击“浏览”按钮,系统显示分类表。可选择扩展不扩展检索,扩展表示对该类号及其下位类号进行查找,不扩展表示仅对该类检索。见图12、图13、,可进行复分组配检索:点击“检索”按钮,系统弹出“选择复分表”,该窗口最上面显示了与复分号组配的主类号,下面列出可与当前主类号组配的所有复分号,选相应复分号与主类号组配,选择“全部复分”:表示检索当前主类号和复分号组配及不组配复分的文献;选择“无复分”:表示检索与当前主类号无复分组配的文献;选择某一
13、复分号:表示仅检索与当前主类号组配复分号的文献。见图14、图15。,图12 CBMWeb分类检索界面,图13 CBMWeb分类检索分类表显示界面,图14 CBMWeb分类检索选择复分号检索界面,图15 CBMWeb分类检索结果显示界面,返回,(1)期刊表检索 (2)期刊代码检索更名的期刊 (3)期刊主题词检索 (4)期刊注释信息 (5)核心期刊检索,返回,(1)作者表检索 点击主页面“作者检索”,在输入框内输入作者名或名称片段,点击“查找”按钮,系统显示包含检索词的作者列表。选择作者名,使其反显,点“查找”按钮,即可检索出该作者的文献。见图20、图21。 (2)第一著者的检索 点击某作者第一作
14、者的图标,则检索出该作者作为第一作者发表的文献。见图22。 (3)在“基本检索”页面著者的检索 在“基本检索”页面选择“作者”检索入口,也可查找某作者的文献。,图20 CBMWeb作者检索界面,图21 CBMWeb作者检索作者列表界面,图22 CBMWeb作者检索第一作者检索结果显示界面,返回,索引词表显示索引词、命中文献数、出现数。命中文献数指文献篇数,出现数指该索引词的词频数。 点击 主页面“索引检索”按钮进入索引词检索界面,输入检索词,点击“查找”按钮,显示索引词列表,选中检索词点击“查找”按钮,就可对索引词表的词进行检索。也可直接通过浏览索引词表的方式进行选词检索。见图23、图24、图
15、25。 索引词表检索仅在默认字段进行,即:题目、文摘、关键词、地址、主题词、刊名字段,而索引表显示的命中文献数为所有字段的检出结果,故索引表的检出文献数与索引表中显示的命中文献数有时不一致。,图23 CBMWeb索引检索界面,图24 CBMWeb索引检索索引词列表界面,图25 CBMWeb索引检索结果界面,返回,定题检索是定制和跟踪某一课题的最新文献。 定题检索的步骤如下: (1)制订检索策略:点击主页面“检索史”按钮,显示已有的检索策略,最多能够保存1000条检索策略, 每页最多显示100条检索策略。可从中选择一个或多个检索式并用逻辑算符 AND、OR 或NOT组成更恰当的检索策略, 如 #
16、1 and #2 或选择相应的逻辑算符按钮。超时退出系统, 检索历史仍然保留, 您可继续检索。 如选择“退出系统”, 检索历史清除。见图26。,(2)登录定题检索画面:初次使用先点击“新注册”,进入定题检索用户注册主页面,输入“用户名”、“密码”和“重复密码”,点击“注册”按钮。见图27、图28。 (3)保存检索策略:登录定题检索后,进行检索策略存储,在输入框内输入这次检索策略的名称,也就是给该检索策略取文件名,点击“存储检索策略”。还可定制多个检索策略,也可通过浏览检索史,修改组织原有的检索策略。见图29。,(4)检索策略调用:登录定题检索后,先前已经保存的检索策略名称会显示在页面下方,可以
17、点击亮显的检索策略名称浏览其对应的检索式集合。可选择一个或多个检索策略文件进行重新检索、最新文献检索或删除该检索策略。 “最新文献检索”按钮:是对末次检索后至今数据库中新添加的文献进行检索, 以追踪获取该课题的最新文献。检索后记录下了更新日期。 “重新检索”按钮:是对数据库中的所有文献再次进行检索。是定题检索的一个附加功能。 “删除检索策略”按钮:将不再需要的检索策略文件删除,必须经常整理检索策略。,图26 CBMWeb检索史界面,图27 CBMwin定题检索用户登录界面,图28 CBMWeb定题检索用户注册界面,图29 CBMWeb定题检索界面,图30 CBMWeb定题检索界面,返回,在检索
18、输入框可输入任意中英文字、词、数字、带有通配符的字词和检索史的序号如:#1。 检索范围由“检索”后下拉菜单中的选项所决定,系统的默认状态是“缺省”。见图1。 缺省字段:表示输入的检索词同时在中文题目、文摘、作者、主题词、特征词、关键词、期刊这些主要字段检索。 全部字段:表示输入的检索词同时在所有可检索的字符型字段中查找。 指定字段:表示输入的检索词仅在某一指定字段内检索,如中文标题、作者、地址、期刊等。见图2。,图1 CBMWeb基本检索界面,图2 CBMWeb基本检索结果显示界面,返回,A可以不通过“检索”后下拉菜单选择检索字段,而是在子窗口中输入带有字段限制符或范围运算符的检索式进行检索。
19、该系统使用的字段限制符用IN或=,使用格式为:检索词IN字段标识符,字段标识符可以是中文或英文,或字段标识符=检索词。例如:输入“胃炎 IN TI”或“胃炎 IN 中文题目”,或输入“张建 IN AU”,可检出命中文献中的著者必含有“张建”二字,可能包括“张建华、张建明等,此为非精确检索。也可用“=”精确检索,如:“AU=张建”,可检出名叫张建的所有文献。,B还可用范围算符限定检索选择年代范围。范围算符包括以下几个: (大于); =(大于等于) ;(指定范围)。 例如:输入“PY=2002或 PY=2002-2004”可检出文献文献出版年为2002、2003、2004年的所有文献。,C可用单字
20、通配符 ( ? )用半角的问号: 替代一个字符进行检索。 例如:输入“血?动力”,可检索出含有以下字符串的文献:血液动力、血流动力等等。 D任意通配符 ( * ): 替代任意个字符进行检索。 例如:输入“肝炎*疫苗”,可检索出含有以下字符串的文献:肝炎疫苗、肝炎病毒基因疫苗、肝炎减毒活疫苗、肝炎灭活疫苗等等。,返回,A逻辑算符的含义 AND: 检出记录中同时含有检索词A和检索词B,常 用来缩小检索范围,提高查准率。 例:糖尿病 AND 胰岛素 OR: 检出记录中含有检索词A或检索词B,常用来扩 大检索范围,提高查全率。 例:糖尿病 OR 白内障 AND NOT: 在含检索词A的记录中,去掉含检
21、索词B 的记录,常用来缩小检索范围,增强专指性,提高查准率。 例:高血压 AND NOT 脑血管意外 B优先级 优先级的顺序依次为:( ) AND NOT AND OR C. 逻辑组配检索界面见图3、图4、图5。,图3 CBMWeb检索史显示界面,图4 CBMWeb逻辑组配检索界面,图5 CBMWeb逻辑组配检索结果界面,返回,可对已检索出的文献内容再进一步的限定检索,点击“限定检索”按钮,对“限定检索对话框”的内容进行选定,点“确认”按钮。见图6、图7。 限定检索内容划分为若干组,有年代、文献类型、题录摘要、核心期刊、年龄组特征词、性别特征词、特征词人类和动物、特征词体外研究与特征词妊娠。,
22、图6 CBMWeb限定检索界面,图7 CBMWeb限定检索结果显示界面,返回,点击主页面“主题检索”按钮进入主题词检索界面,输入“主题词” 点“查找”按钮,显示含该检索词的轮排表。在轮排表选择主题词,选择是否加权,是否扩展,系统弹出“副主题词表”。在“副主题词表”选择副主题词,选择是否扩展副主题词,点“主题检索”按钮,就可进行主题词检索。 例如:欲查找有关“糖尿病药物治疗”方面的文献。见图8、图9、图10、图11。,图8 CBMWeb 主题检索界面,图9 CBMWeb主题检索中文主题词轮排表显示界面,图10 CBMWeb 主题检索副主题词表显示界面,图11 CBMWeb 主题检索结果显示界面,
23、返回,默认状态为在中文主题词轮排表检索, 在输入框键入检索词,点“查找”按钮,系统显示含有该检索词的中文主题词轮排表。见图9。 中文主题词轮排表包括中文主题词和款目词(同义词),词条中带有“见”字时,前面的词为主题词的同义词,后面的词为正式主题词。,返回,系统支持用英文主题词检索。在检索入口选择“英文主题词”检索方式,系统转入“英文主题词轮排表”,在输入框键入检索词,点“查找”按钮,系统显示含有该检索词的英文主题词轮排表。 英文主题词轮排表包括英文主题词和款目词(同义词),及主题词中译名。词条中有“=”时,前面的词为英文主题词,后面为主题词中译名。词条中带有“见”字时,前面的词为英文同义词,后
24、面为该同义词所见的主题词的中译名。,返回,扩展检索指对当前主题词及其所有下位主题词进行检索,非扩展检索则仅限于当前主题词的检索。默认状态为扩展检索,若不进行扩展检索请选择“不扩展”选项。,返回,加权检索表示仅对加星号(*)主题词 (主要概念主题词) 检索,非加权检索表示对加星号主题词和非加星号主题词(非主要概念主题词)均进行检索。 默认状态为非加权检索,若进行加权检索请对“加权”选框进行标记。,返回,副主题词:用于对主题词的某一特定方面加以限制,强调主题词概念的某些专指方面。如:“胃肿瘤/病理学”表明文章并非讨论胃肿瘤的所有方面,而是胃肿瘤有关病理学方面的研究。 主题词与副主题词的组配规则:副
25、主题词一共有94个,表明同一主题的不同方面。主题词与副主题词的组配有严格的规定,不是所有的副主题词均能与每个主题词进行组配,“副主题词组配表”,列出了当前主题词可以组配的所有副主题词及其使用范围注释,有助于副主题词的正确使用。,返回,有些副主题词之间也存在上下位关系,如副主题词“副作用”的下位词包括“中毒”和“毒性”,扩展检索指对该副主题词及其下位副主题词进行检索,非扩展检索则仅限于当前副主题词。 “选择副主题词”列表,列出了可与当前主题词组配的所有副主题词及其注释,副主题词后有“(+)”表明有下位副主题词,其下位词注释信息见词条解释。如:主题词“获得性免疫缺陷综合征”与扩展副主题词“诊断(+
26、)”组配检索。,返回,主题词注释表含有当前词条的详细信息,包括主题词的中文名、英文名、同义词、相关词、主题词范畴注释、树形结构号、可组配的副主题词、药理作用主题词、检索回溯注释、标引注释等内容。 这些信息可帮助检索者正确使用主题词,并为相关主题词的使用提供有益的线索,有助于提高查全率和查准率。,输入“主题词”,点击“查找”确认欲检索的主题词,再点击“主题词注释”可选择更泛指的上位词或更专指的下位词。确认主题词后,选择是否加权,是否扩展。可点击“改换词条”按钮,再点击“检索”按钮,系统弹出“副主题词表”,在“副主题词表” 选择副主题词,点“主题检索”按钮,即可检索出所选主题词的有关文献。或在输入
27、框键入主题词,点“查找”按钮,转入“主题词轮排表”检索。,返回,点击主页面“期刊检索”按钮,选择检索入口:包括期刊导航、期刊名称、出版地、出版单位、期刊主题词。输入检索词:在检索输入框键入检索词,点“查找”按钮,系统显示含有该检索词的期刊列表。选择“期刊名”或“期刊代码”检索。点“期刊检索”按钮进行检索该刊所收录的文献。见图16、图17、图18、图19。,图16 CBMWeb期刊检索界面,图17 CBMWeb期刊检索期刊列表界面,图18 CBMWeb期刊检索选择期刊代码检索界面,图19 CBMWeb期刊检索结果显示界面,返回,医科院信息所为每种期刊分配了内部编码,期刊更名时内部编码不变。选择期
28、刊代码检索,可检索出指定期刊及其更名期刊。,返回,选择检索入口:期刊主题词检索方式,系统显示期刊主题列表,选中欲检的主题,点击“查刊名”按钮,再选中欲查的刊名,点击“检索”按钮,即可检出该刊的文献。,返回,显示期刊信息,包括期刊名称、国际期刊代码、国内期刊代码、期刊内部代码、邮发代码、创刊年、主办单位地址、邮编、电话、期刊变更注释,期刊子集,以及主题词、分类号等内容。,返回,在“限定检索”窗口,标注“核心期刊”选项。 期刊子集:数据库中的期刊被划分为两个子集,期刊子集信息标识在期刊注释信息中。 期刊子集A:包括2000年版中文核心期刊要目总览(北京大学图书馆与北京高校图书馆期刊工作研究会)、2
29、002年度中国科技核心期刊表(中国科技信息研究所)公布的生物医学期刊。 期刊子集B:除外期刊子集A的所有期刊。,返回,(1)浏览检索结果:在检索结果窗口点击“显示”按钮,或双击检索式。见图31。 (2)浏览格式:可选择题录格式、文摘格式和详细格式。 (3)排序功能 (4)全文获取 (5)标注、显标注、去标注(见图32) (6) 浏览检索结果中的链接检索,图31 CBMWeb显示结果界面,图32 CBMWeb显示标注记录界面,返回,(1)文本显示:在检索结果界面,下拉菜单选择文本显示,点击“输出”按钮,将输出本页题录到屏幕上,这时就可打印屏幕上所显示的题录。见图33。 (2)文件保存:在检索结果界面,下拉菜单选择文件保存,点击“输出”按钮,系统会弹出文件下载框,选择“保存”,指定路径,指定文件名,即可将检索结果保存。见图34、图35、图36。,图33 CBMWeb文本显示标注记录输出界面,图34 CBMWeb文件保存界面,图35 CBMWeb文件保存界面,图36 CBMWeb文件保存界面,返回,(1)打印 在检索结果界面,下拉菜单选择文本显示,点击“输出”按钮,将输出本页题录到屏幕上,这时就可打印屏幕上所显示的题录。见图33。 (2)打印格式 A详细格式(ALL) B文摘格式(AR) C题录格式(SD) (3)打印范围 A全部记录 B标记记录 (4)“排序”选项有不排序,返回,
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