计算机模拟技术在动物遗传育种研究中应用.ppt
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1、计算机模拟技术在动物遗传育种研究中的应用,鲁绍雄 云南农业大学动物科学学院 E-mail: ,一、常规育种方案的模拟,1. 系统假设,考虑单个性状 其遗传受多基因控制,且在选择过程中不发生基因突变,2. 参数设置,群体规模 50、100、200 公母比例 1:4、1:9、1:24 性状遗传力 0.1、0.3、0.6 选择世代 15代,3. 个体育种值估计方法,动物模型BLUP模型,4. 选择方案的模拟,不同群体规模下的遗传进展 群体规模越大,选择所能获得的遗传进展也越大,不同公母比例下的遗传进展 短期选择时,适当降低公畜比例,可获得理想的遗传进展,而长期选择时,则应保证足够的公畜数,不同遗传力
2、水平下的遗传进展 选择性状的遗传力越高,遗传进展也越大,不同群体规模下的遗传方差变化情况,不同公母比例下的遗传方差变化情况,不同遗传力水平下的遗传方差变化情况,不同群体规模下的近交系数变化情况,1- 50 2- 100 3- 200,不同公母比例下的近交系数变化情况,1- 1:4 2- 1:9 3- 1:24,不同遗传力水平下的近交系数变化情况,1- 0.1 2- 0.3 3- 0.6,二、动物QTL定位模拟,1. 参数设置,系统假定,一条总长度为100cM的染色体上存在1个影响目标数量性状的QTL QTL有2个等位基因 染色体上的标记均匀分布,且标记间的重组相互独立,2. 实验设计与定位方法
3、,资源群体 F2设计 BC1设计,QTL定位方法 最大似然区间定位,3. 因素水平设置,4 计算机模拟方案,结果I:不同群体规模下的QTL定位效果,QTL检测效率与位置估计,扩大资源群体规模,可提高QTL的检测效率及定位的精确性和准确性 当群体规模增加到一定数量(300)后,继续扩大群体对提高QTL定位精确性的效益将逐渐降低,结果I:不同群体规模下的QTL定位效果,QTL效应估计,资源群体规模过小(低于100),QTL效应估计的偏差增大,精确性降低 适当扩大资源群体规模对提高QTL效应估计的准确性和精确性有益,结果:不同遗传力水平下的QTL定位效果,QTL检测效率与位置估计,性状遗传力过低,Q
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