生物化学第二章蛋白质化学下.ppt
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1、四 超二级结构和结构域,超二级结构(supersecondary structure)是指在多肽链中彼此邻近的二级结构在空间折叠时相互靠近,相互作用,形成了一个有规则的二级结构聚集体,称为超二级结构。目前发现的超二级结构有螺旋组合()、折叠组合()和螺旋折叠组合(),其中以组合最为常见。这些超二级结构可以直接作为组成单位参与三级结构或结构域的构建,它是蛋白质构象中二级结构与三级结构之间的一个过渡层次,故称超二级结构。也称为基元(motif)或基序或模体。 蛋白质的超二级结构是指由若干相邻的二级结构单元组合在一起,彼此相互作用,形成有规则在空间上能够辨认的二级结构组合体,有三种基本组合形式、。,
2、结构域(Structural Domain)是介于二级和三级结构之间的一种结构层次。是指蛋白质亚基结构中明显分开的紧密球状结构区域,是蛋白质三级结构内的独立折叠单元。结构域通常都是几个超二级结构单元的组合。 结构域与结构域之间常常有一段长短不等的肽链相连,形成所谓铰链区。不同蛋白质分子中结构域的数目不同,同一蛋白质分子中的几个结构域彼此相似或很不相同。常见结构域的氨基酸残基数在100400个之间,最小的结构域只有4050个氨基酸残基,大的结构域可超过400个氨基酸残基。 结构域一般都具有一定的功能 。也叫模体(motif)或基序,五 球状蛋白的三级结构,由蛋白质二级结构、超二级结构或结构域相互
3、连接组合形成的蛋白质构象结构称谓蛋白质三级结构。 具有三级结构的多肽链称谓亚基(subunit)。单个多肽链构成的蛋白,具有三级结构才能有活性。多条肽链形成蛋白,需要亚基进一步组合才能有活性。 亲水基团在外,疏水基团在内,形成疏水核心。,维持蛋白质三级结构的化学键为非共价键 氢键;盐碱(离子键);疏水键;范德华力;配 位键;二硫键,六 蛋白质四级结构,由两条或以上的具有三级结构的多肽链以非共价键形式组合在一起,形成的结构称谓蛋白质四级结构。,成人血红蛋白由2条链和2条链组成,各亚基分别含一个血红素.,第四节 蛋白质结构与功能关系,自然规律:结构决定功能,功能反应结构 一 蛋白质一级结构决定高级
4、结构 二 结构与功能 一级结构 相似蛋白序列相似; 氨基酸变异造成功能丧失。 空间结构与功能 构象与功能 镰刀型贫血症:,动物体细胞色素C一级结构的进化树 图中的数字表示该类动物与其祖先相比细胞色素C一级结构氨基酸残基的差异数,正常朊病毒蛋白与朊病毒空间结构的差异 朊病毒(PrPsc)是蛋白质,不含核酸。它是正常朊病毒蛋白(PrPc)的空间 构象由-螺旋变成-片层结构所致。因此,这类疾病又称蛋白质构象病。朊病毒 本身不能复制,但它却可以攻击大脑的正常朊病毒蛋白,使其发生构象改变, 并与其结合,成为致病的朊病毒二聚体。此二聚体再攻击正常的朊病毒蛋白。这 样,脑组织中的朊病毒不断积蓄,造成脑组织发
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