兰州地区汉族人群HLAA、B和DRB1等位基因多态性分析.pdf
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1、 群体遗传学研究 兰州地区汉族人群 HLA-A、 B 和 DRB1 等位基因多态性分析 李彩丽唐朝晖方丽华李元荣苏海翔魏虎来 【摘要】 目的分析兰州地区汉族人群 HLA-A、 B 和 DRB1 位点等位基因多态性特点。方法采用序 列特异性引物聚合酶链反应技术对兰州地区 200 名健康无血缘关系的汉族个体 HLA-A、 B 和 DRB1 基因座 进行分型, 并与西北、 北方和南方汉族、 西北回族、 维吾尔族和藏族人群进行比较。结果兰州汉族人群中 HLA-A 基因座共检出 14 个等位基因, 以 A*02, A*11, A*24, A*33, A*30, A*01 和 A*31 基因最常见; HL
2、A-B 基因座共检出 32 个等位基因, 以 B*40, B*15, B*46, B*13, B*51, B*60, B*58 和 B*44 基因最 为常见; HLA-DRB1 基因座共检出 13 个等位基因, 最多见的基因依次为 DRB1*09, DRB1*15, DRB1*12, DRB1*04,DRB1*11, DRB1*07, DRB1*08 和 DRB1*14, 接近北方汉族而与南方汉族有差异, 与西北回族 无明显差异, 但与西北维吾尔族和藏族差异有统计学意义。结论兰州地区汉族人群 HLA-A、 B 和 DRB1 位点等位基因多态性与南、 北汉族人群存在不同程度的差异, 与西北维吾尔
3、族和藏族差异显著。 【关键词】人类白细胞抗原-A、 B、 DRB1; 等位基因; 基因多态性 The analysis of HLA-A, B and DRB1 allelic polymorphism in Han race population in Lanzhou region of China LI Cai-li1, 2, TANG Zhao-hui2, FANG Li-hua2,LI Yuan-rong2,SU Hai-xiang1, WEI Hu-lai1. 1 (Laboratory Center for Medical Science, Lanzhou University,
4、Lanzhou,Gansu,730000 P . R . China) ; 2 (The Red Cross Blood Center of Gan- su Province, Lanzhou, Gansu, 730046 P . R . China) Corresponding author:WEI Hu-lai, Email:weihulailzu . edu . cn 【Abstract】 ObjectiveTo investigate the HLA-A,B and DRB1 allele polymorphism of the Han race population in Lanzh
5、ou area. MethodsPolymerase chain reaction-sequence specific primer was used to detect HLA-A,B and DRB1 alleles in 200 unrelated heathy Han individuals from Lanzhou region,Northwest China,and the results were com- pared with those of Han populations in North,South and Northwest China,and Hui,Uigur an
6、d Tibetan population in China. ResultsFourteen of alleles were detected and identified for HLA-A;32 for HLA-B;and 13 for HLA-DRB1. HLA- A*01,A*02, A*11, A*24,A*30,A*31,A*33;HLA- B*13,B*15,B*40,B*44,B*46,B* 51,B*58,B*60;HLA- DRB1*04, . DRB1*07,DRB1*08,DRB1*09,DRB1*11,DRB1*12,DRB1*14 and DRB1*15 were
7、the most common alleles. The frequencies of HLA-A,B and DRB1 genes of Lanzhou Han race were close to that of North China Hans and Hui population in Northwest China,and a little different to that of South China Hans. The HLA-DRB1 alleles were significantly different to those of Uigur and Tibetan race
8、 population of China. Con- clusionThe allelic polymorphism of HLA-A, B and DRB1 loci of Han race population in Lanzhou area was between North and South Han race of China,close to Northwest China Hui,and markedly different to Northwest China Uigur and Tibetan race populations. 【Key words】 human leuko
9、cyte antigen-A,B,DRB1; alleles; gene polymorphism 人类白细胞抗原 (human leukocyte antigen, HLA) 系统是迄今 最复杂的人类遗传体系, 具有高度的遗传多态性 1-3。兰州地 区汉族人群 HLA 多态性分布迄今尚未见系统调查。我们采用 序列特 异 性 引 物 聚 合 酶 链 反 应 (polymerase chain reaction -se- quence specific primer, PCR-SSP) 技 术 研 究 兰 州 地 区 汉 族 人 群 HLA-A、 B 和 DRB1 等位基因多态性, 以确定兰州地
10、区汉族人群 不同等位基因的分布情况。 1对象与方法 1.1对象随机选择 200 名无血缘关系的兰州籍汉族健康人, 作者单位: 730000 兰州大学医学实验中心 (李彩丽、 苏海翔、 魏虎 来) ; 甘肃省红十字血液中心 (李彩丽、 唐朝晖、 方丽华、 李元荣) 李彩丽和唐朝晖为并列第一作者 通信作者: 魏虎来,Email:weihulai 平均年龄 (30 10) 岁。静脉采血 2 mL, 0.5 mol/ L EDTA 抗凝。 1.2基因组 DNA 提取采用血液基因组 DNA 提取试剂盒在 常温下快速提取血液基因组 DNA, DNA 测定 A260/ A280 1.8, 浓 度 75 1
11、25 ng/L, - 70保存备用。 1.3PCR-SSP 分型采用 PEL-FREEZ PCR-SSP 试剂盒, 按照试 剂盒要求操作。PCR 扩增条件为: 95 25 s; 65 50 s; 72 45 s; 循环 30 次, 72延长 2 min 后冷却至 4。2% 琼脂糖凝胶, 8 V/ cm, 电泳 30 min, 凝胶成像分析系统中观察, 根据特异性扩增 带判定结果, 并成像分析。 1.4HLA 基因命名和特异性HLA 基因命名采用 WHO HLA 因子命名 委 员 会 2002 年 发 布 的 命 名 原 则 4, HLA 特 异 性 按 “HLA 字典 2004” 将 HLA
12、基因转换为对应的 HLA 抗原型 5。 1.5统计学分析直接计算基因频率, 组间频率比较用x 2 检 验法 6。 98中华医学遗传学杂志 2006 年 2 月第 23 卷第 1 期Chin J Med Genet,February 2006,Vol. 23,No. 1 2结果 2.1兰州地区汉族的 HLA-A、 B 和 DRB1 等位基因频率分布 200 名兰州地区汉族人群中共检出 HLA-A 基因 14 个, B 基因 32 个, DRB1 基因 13 个, 以 A*02、 B*40 和 DRB1*09 最多见, 基 因频率分别为 31.5%、 16.75%和 14.0%, 其次分别为 A*
13、11, A *24, A*33, A*30, A*01, A*31, A*03, A*26, A*32 等; B* 15, B*46, B*13, B*51, B*60, B*58, B*44, B*35, B*54 和 B*48 等; DRB1*15, DRB1*12, DRB1*04,DRB1*11, DRB1* 07, DRB1*08, DRB1*14, DRB1*03 和 DRB1*13 等 (表 1) 。 2.2兰州地区汉族与我国南、 北汉族人群 HLA-A、 B 和 DRB1 等位基因频率比较兰州汉族 HLA-A 和 HLA-B 位点的各个等 位基因与西北和北方汉族的差异较小, 与
14、南方汉族有显著性差 异的基因座位数最多 (P 0.05) 1, 2; HLA-DRB1 等位基因频率 与南、 北汉族、 西北汉族和西北少数民族比较 3, 与西北回族差 异最小, 其次为北方汉族、 西北汉族和南方汉族,与西北维吾 尔族和藏族差异有统计学意义 (表 2,P 0.05) 。 表 1兰州地区汉族人群 HLA-A, B 和 DRB1 基因频率分布 (% ) 等位基因特异性表现数基因频率等位基因特异性表现数基因频率 A*01A1174.25B* 40B40369.00 A*02A212631.50B60 (40) 256.25 A*03A3143.50B61 (40) 61.50 A*11
15、A118621.50B* 41B4110.25 A*23A2310.25B* 42B4200 A*24A246917.25B* 44B44194.75 A*25A2500B* 45B4530.75 A*26A26123.00B* 46B464310.75 A*29A2941.00B* 47B4710.25 A*30A30194.75B* 48B48143.50 A*31A31153.75B* 49B4920.50 A*32A3271.75B* 50B5030.75 A*33A33246.00B* 51B51297.25 A*34A3400B* 52B52112.75 A*36A3600B* 5
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