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1、SDS-PAGE 失败实例及分析 症状 1涂抹痕迹( smears) 涂抹痕迹 例 1 涂抹痕迹可能由于多种原因引起,但是最常见的原因是聚丙烯酰胺凝胶倒胶的不均匀或者上样量过大。 这块胶倒胶不正确,在上部胶倒入制胶槽之前就已经发生聚合。首先倒入的胶聚合发生的太快了。与其重新倒胶,不如停止倒胶重新准备新的聚丙烯酰胺混合 液,然后将新的胶倒入旧胶的上方。但是显然这种连接不是非常牢固。(我推荐重新倒胶,制胶很关键,如果你后续还要做blot ,胶没有跑好浪费太多了! ) 涂抹痕迹 例 2 这块胶每孔上样量过大。大多数的泳道还是能分清条带,但是在3、4 道涂抹痕迹非常明显。这些泳道的样品主要含有一种蛋白
2、(血红蛋白的亚基),与 9、10 道一样。但是,3、4 道的样品低估了红细胞裂解物和红细胞胞浆组分中的蛋白含量。这些组分包含了过多的蛋白以至于样品需要稀释后才能进行蛋白含量测定。 但是这名学生却忘记了这个样品已经稀释过了,因此造成了蛋白浓度的低估。(严重的失误啊!) 小型胶每孔的蛋白样品的量为20-40 微克,取决于所需的分辨率和混合液中包含的多肽数目。但是,如果是一个纯化样品上样,一个带包含了20-40 微克蛋白, 那么其结果肯定也是一团糟! 涂抹痕迹 例 3 这也是一个上样量过大的例子,这名学生似乎犯了和例2 中同样的错误,因此在胶上也表现出各泳道的不一致性。 涂抹痕迹 例 4 涂抹痕迹可
3、能常见于用非连续胶跑膜相关蛋白这类脂质含量丰富的样品。在非连续PAGE 中,样品蛋白基于两个因素而被超浓缩。首先,当样品从非限制性的 积层胶移动至限制速度的分离胶时迁移速率陡然下降。其次,也是最重要的,PH变化造成蛋白样品电泳速率的改变,导致样品突然停滞。一个高约半厘米左右 的样品被压缩成为一个仅为数微米厚的薄层条带,局部蛋白浓度急剧增加。 胞膜相关蛋白一般于较低浓度是沉淀,因此泳道的顶部通常有一条神色的条带含有沉淀的蛋白。当电泳进行时沉淀的蛋白重新溶解然后持续进入凝胶,因此造 成了一个持续性的较深的不可分辨的背景。许多膜相关蛋白的凝胶图像都显示同样的特征。 上图中 4、7 道的蛋白样品虽然含
4、有相同的蛋白量,但是第4 道的样品中含有的膜蛋白的量超过了凝胶的分辨能力,造成了很深的涂抹痕迹。 症状 2条纹拖尾 条纹拖尾 例 1 这个不是非常严重,有条纹拖尾的泳道(图中左边第5 道)也是可以用的。条纹的出现是由于一部分膜组分中的高浓度蛋白在跑积层胶过程中析出然后在很短 的时间里又回到溶液中。由于分离胶表面存在轻度的缺陷(可能是在倒积层胶之前分离胶干了一些),造成整个泳道的蛋白浓度的不一致,使得出现这种条纹拖 尾症状,而不是一致的很深的背景。 条纹拖尾 例 2 第 4 道也是由于上述原因而出现条纹拖尾。电场受到了第4 道非均一浓度的影响而出现了条带的缩窄。注意凝胶前端染料的缺失,是由于电泳
5、时间过长所致。 条纹拖尾 例 3 这块胶就非常难看了。原因在于分离胶倒完之后没有用水或者异丙醇压胶,导致分离叫上缘非常粗燥,就像你看到的一样。当样品堆积在凹凸不平的分界线时, 位于凹陷部位的蛋白由于不能适当的浓缩就析出来了。然后再跑胶过程中逐渐溶解造成了条纹拖尾症状。 症状 3条带过浅 条带过浅 例 1 这个问题可能是由于加样孔成形不佳和/或凝胶加样不认真所致。背景较深而且不均一说明蛋白可能存在于电泳缓冲液中。最有可能原因是由于装置没有正确紧 密的装配导致较多的样品溢出加样孔。溢出的样品很可能不会重新溶入形成条带,因为这些蛋白从上层缓冲液的间隔持续进入凝胶。 注意在凝胶下部存在一条贯穿若干泳道
6、的水平线,说明加样孔太浅,部分样品溢出至相邻的加样孔。 这个症状在一些配制正确的凝胶中也会出现,常常是在电极连通之后的数分钟内。蛋白溢出至加样孔外而不是进入积层胶。在几分钟之内发现问题可能挽救一 部分损失,但是由于PH效应导致有效的样品浓缩失败,样品损失以及蛋白污染电泳缓冲液。 条带过浅 例 2 由于没有其他的症状,这块胶的问题似乎仅仅就是染色出问题了。考马斯亮蓝染液如果反复利用就会被SDS污染,这些回收的染液对于蛋白的染色效率就不及 新鲜配制的染液。只要样品蛋白被染液中酸化的甲醇固定于胶上,那么这个问题只需要简单的重新用新鲜配制的染液染色剂可解决。 条带过浅 例 3 第五道旁边用 “X ”标
7、记的泳道的样品蛋白含量被低估了,或者电泳样品准备时弄错了样品浓度,或者上样体积太少 可能是加样针没有正确的吸取足够的样品。 和其它的样品对比,缺乏几乎所有的主要的条带,说明这个孔的问题就是上样量过低。 条带过浅 例 4 这是你可能遇到的问题中比较让人沮丧的。我们可以说你是非常仔细的,把每件事都做得倾向于完美,跑胶直到溴酚蓝前沿非常平直的落在胶的最底部。你用 去离子水冲洗凝胶,然后将其置于摇床震荡。在这天稍晚些时候你发现你忘了将凝胶放到染色缸里面。第二天染色结果就是上面的样子了。 注意分子量较小的蛋白从胶上弥散较快,而较大分子量的蛋白弥散很慢而能被染色。染色和脱色液中的酸化甲醇是非常必要的,它可
8、以固定蛋白阻止其从聚丙 烯酰胺基质上弥散。 症状 4前端指示剂缺失 部分前端指示剂 例 1 为了装置凝胶花了不少功夫,如果停止电泳太晚就太可惜了。因为如果部分前端的指示剂已经跑出凝胶的话就不能确定各个条带相对应的迁移率了。 这块胶有一个内部的刻度也就是跑胶时带上了分子量标准(Marker) 。由于条带较平直,任意条带都可以作为参考来确定跑胶的迁移率。 前端指示剂缺失 例 2 这块胶跑胶时间过长以至于全部的指示剂都跑出凝胶。由于泳道有些扭曲,这就对相对迁移率的分析造成了困难。如果凝胶前端的指示剂完整,泳道之间的相 对迁移率都可以做比较,哪怕是凝胶扭曲或者同一电泳槽两块凝胶的分离胶高度不一致。无论
9、分离胶的绝对高度是否一致,相对迁移率对于组成均一的凝胶来 说都是一致的。 前端指示剂缺失 例 3 从这块胶曲率来看应该是属于由于两侧薄板之间结合稍微松弛形成的边缘效应(“ 皱眉 ” 效应) 。由于前端指示剂也是缺失的,因此很难准确分析其相对迁移率。 但是如果有完整的前端指示剂作为参考线,即使存在“ 皱眉效应 ” 也可以进行比较。 症状 5条带仅在凝胶顶部 过早终止电泳 例 1 很明显这块胶的指示剂前端位于什么位置。仍有继续电泳的空间可以把条带分得更开以增加分辨率。相对迁移率是为了分析凝胶相同位置上相同大小的蛋白。 随着蛋白迁移距离的增加分辨率逐渐增高直到弥散限制了分辨率的继续提高。 过早终止电
10、泳 例 2 这两块胶一个是 7% 的一个是 14% 的,看起来都还不错。有些人做实验室很不耐烦过早就终止了电泳。这些胶虽然可以用,但是如果继续分离直到指示剂达到 凝胶底部可能效果会好得多。这种情况可能发生在你很晚跑电泳的时候,你的老师都饿了,而你却不能让他等你一步一步地做完。 症状 6混杂因素 扭曲的条带 有这个问题的凝胶在整个“ 失误大全 ” 中到处可见。这是由于分离胶的表面不平所造成的,因此当样品浓缩之后所有的条带都变扭曲的形状。 扭曲的条带也可以见于电场的不均一,但是这种条带的扭曲应该是对称的。 加样孔不成形 当样品溢出至邻近加样孔, 你就会观察到横贯几个孔的连续的蛋白条带(箭头所示)。
11、事实上,这种情况通常发生在加样孔深度不够或者样品不慎漏至加样孔外。 此外,我们也很可能用陈旧的上样缓冲液。使用Cleland 试剂( DTT)的好处就是它可以减少二硫键的形成但是却没有二巯基乙醇的难闻。但是二巯基乙醇却要 稳定得多。二硫键将各个单独的多肽链接在一起并在非变性条件下维持一些蛋白的折叠状态。这可以造成某些蛋白泳动异常。 高密度胶 这块胶明显是非正确聚合的。聚丙烯酰胺的密度相当高以至于只有少数小分子蛋白可以进入分离胶。条带也由于上样量过大发生扭曲,事实上大多数凝胶在超 过一个合理的浓度范围之后都不能均匀的聚合。 破碎胶 这个结果可能非常令人沮丧。你做了一个非常好的实验,但是在处理凝胶
12、的时候却发生了破裂。记住如果你收集了足够多的碎片这块胶仍然是可以用的。 电场效应 在一定程度上来说这个现象是正常的,只是在这里电场被夸大了。两块挡板在凝胶边缘处干扰了电场,因此这种拉力使得样品的靠近边缘的一端被加强,结果 就产生了这种 “ 皱眉效应 ” 。 可能某些条带会出现 “ 微笑现象 ” ,但是只要整块胶都有蛋白条带,则肯定是皱眉的形状。我猜如果把你浸在蓝色染料中然后拉着你在电场中跑,你也一定会皱 眉的 症状 7包含多种症状的失败凝胶 多种症状 例 1 许多时候你跑的胶会有多种症状同时存在。由于评论凝胶的目的就是改善你的实验,因此发现是什么导致这些意料之外的效应非常重要。接下来你就可以着
13、手 改进你的跑胶质量。 这块胶:缺乏前端指示剂电泳时间过长; 条带扭曲 分离胶上沿不平,最可能的原因是压胶的液封不恰当; 右侧泳道上样量偏大。 多种症状 例 2 这块胶:出现电场效应,条带弯曲。 上样量太大。 分离胶上沿不平,条带扭曲。 多种症状 例 3 这块胶:上样量不均一(相邻加样孔上样不同),导致某些条带被压缩。胶上有一些痕迹而且被完全脱色。这说明可能是由于没有正确取放凝胶用手直接接 触凝胶导致胶表面留下蛋白而被考马斯亮蓝染色。有时候你可以得到非常漂亮的指纹! 症状 7千奇百怪的胶 例 1 装甘氨酸的容器和装氯化胆碱的非常相似。由于胆碱的吸水性要强于甘氨酸,因此如果错误地用于电极缓冲液肯
14、定会出现一些变化。胆碱是一种基础的化合物, 但是肯定不是甘氨酸的替代物。这里我们找到了一个这样的实例。虽然在电泳一段时间后发现后立即更换了缓冲液,但是还是太晚了。 例 2 这个图由捷克的 T. Sedlacek 提供。跑的时候电流过高导致发热量过大。 例 3 这两块胶由 E. Morales Rayas 提供。一种可能的解释是可能这两次跑胶时在加样与实际跑胶之间间隔时间太长。第一块胶中间的几个泳道出现了增宽和压缩交 替的形式,而第二块胶的条带则向凝胶边缘扩散。 当蛋白样品加入上样孔后即开始弥散到积层胶,同时向垂直和两侧发生(在没有电场的情况下蛋白弥散的方向是随机的,因此上样后必须尽快开始电泳)
15、。较小 分子量的蛋白弥散速度快于大分子量的蛋白。如果蛋白横向扩散就会影响邻近泳道的电场,特别是邻近的泳道蛋白含量更高时。但是如果所有的样品组成相似 并序贯上样,弥散造成的影响就不是这么重要。但是仍然会造成条带的失真。 例 4 显然在实验室中用塑料瓶大量储存Tris-甘氨酸电极缓冲工作液并不是好主意。我们看不见缓冲液中的霉菌,但是它确实存在其中。注意脱色后这块胶的指示剂 下方都呈透明的颜色,而胶的背景却仍然呈蓝色,说明霉菌蛋白在整个电泳过程中已经渗透到凝胶之中。 Example 1 “Smearing ”, 导致拖尾效应有很多的原因,最终要的是丙烯酰胺灌制的不够均匀和样品量过大!这是当时学生制胶
16、时底下已经凝固,然后再重新补上一部分的 浓缩胶和分离胶所致!当然重叠在一起,无法区分也是难免了。 Example 2 样品量过大而出现了样品“ 交叉” 污染,正常的当载样在20 to 40 micrograms/well 将会很漂亮。 Example 3 样品量过大,当然胶灌制的也不够均匀。由于过量的样品影响了个别泳道的电场,使的有些条带宽,有的窄些。 Example 4 “Smearing ”(注意泳道 4) ,这可能和样品中的含有大量脂类的膜相关蛋白引起的:由于不连续的胶中,样品被浓缩的很厉害。所有样的迁移速率在样品过积层 胶后都会慢下来,当到达分离胶时,PH 的改变使得聚集的膜相关蛋白有
17、沉降的倾向,但另一个方面,电泳过程又不断的溶解这些蛋白,因此便出现了泳道4 中 连续的黑色托尾,通过WESTERN验证后,这些都是一个组分造成的! Example 5 这张还不是太糟糕。泳道4 还加上飞纹,原因是样品未能处理好,上样量控制的也不够好,另外跑的过程可能电压过大;另外这张胶当时做的时候,分离胶凝 固的并不是很好,蛋白穿过胶孔时,浓度并不均一,因此形成了飞纹而不是一片黑色托尾。由于样品跑的比较直且齐整,因此电场还是比较均匀的。泳道5 中 的蛋白没有很好的溶解。 Example 6 简直一塌糊涂!首先做好分离胶时,没有封闭。另外,样品很快的沉降到不平整的脚面上,随着电泳的进行,样品不断
18、的融解,以至形成托尾而不是一条条清 洗的条带。 另外,这个样品可能含有杂质比较多(不溶性杂质或基因组DNA) ,可见上样前的充分离心也是必要的! Example 7 条带太淡。背景脏且不够均匀,说明电泳缓冲液有污染(杂质在电泳过程中不断的进入胶中),或者板子没有洗干净。在溴芬兰线的后面还有连续的细线,说明 上样不够小心,致使样品飞了出孔,同时也污染了其他的相临样品。 Example 8 完全是染液重复利用惹的祸,对于这张(只有下面着色),只要重新再染,效果还是可以的。 Example 9 这是一张银染的结果。本来一切都小心奕奕的,结果把胶放到去离子水中回家了,过了一夜,第二天染色结果变成这个样
19、子了,呵呵 原因:固定在胶中的蛋白都溶到水里了。 Example 10 电泳停的太早。如果能继续再跑,效果就好了,当然,缓冲液必须有足够的缓冲能力,否则会引起扩散。 Example 11 这张图大家最主要的看看是胶孔作的不够齐整(我用箭头标出了)。另外,可能由于选用旧的上样缓冲液,致使2-mercaptoethanol 挥发,电泳的样品没有完全 处于变性状态下,这使得跑出的结果难以很好预测。 Example 12 胶的浓度过大(不是自己的, 浪费也不心疼),只有少量的小分子蛋白能入胶;由于胶的浓度过大,聚合不够均匀,载样过大,出现上面的情况自然是必然的了! Example 13 可能由于选用旧
20、的上样缓冲液,还原试剂已经挥发,另外缓冲液中SDS 的量也应该稍微的补加(可能有析出) ,样品根本无法进入胶中。只有让分离的蛋白入 胶,才能进行良好的分离。 Example 14 要么样品盐浓度过高,要么分离胶不均匀。因此应该把部分样品中的盐透洗除去,或者一直采用较小的电流来跑,可能效果会稍微的好一点点。当然,根本的 还是应该去盐份(如果重复结果一致的话) 。 Example 15 做的好图。 【专题讨论】我在 SDS-PAGE 中所犯的 错误 蛋白质电泳配的10 TBE 母液 ,使用时用1TBE 时 ,是不是取一份10 TBE 母液 ,加 9 份水啊?若用.5TBE ,是不是取一份母液加 份
21、水啊? 实在不好意思,太简单的问题 SDS-PAGE中 AP 的质量与新旧比较重要,我们一般将其分称于几个EP 管中,用时再用ddH2O溶解,一般只用一周左右; SDS 应该不会出现什么问题,放一年左右都没大问题; 电泳缓冲液一般只可用2 次,多次重复使用会出现拖尾带 蛋白质电泳用的缓冲液应是Tris- 甘氨酸, TBE 是用来电泳核酸的; 10一般指的是10 倍深度,用时稀释成1 倍。 虽然此帖发了快一年了,但我还是和大家分享一下我的经验,希望对后来者有些须帮助: 1. 用琼脂糖封胶好象优点奢侈, 除了用琼脂粉以外还可以用12.5%的淀粉 ,煮沸致透明即可. 2,APS 配好后可用EP 管分
22、装 ,保存于 -20 度 3, 一般的电泳仪的正负接头都有颜色指示,红色示正极 (bio-rad),有的 ( 大板 ) 红色指示的却是负极. 4,marker点了就好分辨点样顺序,可不用切角 ,但不点 marker时却必须点上. 5, 剥胶时可把浓缩胶刮掉,一边用流水冲洗一边剥,这样比较保险. 10% 的 SDS 放在室温或4都会出现沉淀,加热一下就可以了. 请教几个问题: 1、我的胶凝后总有少量水分析出,是否正常? 2、按照分子克隆配的12 胶 20kDa的蛋白跑不出来,且染料的位置有一条深染的条带,只有15 的胶下面条带才消失,我跑的是细 菌总蛋白,是否是因为胶的实际浓度低所致? 3、细菌
23、沉淀直接加2buffer ,煮沸 5 分钟变性,离心后上样,是否可行?为什么有的样品稀,有的样品特浓,上样都困难,跑出来后 严重脱尾? 4、哪位高人有蛋白表达方面的经验请指教!xue_ 回答 : 1, 正常 ; 2,12%跑 20kD没问题的 ; 3, 细菌沉淀我们是加1 倍的 buffer,沸水煮 8-10min,小离心机12000rmp5-10min;煮的时候要小心EP 管 ,没盖严或崩开的话样品就 会有特浓的情况发生. 4, 这里有很多做过蛋白表达的, 本人做过三年 . 今天做胶 , 所用凝胶储液 ,分离胶和浓缩胶BUFFER 都是去年 11 月底的 ,居然也凝固了,不知这样的胶能否用来
24、电泳? 另外在灌胶时发现分离胶和浓缩胶溶液里都有少量白色絮状沉淀,不知是不是溶液放置太久之故还是本身就有的, 因为以前做实验时也发 现过类似的现象. 谢谢指点 ! 最近一直跑同工酶,不知道大家凝胶时是什么温度?个人认为高温下使凝胶快速聚合比较好,特别是4mm的厚板,根本不用封水,特 别平。常温下自然聚合经常会出现锯齿状的边缘,就是不知道对电泳有没有影响。感觉没什么差别 琼脂是可以封底的,我们实验室一直在用哦,而且效果很不错。凝固几分钟就可以了 我也在做SDS-PAGE 的电泳 , 使用的是恒压 ,请教各位一个问题: 电压大小和分离样品的性质关系怎么样?大了好还是小了好啊? 琼脂粉可以用的,我就
25、是用这个,其实没什么影响的,2的琼脂粉凝结的很慢,我每次用4啦,从没出现过漏胶的问题。另外SDS 我也是常温放着的,TEMED 我是常温避光放置,AP 4 度保存。丙烯酰胺和甲叉双丙烯酰胺不能久置,最好新配。其它的问题也就是熟 练而已啦。 最近我在跑SDS-PAGE时,发现胶上部分条带出现山峰状的高耸,有点象心电图的样子。第二个问题是:肉眼看胶的背景很干净,可是 用 Amersham的 Image Scanner进行凝胶扫描时,调整对比度后却发现有显色比较深的竖条带贯穿在某个样品的蛋白条带上下。请问各位高手这是什 么原因导致的?以前曾有帖子说这是因为存在不溶性蛋白的缘故,可我的样品全都是可溶性
26、蛋白。 我想把自己的 “ 问题 ” 凝胶上传给大家分析,可是我发现可以上传的那个项目好像消失了,所以我不知道该如何让大家看见我的胶。抱歉, 只能口述了。 对于大家上述谈到的问题,我也说说自己的体会。 (1 )AP 我们一般是现用现配,配好后未用完的一般在4 度保存一周。一周后的必丢弃。 (2 )10%SDS在室温保存一年,感觉也没什么问题。气温下降时可能会出现白色絮状物,当时碰到这个问题,我是把旧溶液丢弃,重 新配制。后来我们实验室的技师说,加温溶解后应该还可以用。但本人没试过。供大家参考。 (3 )1M Tris(pH6.8)和 1.5M(pH8.8)我也放在4 度保存,理论上说在室温保存即
27、可。可我们室温保存的Tris 曾发现絮状物,我不太 清楚什么原因,可能是配置时间太长了?但我感觉放4 度保存效果很好,已经大半年了,没有出现絮状物的情况。 (4 )TEMED 我们是 4 度避光保存,丙烯酰胺棕色瓶4 度保存。理论上,TEMED是易吸湿的无色液体,吸水则加速氧化变成黄色,会 降低其增速作用,最好不要用。暂不用者最好密封保存在深冻冰箱中。但我们4 度保存的 TEMED 通常都是黄色的,感觉用起来也没什 么问题。丙烯酰胺理论上4 度可保存一个月,但我们通常都会超过这个时间期限,可能至少也有2、 3 个月,也没什么问题,但还是建 议大家配制溶液时一次少配点,譬如50ml或 100ml
28、 。 另外我们实验室用的是Amersham的电泳仪,是用凡士林来封底的。用起来也很方便。 大家有用5*LOADING BUFFER的吗 ?配方就是分子克隆的浓缩一下是吗? 为何我跑的胶老是歪的,用的是国产电泳仪, 经验而已 , 用 1.5%的琼脂糖封胶相当好! 当然 ,其实各实验室都有自己的一套东西,希望大家多交流。俺是新的手啦,不懂的很多。 maker可以放在一测,另外我们做完分离胶后用异丁醇封顶,效果挺好的,不妨试一试 我最近跑胶感觉积成胶凝的特别慢,分离胶就没有,为什么啊? 而且我跑的Maker最大的一条带要么看不到,要么变成很细的很近的两条带,是怎么回事呢?换了一管新的也是一样! 我最
29、近跑胶感觉积成胶凝的特别慢,分离胶就没有,为什么啊? 而且我跑的Maker最大的一条带要么看不到,要么变成很细的很近的两条带,是怎么回事呢?换了一管新的也是一样! 哈,又见面了 胶凝的慢不用说,肯定是试剂的问题,想解决,那就把temed多加 2ul , aps 增加 10 左右,保证快些,另外你的aps 建议重赔,此 外凝的时候放在37 度也会快点。 你的 marker其他带怎么样,而且最大的本来就比较浅,出现两条带可能使你跑胶的问题 我也有问题想问一下,为什么跑胶中会出现条带的歪斜, 如果是试剂的问题的话为什么分离胶可以在30 分内就可以凝好呢?我APS 是配好后分装,拿了一管新的也是一样啊
30、!我想我现在跑胶 是有点问题,可到底是什么问题我还不知道,在注意一下拉! 问大家一个问题,我最近跑胶时,发现分离胶下边距离边缘1cm的地方经常出现比较大的气泡状的东西,今天更坏的是下边的分离胶竟 然裂开了,而我这次配胶是昨天晚上配的,今天早上用,刚开始并没有气泡产生,过了几个钟头之后才开始出现气泡的,而且溴芬兰遇 到气泡后就变成了黄色。我今天加了冷凝水,应该不是温度的事情,请问谁知道该解决这个问题,我已经遇到这个问题不下6,7 次了, 谢谢! 问大家一个问题,我最近跑胶时,发现分离胶下边距离边缘1cm的地方经常出现比较大的气泡状的东西,今天更坏的是下边的分离胶竟 然裂开了,而我这次配胶是昨天晚
31、上配的,今天早上用,刚开始并没有气泡产生,过了几个钟头之后才开始出现气泡的,而且溴芬兰遇 到气泡后就变成了黄色。我今天加了冷凝水,应该不是温度的事情,请问谁知道该解决这个问题,我已经遇到这个问题不下6,7 次了, 谢谢! 我们曾出现过这种情况,主要因为玻璃板不平或不干净所致,胶凝时会收缩,与玻璃板之间如果结合不紧密的话,那就会出现气泡或者 裂开了,你只要换一块板或者好好洗洗,就应该没有问题了 我在铬酸中泡过玻璃板,应该挺干净的,至少比我以前的干净,不过,下次再好好洗洗试试。另外,可能的原因我想是不是ap,我的 ap 用了好久了,今天我重新配了,到现在为止胶还没裂,因为我现在跑14% 的胶,可能
32、ap 对他影响比较大。 大概没有比不拆封胶边条更让人郁闷的了,尤其有一次已经跑了近一个小时。可别忘 我也在做SDS-PAGE 的电泳 , 使用的是恒压 ,请教各位一个问题: 电压大小和分离样品的性质关系怎么样?大了好还是小了好啊? 1、当然电压大了,胶跑的快,时间短,分离效果差,所以如果要跑胶的样品蛋白的分子量差别不大的话,要用的电压要小,这样分离效 果好;如果分子量差别大的话,就用大电压,可以快速看到结果。 2、菌液样品一般要小电压,因为它的蛋白多,电压大不容易分开 根据我们实验室的经验。一般使用的是恒流。压缩胶15mA,分离胶 30mA. 还是恒压好, 100V , - 有个师兄做了块尽一
33、平米的胶,他狂加TEMED 与 AP,疯狂,不过很有效。好嘿人哦! 如果有条件,可以用Bio-rad的电泳仪,就不用封了,非常方便。 不过我研究了bio-rad的制胶装置,然后自己做了一个同样的,效果不错哦! 我下面用的是一般的软泡膜,不过上面有一层透明胶,然后用我自制的夹子把两个玻板夹在上面,灌胶,效果完全与bio-rad 的媲美, 为什么国内就没人搞过这个了,象6.1 那个烂厂,就没有想过人性化吗,十多年了还是老产品。 没有是什么,我要是写下来的错误都可以写好几张纸了 如要做 8% 的分离胶,我知道8% 是指丙烯酰胺在凝胶中的百分比,但是我不知道它是怎么算得的,请大家帮帮我。谢谢! 请教 : 细菌粉碎后是用上清还是沉淀来跑电泳? 请教 ?细菌超声粉碎后用上清还是沉淀跑电泳? zhangxhzhangxi wrote: 请教 ?细菌超声粉碎后用上清还是沉淀跑电泳? 你若是不知道表达的蛋白究竟是在上清,还是在沉淀,那你就得用“ 细菌超声粉碎后上清和沉淀” 一起跑电泳,通过PAGE 胶就晓得究竟 是上清,还是沉淀有你所需要的目的蛋白。 沉淀可适当用蒸馏水稀释,和上清一样的方式处理SDS-PAGE模板。 再次推荐以下好的网站,图文并茂地分析了SDS-PAGE常出现的问题。愿对战友有所帮助! SDS-PAGE: Examples of bad gels
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