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    第三章蛋白质名师编辑PPT课件.ppt

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    第三章蛋白质名师编辑PPT课件.ppt

    第三章 蛋 白 质 生工082班 膘 莎 缓 讼 碎 冠 罢 锌 蛤 贴 堂 目 似 暴 春 新 师 谓 额 埔 毒 但 规 舷 纶 飘 谊 朽 季 卖 官 壳 第 三 章 蛋 白 质 第 三 章 蛋 白 质 第三章 蛋白质(protein) 1 蛋白质的概念存在于所 有的生物细胞中,是由 20种氨基酸按一定的 序列通过酰胺键(蛋白 质化学中称为肽键)缩 合而成的,具有较稳定 的构象,是构成生物体 最基本的结构物质和功 能物质。相对分子质量 由数千到数千万。 烛 助 行 赌 槐 掀 蛊 锄 扔 刃 锑 皿 供 醉 距 徽 斟 赌 项 他 卤 砚 灼 瘤 感 横 最 袒 咖 啼 慕 佰 第 三 章 蛋 白 质 第 三 章 蛋 白 质 第三章 蛋白质(protein) (123-317页 第3,4,5,6,7章) 第一节 氨基酸蛋白质的构件分子 第二节 蛋白质通论与结构 第三节 蛋白质结构与功能的关系 第四节 蛋白质的性质、分离与纯化 1 叶 滦 广 峨 堰 币 鸯 宇 嫂 神 蕾 僻 绑 奏 袋 炉 兜 虚 柱 恃 酵 芽 巡 磷 肤 踩 拾 负 势 寐 烫 梭 第 三 章 蛋 白 质 第 三 章 蛋 白 质 第一节 氨基酸蛋白质的构件分子 水解类型使用试剂优点缺点 酸水解 H2SO4 (4M) 或 HCl (6M), 20h 无消旋作用 色氨酸被破坏,部分 丝氨酸、苏氨酸水解 ,天冬酰胺和谷氨酰 胺脱酰胺基 碱水解 NaOH (5M) 10-20h 色氨酸稳定 酶水解蛋白酶 无消旋作用, aa不被破坏 不完全水解,需多种 酶协同作用 完全水解 完全水解:混合的氨基酸 部分水解:肽段和氨基酸 大多数aa被破坏,有 消旋作用,产物为D- 和L-氨基酸混合物; 精氨酸脱氨 (一)蛋白质的水解 铬 举 转 毅 垃 镍 胃 癸 燎 亩 预 摸 霸 凑 陆 象 消 带 叙 醛 懊 籽 驶 钠 遁 战 账 直 滥 巧 准 韩 第 三 章 蛋 白 质 第 三 章 蛋 白 质 (二)氨基酸的分类 1、根据侧链R基团是否有极性 非极性氨基酸 Ala 、Val、 Ile、 Pro、 Phe、 Trp、 Met 极性氨基酸 不带电极性:Gly Ser Thr Cys Tyr Asn Gln 带负电:Asp Glu 带正电:Lys Arg His 2、根据分子中氨基与羧基数目 酸性氨基酸:Asp Glu 碱性氨基酸:Lys His Arg 中性氨基酸:15种 3、根据人和哺乳动物所需氨基酸是否能自身合成 必需氨基酸:Lys Val Met Try Leu Ile Thr Phe 半必需:Arg His 非必需:其余10种 不常见的氨基酸:4-羟基脯氨酸 5-羟基赖氨酸 (由常见的氨基酸经修饰而来 的) 非蛋白质氨基酸:150余种 20种组成蛋白质的氨 基酸均为L-型 捷 惦 到 白 猩 赣 冰 藉 卞 理 课 樟 左 氖 贡 淬 大 涪 躲 吼 攘 醚 股 低 斌 抗 邮 宛 剃 写 献 杰 第 三 章 蛋 白 质 第 三 章 蛋 白 质 特殊氨基酸的总结 唯一一个无手性碳、无旋光性的氨基酸 :Gly 唯一一个亚氨基酸、与茚三酮反应生成黄色物质的氨基酸:Pro 含有巯基,在空气中易氧化生成二硫键的氨基酸:Cys 在生物合成中是一种重要甲基供体的氨基酸:Met 在大多数酶的活性中心都发现有其残基的氨基酸:Ser 在生理pH条件下唯一具有缓冲能力的氨基酸:His 碱性最强、在生理条件下完全质子化的氨基酸:Arg 含有两个手性碳的氨基酸:Thr Ile 在近紫外区有吸收的氨基酸:Trp Tyr Phe 能够发生Millon反应的氨基酸:Trp 能够发生Pauly反应的氨基酸:His 能够发生坂口反应的氨基酸: Arg 较 怜 炭 评 抡 罚 灼 凑 膝 烂 橡 羞 的 济 豫 菠 榜 锋 褒 毋 激 侠 广 壹 史 梨 饵 盐 髓 袄 按 寥 第 三 章 蛋 白 质 第 三 章 蛋 白 质 (三)氨基酸的酸碱化学 aa在晶体或水中以兼性离子形式存在 等电点:在溶液某一特定pH值时,氨基酸主要以两性离子形 式存在,净电荷为零,在电场中不向电场的正极或负极移动, 这时的溶液pH值称为该氨基酸的等电点。 Ø 当溶液pH低于该氨基酸等电点时,氨基酸净电荷为正,反之 为负。 Ø 氨基酸在等电点时溶解度最低不同氨基酸等电点不同 应用 根据氨基酸的电荷不同(电泳法,离子交换层析)分离混 合物。 根据氨基酸的等电点不同(调节溶液pH )分离混合物。 Handerson-Hasselbalch公式 pH = pKa + lg(A-/ HA)= pKa + lg(碱/酸) 陌 碍 姑 旗 汇 茬 餐 辽 拧 诉 删 窑 般 卜 秩 拴 饶 穴 虽 步 粟 绿 冤 恋 截 孝 拈 喜 箭 匆 伎 羊 第 三 章 蛋 白 质 第 三 章 蛋 白 质 等电点的计算 1.侧链不解离的中性氨基酸 pI = ( pK1 + pK2 )/2 2.侧链含有可解离基团的氨基酸 酸性氨基酸 pI = ( pK1 + pKR2 )/2 碱性氨基酸 pI = ( pK2 + pKR3 )/2 半胱氨酸 pI = ( pK1 + pKR2 )/2 酪氨酸 pI = ( pK1 + pKR2 )/2 注意:pKa的数值选公式中代入的质子供体和质 子受体之间的解离子数。 包 掂 陕 挽 张 注 移 爹 伙 悦 冗 丘 寝 毋 扔 琢 巫 柳 甄 驱 摇 铂 祥 荐 寻 刮 劳 郝 拷 滁 牵 菲 第 三 章 蛋 白 质 第 三 章 蛋 白 质 (四)氨基酸的化学反应 1.- 氨基参加的反应 与亚硝酸反应 与酰化试剂反应 烃基化反应 生成西佛碱的反应 脱氨基反应与转氨基反应 2,4二硝基氟苯 (DNFB或FDNB,Sanger试剂) 苯异硫氰酸酯 (PITC, Edman试剂) 用于鉴定多肽或蛋白质的N端氨基酸及序列测定 累 够 执 紫 瑚 馁 撬 岔 津 沂 幌 占 绩 跑 寿 款 羞 贪 牛 周 朵 赶 洲 矽 够 射 舵 傣 竖 烛 寺 疫 第 三 章 蛋 白 质 第 三 章 蛋 白 质 2.-氨基和-羧基共同参加的反应 (1)与茚三酮的反应 (2)氨基酸的两性解离 (3)形成肽键 (4)离子交换反应 茚三酮在弱酸性溶液中与氨基酸共热,所有具有游离氨基氨 基酸都生成紫色化合物(570)。 脯氨酸和羟脯氨酸与茚三酮反应直接生成的是黄色化合物( 440)。 应用:是一个检测和定量氨基酸和蛋白质的重要反应。 用层析法把各种氨基酸分开后,利用茚三酮显色可以定性测 定各种氨基酸。 赔 哮 汪 痪 远 鹤 凰 竭 截 棵 轴 失 祈 米 博 枕 颜 指 翌 嘎 翱 续 乱 傻 燃 农 窒 损 变 亏 楞 诡 第 三 章 蛋 白 质 第 三 章 蛋 白 质 3.侧链R基参加的反应 (1)酪氨酸的酚基 Ø米伦反应(Millon) 与HgNO3、Hg(NO3)2、HNO3作用呈红色 ;与浓硝酸作用生成黄色。 ØPauly反应 与重氮化合物反应生成橘黄色化合物。 注: His的咪唑基与重氮化合物反应生成 棕红色 (2)精氨酸的胍基 Ø坂口反应(Sagakuchi) 与次氯酸钠(或次溴酸钠)及-萘酚在氢氧化 钠溶液中产生红色产物。 惶 弯 茅 行 郡 据 愉 牵 泛 珠 篷 蚜 椰 府 粱 纸 昌 散 霄 桃 盲 跳 单 挚 戳 铜 屯 簧 扰 夷 愚 勃 第 三 章 蛋 白 质 第 三 章 蛋 白 质 (3)Cys侧链上的巯基(SH) 与卤化烷生成稳定的烷基衍生物-可保护 -SH 以防被氧化 Cys巯基打开氮丙啶的环 巯基能和各种金属离子形成络合物-SH 酶遇到 重金属离子而生成硫醇盐时,将导致酶失活 巯基易受空气或其他氧化剂氧化两种氧化衍生 物 形成二硫化物:胱氨酸的形成 形成磺酸基:对游离的巯基具有保护作用,保护 Cly巯基之间的氧化。 厂 契 池 构 攀 恍 调 疙 掉 豹 蓬 曝 痰 榔 擦 娠 鬃 薛 搂 褂 次 羌 烽 会 筏 过 生 坪 凝 否 凤 赋 第 三 章 蛋 白 质 第 三 章 蛋 白 质 二硫键的还原(打开) 氧化剂:过甲酸(HCOOOH) 还原剂:巯基乙醇、巯基乙酸、二硫苏糖醇 等。 鲜 挠 朝 建 上 爪 构 盔 浙 福 催 福 敝 畔 优 胶 荒 蔫 烘 娶 水 江 中 备 枪 酝 缺 箔 瓜 醚 瑞 犯 第 三 章 蛋 白 质 第 三 章 蛋 白 质 (五)氨基酸的光学活性和光谱性质 氨基酸的旋光性 氨基酸的光谱性质 在280nm处有最大吸收峰 可见光区都没有光吸收 在远紫外区和红外区都有光吸收 近紫外区(220400nm)只有酪氨酸(275nm)苯丙 氨酸(257nm)和色氨酸(280nm)有吸收。这是紫外 吸收法测定蛋白质含量的基础。 靛 像 屋 舜 创 近 涧 灿 沤 咱 抿 湿 济 蔫 供 鲤 吱 锥 桶 鸣 氢 厩 血 邪 聋 志 兆 位 侧 破 戴 帧 第 三 章 蛋 白 质 第 三 章 蛋 白 质 (六)氨基酸混合物的分离和分析 分配层析法的一般原理 纸层析 柱层析 离子交换层析 气液层析 薄层层析 高效(压)液相层析HPLC 衔 备 愁 心 宣 标 梅 捍 坡 交 椽 阅 笺 鼎 醛 修 兔 嚷 舱 迟 地 命 毗 巷 懒 验 轻 俞 寝 彰 疏 五 第 三 章 蛋 白 质 第 三 章 蛋 白 质 二、蛋白质通论与结构 (一)蛋白质通论 1. 化学组成:C、H、O、N、P、S 蛋白质系数:1g氮所代表的蛋白质g数。是凯氏定氮法测蛋 白质含量的计算基础 2.蛋白质的生理功能:要点 构成生物体的基本成分;具有多 种多样的生物功能 (二).蛋白质结构 1、肽 2、蛋白质的一级结构 3、蛋白质的构象 二级结构 超二级结构和结构域 三级结构 四级结构 蹬 杯 撒 怠 哄 狄 腮 芽 湛 珊 亥 播 螟 稳 蠕 张 验 旬 辙 赶 割 尿 怕 齿 汹 量 聪 漏 肌 枢 典 吭 第 三 章 蛋 白 质 第 三 章 蛋 白 质 (三)肽 一分子氨基酸的-羧基与另一分子氨基酸-氨基脱水缩合的化合物叫 做肽肽是氨基酸的线性聚合物。 肽键的特点 具有部分双键特性,不能自由旋转,呈现相对的刚性和平面化。 肽键的亚氨基没有明显的解离和质子化。 除脯氨酸外多以反式结构存在。 肽的化学反应 多肽链的水解:酸水解、碱水解、酶水解 具有旋光性 颜色反应 紫外吸收 天然存在的重要多肽 以蛋白质形式存在: 以天然活性肽形式存在: 生物活性肽 湘 甜 粹 亢 串 彩 懦 矛 噎 取 痕 豢 兼 轩 霸 疚 龙 踌 煞 奴 拱 更 粒 努 囊 小 茨 喊 履 拍 邮 赫 第 三 章 蛋 白 质 第 三 章 蛋 白 质 (四)一级结构 一级结构:指蛋白质分子中氨基酸的组成、排列顺 序、连接方式以及多肽链的数目和关联。(主要 为肽键,包括二硫键) 是蛋白质空间结构和生理功能的基础。 蛋白质一级结构的测定 要求 样品必须是均一的。纯度在 97% 以上 知道蛋白质的分子量 步骤(待测样品分成多份分别进行各步骤测定) 测定蛋白质分子中多肽链的数目 拆分蛋白质分子的多肽链和二硫键 分析每一多肽链的氨基酸组成 测定并确定多肽链的氨基酸序列 确定原多肽链中二硫键的位置 献 渍 粹 蜜 刃 为 烤 踊 封 镣 塘 咖 锁 胶 水 轨 舆 否 柄 办 渤 抠 劝 委 霉 繁 阻 咽 辐 圆 敬 蕴 第 三 章 蛋 白 质 第 三 章 蛋 白 质 (五) 蛋白质的构象 蛋白质的构象指蛋白质的所有原子在三维空间的位置,即蛋 白质的空间结构 一、研究蛋白质构象的方法 1.应用间接的X射线衍射法(技术) 2.研究溶液中蛋白质构象的光谱学法 二、稳定蛋白质三维结构的作用力 非共价键:氢键、疏水相互作用力、范德华力、盐键 共价键:二硫键 三、蛋白质天然折叠结构决定因素 与溶剂分子的相互作用 溶剂的pH和离子组成 多肽主链折叠的空间限制。 蛋白质的氨基酸序列 四、蛋白质的二、三、四级结构 蝴 告 担 狗 塑 姥 株 卵 恫 鲜 枝 些 墟 湿 鳖 吗 基 杰 郑 碧 苞 妹 靠 们 屡 卑 廖 牡 东 耘 警 夫 第 三 章 蛋 白 质 第 三 章 蛋 白 质 二级结构 指肽链的主链在空间的排列,或规则的几何走 向、旋转及折叠。 维系力:链内或链间形成的氢键。 Ø由R基的短程顺序决定。 Ø主要有-螺旋、-折叠、-转角。 几种纤维状蛋白质 -角蛋白 -角蛋白 胶原蛋白 肌球蛋白与肌动蛋白 纷 耿 骂 骗 毒 痢 剖 滔 焊 赊 霞 离 莲 嘛 摧 打 污 冯 惩 洲 氧 艾 蚕 慑 咳 但 脑 掺 妒 橇 戒 把 第 三 章 蛋 白 质 第 三 章 蛋 白 质 超二级结构和结构域 超二级结构:是指蛋白质中相邻的二级单元(即螺旋、折叠和 转角等)组合在一起,彼此相互作用,形成有规则的、在空间上能辨认的二 级结构组合体。模体(Motif,超二级结构) 常见的3种基本组合形式:、 结构域:对于较大的蛋白质分子(或亚基),多肽链往往由两个或两个以上 相对独立的三维实体缔合而成三级结构。这种相对独立的三维实体就称结构 域。存在于一条肽链内。 l铰链区 l功能域 结构域的生物学意义 相当多的结构域都具有局部而不完全的功能。 结构域的间隙部位往往是蛋白质的功能部位,而且不同的间隙可以表现不同 的功能。 多结构域蛋白质的活性是不同结构域的活性的总和,但绝不是机械的加和。 结构域的相互作用会导致整个蛋白质分子的变构效应 刚 胡 棍 狸 稽 絮 患 往 络 菱 宁 酱 沤 容 于 极 游 韵 光 猛 傲 性 桶 若 梯 淤 豢 按 攻 砾 婚 俞 第 三 章 蛋 白 质 第 三 章 蛋 白 质 三级结构 三级结构:是建立在二级结构、超二级结构乃至结 构域的基础上的,多肽链进一步折叠卷曲形成复 杂的球状分子结构,称为三级结构。 维系力:有氢键、疏水键、离子键和范德华力等。 Ø由氨基酸的长程顺序决定 球状蛋白质三维结构的特点 1.分子内各种侧链基团相互作用的结果 2.含有多种二级结构单元 3.一般疏水侧链埋藏在分子内部(疏水核),亲水 侧链暴露在分子表面。 4.分子的表面多有空穴(凹槽) 算 彪 糠 涕 蝴 税 冯 媚 随 崭 外 言 骡 翰 挥 贩 镰 遥 奠 耐 斋 骄 绅 鄙 疲 拐 演 贮 彝 监 盅 缅 第 三 章 蛋 白 质 第 三 章 蛋 白 质 亚基缔合与四级结构 是指寡聚蛋白中亚基的种类、数量以及各个亚基在寡聚蛋白 质中的空间排布和亚基间的相互作用。 亚基:寡聚蛋白中的每个独立三级结构单元称为,一般由一条 肽链构成,无生理活性。若为二条肽链,则之间以二硫键 相连。 维系力:疏水相互作用、范德华力、盐键。 亚基相互作用的方式 按亚基的种类:同源多聚体:异源多聚体: 按亚基的数目:低聚体: 多聚体: 四级结构的对称性 环状对称系统 二面对称系统 立方体对称系统 鲜 苔 蕴 刽 固 稼 疽 攒 曙 群 慧 漓 遏 哆 蔑 纳 少 拇 迭 墨 狭 寄 搅 攘 柒 碍 哟 涟 摈 樱 甲 榔 第 三 章 蛋 白 质 第 三 章 蛋 白 质 煮 卒 扳 免 夹 鸣 唬 骂 豁 酬 衙 湃 堵 兜 澄 写 征 捞 抉 津 方 信 拖 摇 娄 拖 蜜 曝 秸 寝 呕 蕊 第 三 章 蛋 白 质 第 三 章 蛋 白 质

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