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    2018年ld02-细胞中心法则与基因工程技术原理-文档资料.ppt

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    2018年ld02-细胞中心法则与基因工程技术原理-文档资料.ppt

    生命最重要的本质之一是性状特征自上代传至下代遗传。,1,关于遗传,是大家经常讨论的一个话题 孩子会与父母有许多相似之处,如性格、身材高矮、体形胖瘦、肤色深浅、眼睛大小、鼻子高低很多很多都与父母的遗传有关 还有很多疾病的发生也与父母的遗传密切相关。,2,中心法则,遗传信息,信使,性状,中心法则的发展与补充,1.遗传信息从RNA流向RNA,即RNA的复制 2. 遗产信息从RNA流向DNA,即逆转录 (常见于病毒的增殖),复制:亲代DNA或RNA在一系列酶的作用下,生成与亲代相同的子代DNA或RNA的过程。 转录:以DNA为模板,按照碱基配对原则将其所含的遗传信息传给RNA,形成一条与DNA链互补的RNA的过程。 翻译:亦叫转译,以mRNA为模板,将mRNA的密码解读成蛋白质的AA顺序的过程。 逆转录:以RNA为模板,在逆转录酶的作用下,生成DNA的过程。,DNA的结构,四种脱氧核苷三磷酸ATCG (dATP、dGTP、dCTP、dTTP) 2. A=T,C三G 两两配对 3. 每条链由5端向3端延伸 4.两条链反向平行成双螺旋结构,与DNA复制有关的酶和蛋白质 原料:四种脱氧核苷三磷酸(dATP、dGTP、dCTP、dTTP) 模板:以DNA的两条链为模板链,合成子代DNA。 酶:DNA聚合酶,DNA连接酶,拓扑异构酶等 能量:ATP 引物:一小段RNA(或DNA)为引物,DNA的复制 观看视频1 观看视频2,总结: 目的细胞生长、增殖,遗传信息 特点半保留复制(保证遗传的稳定性);一条链连续复制、另一条链不连续(与DNA合成方向5-3有关),端粒与寿命,细胞生长、增殖端粒是真核生物染色体线性DNA分子末端的结构,像两顶帽子那样盖在染色体两端,因而得名。端粒在维持染色体和DNA复制的完整性方面有重要作用。随着细胞分裂DNA复制次数的增加,端粒的长度是在逐渐缩短的,当端粒变得不能再短时,细胞不再分裂而死亡。,Cell:早期端粒酶失活将加速衰老 JCI CHEST J:端粒突变更易患肺部疾病 The FASEB Journal:逆转生命时钟,延长细胞端粒 Genes Devel:科学家发现控制细胞衰老的开关端粒酶 PLoS One:揭示焦虑症、过早衰老与染色体端粒的缩短直接相关 PNAS:个体的端粒长度可能预测寿命长短,端粒与寿命,观看视频:端粒与寿命,可见,端粒的缩短限制了人类的生命跨度,但另一方面也能限制癌症的发生,所幸我们还能做点什么,因为端粒缩短的程度也受到你的生活方式与环境的影响。,Nature Genetics:研究发现端粒更长增患脑癌风险 Cancer Epidem Biomarker:端粒长度越短患胰腺癌风险越高 PNAS:家庭贫穷儿童端粒变短 British Journal of Sports Medicine:少坐一会儿,端粒就能变长吗? Circulation:运动有助于保持白细胞端粒长度 PLOS Genetics:咖啡或啤酒可能会影响端粒长度,定义:以RNA为模板,按照RNA中的核苷酸顺序合成DNA称为逆转录,由逆转录酶催化进行。,逆转录合成DNA,逆转录酶是多功能酶: RNA指导的DNA聚合酶活性 DNA指导的DNA聚合酶活性,逆转录酶也和DNA聚合酶一样,沿53方向合成DNA,并要求短链RNA作引物。,cDNA:几乎所有真核生物mRNA分子的3末端都有一段polyA,当加入寡聚dT作为引物时,mRNA就可作为模板,在逆转录酶催化下在体外合成与其互补的DNA,称为cDNA。,逆转录酶发现的理论和实践意义: 不能把“中心法则”绝对化,遗传信息也可以从RNA传递到DNA。促进了分子生物学、生物化学和病毒学的研究,为肿瘤的防治提供了新的线索。目前逆转录酶已经成为研究这些学科的工具。,1983年,发现人类免疫缺陷病毒(human immune deficience virus,HIV),感染T淋巴细胞后即杀死细胞,造成宿主机体免疫系统损伤,引起艾滋病( acquired immunodeficiency syndrome,AIDS),RNA的生物合成,一、RNA聚合酶 二、RNA的转录过程 三、转录后加工 四、RNA的复制,转录:以DNA的一条链为模板在RNA聚合酶催化下,按照碱基配对原则,合成一条与DNA链的一定区段互补的RNA链的过程称为转录。 以四种核糖核苷三磷酸酸(NTP)为底物,形成3、5 -磷酸二酯键相连接。,二、RNA的生物合成:,一、关于RNA合成过程中的几个概念:,1、模板链(无义链):指导RNA合成的那条链。 2、编码链(有义链):与模板链互补的那条链。 3、启动子:DNA分子上结合RNA聚合酶,并形成 转录起始复合物的区域。 4、终止子:促进转录停止的特殊 DNA序列。 可分两类:依赖因子的和不依赖 因子的。,二、真核生物与原核生物基因的区别:,1、真核生物基因内部有内含子是断裂的、不连续的,而原核生物内部则没有。 2、真核生物基因一般是独立的,而原核则一般是由多个基因联合在一起而形成操纵子结构。如:大肠杆菌的乳糖操纵子。,真核生物内含子结构,原核生物操纵子结构,观看视频:乳糖操纵子模型,操纵子Operon : 基因表达的协调单位,它们有共同的控制区和调节系统。包括在功能上彼此有关的结构基因和控制部位.,二、RNA的转录过程,RNA的转录过程:(以大肠杆菌为例) 起始位点的识别 转录起始 链的延伸 转录终止,(1)起始位点的识别,RNA的合成不需要引物。体外实验证明,不含亚基的核心酶会随机地在一个基因的两条链上启动,当有亚基时就会选择正确的起点。 亚基起着识别DNA分子上的起始信号(启动子指RNA聚合酶识别、结合和开始转录的一段DNA序列)的作用。启动子的结构至少由三部分组成:-35序列提供了RNA聚合酶全酶识别的信号;-10序列是酶的紧密结合位点(富含AT碱基,利于双链打开);第三部分是RNA合成的起始点。,(2)转录起始,RNA聚合酶全酶扫描解链区,找到起始点,然后结合第一个核苷三磷酸。加入的第一个核苷三磷酸常是GTP或ATP,很少是CTP,不用UTP。所形成的启动子、全酶和核苷三磷酸复合物称为三元起始复合物,第一个核苷三磷酸一旦掺入到转录起始点, 亚基就会被释放脱离核心酶。,因子仅与起始 有关,RNA的合 成一旦开始, 便被释放,(3)RNA链的延伸,DNA分子和酶分子发生构象的变化,核心酶与DNA结合比较松弛,可沿DNA模板移动,并按模板顺序选择下一个核苷酸,将核苷三磷酸加到生长的RNA链的3-OH端,催化形成磷酸二酯键。转录延伸方向从5 3,(4)转录终止,在DNA分子上(基因末端)提供转录停止信号的DNA序列称为终止子(terminators),它能使RNA聚合酶停止合成RNA并释放出RNA。,需要因子(终止因子,协助RNA聚合酶识别终止信号)帮助, 因子能与RNA聚合酶结合但不是酶的组分,它的作用是阻止RNA聚合酶向前移动,于是转录终止,并释放出已转录完成的RNA链。,不依赖于因子。强终止子序列有两个明显的特征:( 1 )在终止点之前具有一段富含G-C的回文区域。(2)富含G-C的区域之后是一连串的dA碱基序列,它们转录的RNA链的末端为一连串U(连续6个)。,三、RNA的转录后加工 在细胞内,由RNA聚合酶合成的原初转录物(primary transcript)往往需要一系列的变化,包括链的裂解、5和3末端的切除和特殊结构的形成、核苷的修饰、以及拼接和编辑等过程,才转变为成熟的RNA分子。此过程总称为RNA的成熟或称为RNA的转录后加工。,mRNA前体的加工: 原核生物的mRNA转录后一般不需要加工,转录的同时即进行翻译(半寿期短)。亦有少数多顺反子的mRNA需要核酸酶切成小单位,然后再翻译。 真核生物mRNA(半寿期较长)原初转录物很大,在加工过程中形成许多分子大小不等的中间物,它们被称为核内不均一RNA(heterogeneous nuclear RNA,hnRNA),需要进一步进行加工修饰转化为mRNA。加工包括: (1)hnRNA被剪接,把内含子(DNA上非编码序列)转录序列剪掉,把外显子(DNA上的编码序列)转录序列拼接上(真核生物一般为不连续基因)。 (2)3端添加polyA “尾巴”; (3)5端连接“帽子”结构(m7G5ppp5NmpNp-); (4)分子内部的核苷酸甲基化修饰。,观看视频:RNA的合成,总结: 目的释放遗传信息(mRNA)以表达性状与功能 特点受到精细化调控,有时空特异性,蛋白质的生物合成,蛋白质合成体系的重要组成部分 蛋白质的合成过程 蛋白质合成后的运送,蛋白质与氨基酸,六伴穷光蛋:硫、半、光、蛋半胱、胱、蛋(甲硫)氨酸含硫氨基酸 酸谷天出门:酸、谷、天谷氨酸、天冬氨酸酸性氨基酸 死猪肝色脸:丝、组、甘、色丝、组、甘、色氨酸一碳单位来源的氨基酸 只携一两钱:支、缬、异亮、亮缬、异亮、亮氨酸支链氨基酸 一本落色书:异、苯、酪、色、苏异亮、苯丙、酪、色、苏氨酸生糖兼生酮 拣来精读之:碱、赖、精、组赖氨酸、精氨酸、组氨酸碱性氨基酸 芳香老本色:芳香、酪、苯、色酪、苯丙、色氨酸芳香族氨基酸 不抢甘肃来:脯、羟、甘、苏、赖脯、羟脯、甘、苏、赖氨酸不参与转氨基的氨基酸,DNA能够编码20种天然氨基酸,它们几乎是细胞生命中一切氨基酸的合成单体,牛胰岛素蛋白结构,20种结构各异、物理化学性质不同的氨基酸,赋予了蛋白质无限可能的结构与空间构象,mRNA和遗传密码,mRNA由DNA经转录合成,携带着DNA的遗传信息,然后作为模板通过翻译将遗传信息传递给蛋白质,即由它直接决定多肽链中AA的顺序。所以mRNA为模板的蛋白质合成过程被称为翻译或转译。 mRNA分子中四种不同碱基(A、G、C和U)构成特定顺序决定蛋白质分子中20种氨基酸所构成的序列。 大量实验证明mRNA上相邻三个碱基编码一种氨基酸,因而被称为碱基三联体或密码子。 四种核苷酸,能有43 =64组密码子,遗 传 密 码,阅读方向为5-3,遗传密码的特点 密码子的方向性 密码子的阅读方向及它们在mRNA由起始信号到终止信号的排列方向均为5-3,与mRNA链合成时延伸方向相同。 密码子的简并性 64-3=61个代表20种氨基酸,仅甲硫氨酸、色氨酸只有一个密码子。一个氨基酸可以有几个不同的密码子,编码同一个氨基酸的一组密码子称为同义密码子。这种现象称为密码子的简并性。,密码子的连续性(读码)(无标点、无重叠) 从正确起点开始至终止信号,密码子的排列是连续的。既不存在间隔(无标点),也无重叠。在mRNA分子上插入或删去一个碱基,会使该点以后的读码发生错误,称为移码,由这种情况引起的突变称为移码突变。,密码子的基本通用性(近于完全通用) 对于高等、低等生物都适用,只有一个例外:真核生物线粒体DNA。(P397)一些原核生物中利用终止密码翻译AA(UGA-Trp硒代半胱氨酸),起始密码子和终止密码子 64种密码子中,AUG为甲硫氨酸的密码子,又是肽链合成的起始密码子,UAA,UAG,UGA为终止密码子,不编码任何氨基酸,而成为肽链合成的终止部位(无义密码子)。 密码子的摆动性(变偶性) 如丙氨酸:GCU,GCC,GCA,GCG,只第三位不同 ,显然密码子的专一性基本取决于前两位碱基,第三位碱基有较大灵活性。发现tRNA上的反密码子与mRNA上的密码子配对时,密码子的第一位、第二位碱基配对是严格的,第三位碱基可以有一定变动,这种现象称为密码的摆动性或变偶性(wobble)。IA、U、C配对。,mRNA是蛋白质生物合成的直接模板。 tRNA的作用体现在三个方面:3CCA接受氨基酸;反密码子识别mRNA链上的密码子;连接多肽链和核糖体。,tRNA有两个关键部位: 3端CCA:接受氨基酸,形成氨酰-tRNA。需ATP提供活化氨基酸所需的能量。 与mRNA结合部位反密码子部位(tRNA的接头作用),tRNA凭借自身的反密码子与mRNA链上的密码子相识别,把所带氨基酸放到肽链的一定位置。,合成场所rRNA及核糖体 核糖体是由几十种蛋白质和几种rRNA组成的亚细胞颗粒,其中蛋白质与rRNA的重量比约为1:2。核糖体是蛋白质合成的场所。,原核和真核生物的核糖体的构成,rRNA序列成为微生物生物学种属鉴定的主要依据,蛋白质肽链的合成步骤,一、氨基酸的活化 二、肽链合成的起始 三、肽链的延伸 四、肽链合成的终止与释放 五、真核细胞蛋白质生物合成 六、肽链合成后加工和折叠,一、氨基酸的活化,氨基酸在掺入肽链前必须活化。氨基酸的活化是指各种参加蛋白质合成的氨基酸与携带它的相应的tRNA结合成氨酰-tRNA的过程。活化反应在氨酰-tRNA合成酶的催化下进行。,氨基酸活化的总反应式是:,氨基酸+ATP+tRNA +H2O 氨酰-tRNA+AMP+PPi,氨酰-tRNA 合成酶,因此,氨基酸的活化是消耗能量ATP与载体tRNA连接的过程。,二、肽链合成的起始 起始密码子的识别:以原核生物大肠杆菌为例 起始密码子AUG上游(5端)约10个核苷酸处有一段富含嘌呤的序列(SD序列、RBS),原核生物核糖体30S小亚基上的16SrRNA3端富含嘧啶的序列能与之互补配对,这样30S亚基能与mRNA结合,识别起始密码子AUG。,在肽链合成起始时,首先是核糖体小亚基与mRNA上的核糖体结合位点识别结合,然后,大亚基与小亚基结合,形成完整的核糖体(70S起始复合物)。,消炎药:链霉素、新霉素、卡那霉素与原核细胞30S核糖体结合,阻止50S核糖体亚基与之结合,从而抑制其蛋白质合成。,蛋白质合成抑制剂,三、肽链的延伸,1、进位 新的氨酰-tRNA进入A位。需要消耗GTP。,2、转肽 在肽酰转移酶的作用下P位点上fMet-tRNAf的甲酰甲硫氨酸从相应的tRNA上解离下来,其-COOH(高能酯键)与刚进入A位的氨酰-tRNA上的-NH2形成肽键,此时A位点携带一个二肽。,P,A,5,3,3、移位 在移位酶的作用下,核糖体沿mRNA5 3方向移动,每次移动一个密码子的距离,结果使原来在A上的肽酰-tRNA移到了P位点,同时一个新的密码子进入空的A位。,P,A,P,P,A,A,以上三步为一个延伸循环,肽链每掺入一个氨基酸就重复一次延伸循环。肽链从N-C合成,四、肽链合成的终止与释放 当终止密码子出现在A位时,终止因子结合在A位,肽链合成终止。,RF1:识别终止密码子UAA和UAG RF2:识别终止密码子UAA和UGA RF3:具GTP酶活性,激活RF1和RF2活性,协助肽链的释放,终止因子的结合使肽酰转移酶活性变为水解酶活性,肽基不转移给A位tRNA,而转移给H2O,并把已合成的多肽链从核糖体和 tRNA上释放出来,无负荷的tRNA随机从核糖体脱落,该核糖体立即离开 mRNA,在IF3存在下,消耗GTP而解离为30S 和50S非功能性亚基。再重复下一轮过程。,蛋白质的合成是一个高耗能过程 AA活化 2个高能磷酸键(ATP) 肽链起始 1个(70S复合物形成,GTP) 进位 1个(GTP) 移位 1个(GTP,第一个氨基酸参入需消耗3个(活化2+起始1 ) 以后每掺入一个AA需要消耗4个(活化2 +进位 1个 +移位1个)。,(三)蛋白质合成后的修饰 蛋白质合成后的几种修饰方式:氨基末端的甲酰甲硫氨酸的切除、肽链的折叠、氨基酸残基的修饰、切去一段肽链。,蛋白质合成的场所是核糖体,原料是20种L-氨基酸,反应所需能量由ATP、GTP提供,此外还有Mg2+、K+ 等金属离子参与。 蛋白质合成体系主要由mRNA、tRNA、rRNA、有关的酶以及几十种蛋白质因子组成。,中心法则的总结 观看视频:DNA 转录与翻译,关于转基因,转基因是指利用基因工程技术将外源(非同种)基因DNA整合进目标物种基因组中,遵照目标物种的中心法则,进而有效表达出相应的产物(多肽或蛋白质),从而定向地改变目标物种的功能与性状。,转基因食品(GMO)引起了世界范围的担忧与争议: 解决粮食短缺生存是第一位 抗病虫害、减少农药使用、避免环境污染 增加食物营养与品质,担忧: 基因漂流影响其他物种,其携带的抗生素标记基因可能导致的物种的抗药性 对生物多样性造成威胁、转基因作物有可能演变为农田杂草,观看视频: GMO的争议,放映结束,感谢观看!,

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