计算机在化学中的应用-chemdraw专讲.ppt
计算机在化学中的应用,ChemDraw专讲,化学分子结构式的绘图,绘制2D 分子结构的软件: ChemWindow, CS ChemDraw, ISIS Draw 和ChemSketch 等 绘制3D分子结构的软件：CS Chem3D, HyperChem, WebLab ViewerPro, ArgusLab 和RasMol等。（CS Chem3D 和HyperChem 还集成了分子力学、分子动力学、半经验以及从头算量子化学计算的部分）,Chemoffice 2006,ChemDraw Ultra 10.0,Chem3D Ultra 10.0,ChemFinder Ultra 10.0,主要内容,ChemDraw简介 示例练习 化学结构的绘制 文本说明及原子标记 轨道、符号、箭头、弧等 高级绘图技巧 ChemDraw在线信息,ChemDraw简介,点位：移动鼠标直到鼠标的光标放到所要进行操作的位置，如果选择的位置在图形结构中的键、原子、线等的上面，一般出现黑方块，称之为光标块，选择块或操作块。,光标块,常用术语,选择：用鼠标的光标选中某种选择，使对象产生光标。选择对象并不意味着动作，只是标记要操作的对象和点位； 单击：快速按下鼠标键(左或右键)，然后快速抬起； 双击：快速操作两次单击； 拖动：由三部分动作组成按下鼠标左键选择对象，移动鼠标，将被选的对象移动到指定位置后抬起鼠标；,ChemDraw简介,“键单击”：按下特殊的键和单击鼠标键同时进行。如，“Shift单击”意思是按下”Shift”键和单击鼠标键； “键拖动”：按下特殊的键和鼠标键，移动鼠标。如，“Shift拖动”意思是按下”Shift”键和拖动鼠标光标。,ChemDraw简介,图形工具板,状态/信息栏,编辑区,滚动栏,菜单栏,工具栏,ChemDraw简介,ChemDraw简介,ChemDraw简介,ChemDraw简介,ChemDraw简介,ChemDraw简介,ChemDraw简介,ChemDraw简介,ChemDraw简介,ChemDraw简介,ChemDraw简介,ChemDraw简介,ChemDraw简介,ChemDraw简介,ChemDraw简介,ChemDraw简介,ChemDraw简介,ChemDraw简介,ChemDraw简介,ChemDraw简介,ChemDraw简介,ChemDraw简介,ChemDraw简介,ChemDraw简介,ChemDraw简介,快捷键,命令,灰色表示命令未激活,小三角 表示 子菜单,省略号表示新对话框,文件格式介绍,1 CD Template(*.ctp, *.ctr)用于保存模板文档,2 ChemDraw (*.cdx)ChemDraw原本格式，是一个公共标记 的文件格式，易被其它程序建立和解释,3 ChemDraw Steyl Sheet(*.cds)用于存储文件设置和其它物体,4 Connection Table(*.ct)一种实例格式，存储关于原子与元素、 系列编号、X和Y轴、键序、键类型等的连接和联系的列表。是 用于多类应用程序间互换信息的通用格式,文件格式介绍,5 DARC-F1 (*.fld)Questel DARC系统中存储结构的原本文件 格式,7 ISIS Reaction(*.rxn)MDL开发的格式，用于存储元素反应信息,8 ISIS Sketch(*.skc)在Windows或Macintosh环境下，存储并传输 到另外的ISIS应用程序中,6 DARC-F1 Query(*.flq)Questel DARC系统中存储查询的原本 文件格式,文件格式介绍,9 MDL MolFile (*.mol)MDL(分子设计有限公司) MolFile文件 格式用于其它一些在Windows、Macintosh和Unix环境下的化学 数据库和绘画应用软件,11 Jcamp Spectra(*.jdx，*.dx)图谱文件格式，可读入紫外、 质谱、红外、核磁等数据文件,12 MSI ChemNote(*.msm)一种ASCII文本文件，可以用于像 ChemNote一类的应用程序,10 Galactic Spectra(*.spc)银河图谱文件格式,文件格式介绍,13 SMD 4.2 (*.smd)ASCII文本文件，一般用于检索化学文摘 数据库,14 Windows Metafile(*.wmf)图片文件格式，可以将ChemDraw 图片传输到其它应用程序中，如Word。WMF 文件格式含有 ChemDraw的结构信息，可被ChemDraw早期版本编辑,示例1反应方程式,示例2绘制中间体结构,示例3复杂环结构,示例4Fischer葡萄糖结构,示例5透视图形,示例6Newman结构,示例7立体化学,化学结构的绘制,化学结构的绘制,文本说明及原子标记,原子标记,原子标记,键编辑,化学命名限制,多于一桥以上的桥环（如：三环） 自由基 非标准价态化合物 螺环体系 含同位素的化合物 聚合物 生物分子,轨道、符号、箭头、弧等,轨道工具,化学符号,箭头工具,箭头的使用,指示电荷转移,指示键角键长,绘图元素、基元及弧,多中心结构,二茂铁,结构的展开与调整,结构的展开与调整,结构整理要点,结构整理要点,检查化学结构的信息,分析结果窗口,结果粘贴,名称、结构的相互转化,预测结果,预测结果,预测结果,预测结果,不定结构的连接,ChemDraw在线信息,ChemDraw在线信息,ChemDraw在线信息,ChemDraw在线信息,ChemDraw在线信息,编号显示,ChemDraw在线信息,ChemDraw在线信息,ChemDraw在线信息,ChemDraw在线信息,ChemDraw在线信息,ChemDraw在线信息,ChemDraw在线信息,ChemDraw在线信息,ChemDraw在线信息,ChemDraw在线信息,ChemDraw在线信息,ChemDraw在线信息,ChemDraw在线信息,ChemDraw在线信息,ChemDraw在线信息,ChemDraw在线信息,ChemDraw在线信息,ChemDraw在线信息,ChemDraw在线信息,ChemDraw在线信息,文献全文HTML格式,ChemDraw在线信息,文献全文PDF格式,作业1,作业2,作业3,二茂铁,作业4,绘制减压蒸馏装置图 结构化学第二版P255图5.14；图5.15和P257图5.17 (即乙烯加氢反应;丁二烯和乙烯环加成生成环己烯的反应和丁二烯与环丁烯的分子轨道图）,
