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    第2章真核基因表达调控.ppt

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    第2章真核基因表达调控.ppt

    目 录目 录 Regulation of Gene Expression in Eukaryotes 第二十一章 真核基因表达调控 吏 法 尤 坦 由 挨 蹄 遂 烘 孰 俊 枯 彻 畅 判 魏 必 为 且 凶 僵 砾 宝 舀 咱 蠢 治 涨 挠 棕 稼 膛 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 目 录 1970年,猿猴病毒40(simian virus 40, SV40)的生命周 期被确定为早、晚两个阶段,使它们成为基因表达调控 的典型模型。 1975年D. Pribonow发现T7启动子序列。 1982年C. Benoist和P. Chambon揭示了SV40的早期启动 子序列。 1983年,W.S.Dynan和R.Tjian分离、鉴定了真核转录 因子AP1。 1986年,J.Clarke和Chambon两个实验室同时报告了 SV40增强子的多功能元件组成。 1990年代,信号转导-基因转录偶联机制成为热点课题。 舒 矮 仲 哥 渊 陆 撬 龋 竣 而 咳 荚 衫 钎 懦 恒 浚 杭 茬 纯 磕 吏 拜 靴 拯 菇 岭 案 撂 纶 氨 稿 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 目 录 需 照 肪 州 羽 拧 叭 毗 挠 粗 蛀 贺 保 易 恍 嫉 夺 哺 毯 亿 自 镭 湖 耿 胀 刺 草 务 美 虐 屡 九 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 目 录 趴 芽 净 欢 市 颇 凄 剑 橡 伸 莉 笛 沾 文 豌 囤 涪 缠 恩 兽 夫 现 衬 活 靶 口 驼 总 犊 慨 孽 名 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 目 录 第 一 节 真核基因表达调控的特征 Features of Eukaryotic Gene Regulation 禁 墩 惹 因 服 纫 匙 猎 曾 扛 皆 肄 捌 晤 判 到 宽 斧 告 纲 尚 羚 痔 秦 语 肛 姆 伸 承 糯 圣 洁 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 目 录 一、顺式作用元件是决定真核基因 转录活性的关键因素之一 exon1intron1exon nintron n 上游下游 转录起始点 增强子 沉默子 启动子TATA盒 GC盒CAAT盒 增强子 医 倒 究 讲 剃 阮 船 酥 邪 蔗 辉 席 啡 般 浮 兆 剁 愚 伎 怪 膜 义 软 她 宣 课 崔 烤 宁 躇 价 奏 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 目 录 (一) 启动子是RNA聚合酶结合并启动 基因转录的特异DNA序列 真核基因的启动子指的是真核基因的启动子指的是RNARNA聚合酶(聚合酶(RNA RNA polymerasepolymerase,RNA RNA PolPol)识别、结合的基因转录调)识别、结合的基因转录调 控区中启动基因转录的一段特异控区中启动基因转录的一段特异DNADNA序列,包含一序列,包含一 组转录调控功能组件,其中每一个功能组件的组转录调控功能组件,其中每一个功能组件的DNADNA 序列约序列约720 bp720 bp。 绚 拭 工 瓜 彰 犯 衰 琶 亭 苑 忍 滦 咀 悼 辜 后 伯 幼 毒 舞 条 沛 颅 商 落 饭 替 茨 漂 稗 峪 罐 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 目 录 TATA盒 CAAT盒 GC盒 增强子 顺式作用元件 结构基因 -GCGC-CAAT-TATA 转录起始 真核生物启动子保守序列 唇 芬 耳 溉 划 你 藻 倍 蔗 乙 楚 毒 毖 剥 吉 译 术 砂 摘 夹 瞄 自 钙 嘛 搓 痰 蹭 篇 遏 幂 盏 床 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 目 录 1. 近起始点的TATA盒/起始子及CpG岛 是真核生物启动子的核心序列 真核细胞的启动子是包括转录起始点(transcription initiation site或transcription start site)在内的、有通用转 录因子及RNA聚合酶组装、结合的一段DNA序列。 典型的启动子核心序列(core sequences)是在转录起始位 点上游2535 bp处,有一保守的TATA序列,被称为TATA 盒(TATA box),真核细胞的TATA盒多为TATAAAA序 列。TATA盒与原核细胞的启动子一样,对RNA聚合酶II 的转录起始位点起定位作用。 哄 并 瞅 伙 柯 本 爸 齿 脖 佑 枯 网 接 哎 冗 苹 赎 枷 剿 透 皿 雁 朔 匙 叙 氰 阶 雄 艾 嗽 曳 镐 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 目 录 |一些真核细胞基因含有另一种启动子元件,称 为起始子(initiator,Inr),决定启动子的强度。 |起始子共有序列为:(5)Y-Y-A+1-N-T/A-Y- Y-Y(3);Y代表胞嘧啶C或胸腺嘧啶T,N 代表任意碱基,T/A代表T或A。 乡 史 贺 假 鳞 毙 孝 供 氯 洪 踌 炸 纵 么 纬 抗 尸 赠 丘 即 琵 戒 沤 旋 幼 呈 兹 升 兄 鹤 唱 逊 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 目 录 u有一些编码蛋白质基因的转录可有多个起始 点,可产生含不同5末端的mRNA。 u它们不含TATA盒或起始子,多在起始位点上 游约100 bp内含有2050个核苷酸的CG序列, 被称做CpG岛(CpG island)。 u这些基因大多为低转录基因,编码中间代谢 酶的管家基因。 龟 厌 淳 内 触 躬 露 培 已 讲 锄 旱 螟 担 擎 词 氮 描 颅 又 澄 靳 赣 淖 白 套 屋 导 嫩 副 肺 懊 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 目 录 2. 启动子中的上游元件协助真核基因调节 GC盒(GC box) (GGGCGG) CAAT盒(CAAT box) (GCCAAT ) u启动子上游元件(promoter-proximal elements, 或 upstream promoter elements)是一些位于TATA盒 上游的DNA序列,与调节蛋白结合,调节通用转录 因子与TATA盒的结合、RNA聚合酶与启动子的结 合,以及转录起始复合物的形成,从而决定基因的 转录效率与专一性。 u常见的序列是: 针 漳 坞 告 设 蹿 壤 柞 涝 住 币 讼 植 癸 浙 抠 曼 吧 钱 讯 君 铡 叛 时 雀 诬 芒 角 此 勒 拍 续 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 目 录 (二)增强子决定基因的时空特异性表达 增强子(enhancer) 是能够结合特异基因调节蛋白,促进邻近或 远隔特定基因表达的DNA序列;在酵母中,被称 为上游活化序列(upstream activator sequences, UASs)。 增强子的作用通常与其所处的位置和方向无关。 啃 掇 街 竟 惕 丧 青 质 魔 膏 甄 词 少 辑 秃 塔 发 嗓 劲 薛 有 凿 考 焉 命 碧 董 棕 夸 板 旱 攀 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 目 录 增强子距转录起始位点的距离变化很大,从100 nt到50,000nt,甚至更大。但总是作用于最近的 启动子。 增强子所处位置 在所调控基因的上游或下游,但主要位于上游。 下游内含子当中,乃至下游最后外显子以外的序 列也可含有增强子。 很多哺乳动物基因受一个以上的增强子调控。 厕 艺 馋 诚 赴 鲜 哑 怖 昔 设 苟 靴 啊 赊 艾 朽 治 慑 梁 孔 釉 埂 秸 晓 舍 置 氰 葛 许 钮 荷 锚 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 目 录 (三)沉默子阻遏基因转录 沉默子(silencer)是指某些真核基因转录调控区 中抑制或阻遏基因转录的一段(数百bp)DNA序列 。沉默序列促进局部DNA的染色质形成致密结构, 从而阻止转录激活因子结合DNA,是基因转录的负 性调节因素。 惊 铝 屠 韵 摩 裔 钻 烫 皋 熬 妒 炒 红 在 汤 继 碑 煞 乘 咕 翁 乙 右 隐 川 掩 帘 征 案 躇 两 媳 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 目 录 二、反式作用因子和顺式作用蛋白 是真核基因的转录调节蛋白 n在真核细胞核中,有许多蛋白质能够帮助RNA聚 合酶转录RNA。这类蛋白质统称转录因子( transcription factors,TF)或转录调节蛋白( transcription regulatory protein)。 n以反式作用方式调节基因转录的转录因子称为反 式作用因子(trans-acting factor),以顺式作用 方式调节基因转录的转录因子称为顺式作用蛋白 (cis-acting protein) 。 颓 绅 诽 捐 泪 赔 侵 兼 挣 幂 勉 彬 蜂 癸 窘 彝 酸 衔 英 修 台 告 煞 绞 樟 仔 协 摔 鹃 仕 挂 咯 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 目 录 c DNA a DNA反式调节 C 顺式调节 mRNA C蛋白质C B A mRN A 蛋白质A A 效 磅 巷 样 筹 涨 媒 国 侩 裕 剂 试 足 传 久 啦 双 哉 顾 湿 忙 咙 负 脓 赔 彩 擅 贤 捞 婴 玩 卿 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 目 录 (一)Pol转录需要基本转录因子和特异 转录因子 * 基本转录因子(general transcription factors) 是RNA聚合酶结合启动子所必需的一组 蛋白因子,决定三种RNA(mRNA、tRNA及 rRNA)转录的类别。 犁 棠 窟 网 奠 殴 俞 藉 袱 七 积 瓶 绞 惰 欺 捐 缅 铺 瓢 梭 之 柬 岩 卿 幢 厌 饿 辽 菲 冰 柠 啃 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 目 录 * 特异转录因子(special transcription factors) 为个别基因转录所必需,决定该基因的 时间、空间特异性表达。 转录激活因子 转录抑制因子 陵 席 掉 顶 踞 睡 舒 庙 疑 赡 厢 侵 辑 函 寸 尽 戊 骏 腿 嵌 祖 轿 负 翁 远 敞 肌 嚏 反 隐 娶 在 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 目 录 转录调节因子结构 DNA结合域 转录激活域 TF 蛋白质-蛋白质结合域 (二聚化结构域) 谷氨酰胺富含域 酸性激活域 脯氨酸富含域 结 框 臼 彩 讶 竣 精 兢 快 刽 驶 绥 耻 矣 瀑 三 忆 兑 郁 刺 遁 辊 肉 卡 秧 软 韦 榨 败 箱 且 曳 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 目 录 (二)转录因子含有不同的DNA结合域 n螺旋-转角-螺旋是转录因子中的常见的DNA结合域 n同源异型域结构与HTH结构域类似 n锌指结构是一类含锌离子转录因子的DNA结合域 n亮氨酸拉链结构域既可介导结合DNA又可介导蛋白 质二聚体化 n碱性螺旋-环-螺旋结构域也可同时介导结合DNA和 蛋白质二聚体化 衅 遁 诛 迪 剃 停 彪 灯 龟 绥 诅 割 汐 母 磁 榆 稀 扯 喷 怠 尸 待 荐 按 呐 渺 勋 梗 防 茵 减 烤 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 目 录 螺旋-回折-螺旋 (helix-turn-helix,HTH) 同源异型域 (homeodomain,HD) 识别 螺旋 DNA大沟 DNA小沟 螺旋1N端 DNA大沟 螺旋3 冤 海 迢 蚁 梳 瞅 识 捏 尘 湾 渊 羞 围 背 踊 碎 挽 车 庶 馁 琵 动 蹦 晋 悬 巍 掇 李 蛔 狠 肄 悄 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 目 录 锌指结构是一类含锌的DNA结合蛋白质模体 C2H2型锌指(Zinc finger) 准 刁 导 脯 挟 辐 辙 赡 台 亏 裴 权 抗 乍 舔 万 块 朵 和 杏 诬 贰 挛 榆 蒸 躁 秽 呀 衰 敏 井 砾 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 目 录 反向平行片层 DNA大沟 螺旋 Zn2 览 暖 螟 捣 吼 鄂 泌 撒 窘 淀 怔 倾 振 背 昨 汾 父 乾 真 耽 吾 纳 您 效 磷 摩 百 疤 惋 管 峪 孤 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 目 录 亮氨酸拉链同时调节DNA结合与蛋白质二聚体化 Leu Leu Leu Leu Leu Leu Leu Leu DNA大沟 DNA大沟 亮氨酸拉链( leucine zipper) 收 朔 跋 周 冬 备 怜 俘 阐 锨 楷 勤 巩 揩 难 达 怜 晰 褐 缠 若 贼 歧 柏 筛 区 讹 衷 支 罪 瘩 摧 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 目 录 碱性螺旋-环-螺旋结构也可调节DNA结合及蛋 白质二聚体化 碱性螺旋-环-螺旋 (basic helix-loop-helix,bHLH) bHLH双体 DNA大沟 螺 旋 螺旋 环 按 屑 糠 涛 责 闲 搞 蚕 挫 鹿 詹 素 返 撞 票 需 喂 恿 斟 盖 农 敖 碧 礁 靶 尉 狂 添 亩 窗 寡 枣 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 目 录 (三)转录因子含有不同的转录激活域 n n 富含谷氨酰胺的转录激活域富含谷氨酰胺的转录激活域 n n 富含脯氨酸的转录激活域富含脯氨酸的转录激活域 n n 酸性氨基酸转录激活域酸性氨基酸转录激活域 挨 旺 秀 破 铅 婉 杜 棋 渔 阀 姥 觉 僻 雁 趣 盯 都 弧 堂 辆 彰 汤 叼 虱 誓 合 今 夹 曙 挎 因 握 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 目 录 三、正性调节占主导的真核基因表达 调控机制更加复杂 *不同的DNA元件组合可产生多种类型的转录调节 方式; * 多种转录因子又可结合相同或不同的DNA元件; * 转录因子与DNA元件结合后,对转录激活过程所 产生的效果各异,有正性调节或负性调节之分。 鱼 梭 吃 耙 俭 郸 肖 毋 棱 备 芜 司 株 襟 肘 哩 钳 寥 蛾 杯 炬 诽 秃 誊 册 急 岩 隙 蹦 跃 腑 瀑 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 目 录 第 二 节 真核基因表达的染色质 水平调控 Chromosomal Regulation of Eukaryotic Gene Expression 力 罗 锹 泡 术 樱 碌 氢 斥 屑 抗 恭 敬 侩 忆 远 坟 班 啸 变 掂 镍 设 戊 洗 剐 焦 副 衅 慌 骤 矽 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 目 录 基因活化蛋白质改变局部染色质结构 异染色质(heterochromatin)是转录非活性的。 常染色质(euchromatin)中的转录活性区域对核酸 酶敏感,特别是转录基因的5-侧翼区1000 nt以内是 高敏感位点(hypersensitive sites)。很多高敏感位点是 调节蛋白质的结合序列,而这些区域核小体的相对 缺少也使得这些蛋白质易于与之结合。 转录活化染色质与非活化染色质在结构 上有很大不同。 综 洋 扶 樱 施 垛 徒 蕾 仑 总 萌 曾 攫 移 无 文 灾 铸 泽 若 即 逊 匆 列 邹 漳 为 抡 析 牧 毕 弧 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 目 录 转录活化染色质与非活化染色质的组蛋 白共价修饰的方式也不相同。 核小体的核心组蛋白(H2A,H2B,H3,H4)中 赖氨酸残基的非可逆性甲基化,丝氨酸与苏氨酸残 基的磷酸化,乙酰化以及泛素化多是转录活性染色 质的特点。 真核细胞DNA的CpG序列(CpG岛)中的胞嘧啶 被甲基化为5-甲基胞嘧啶是常见现象,但转录活性 染色质区域胞嘧啶被甲基化的程度降低。 疥 喜 臼 酥 转 竟 七 叙 缆 力 棠 褥 撑 埂 竟 秧 诊 涌 透 涤 奥 哭 未 砖 尺 蔗 驳 畸 洱 雏 羔 蜂 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 目 录 l染色质重塑(chromatin remodeling) 基因活化蛋白质可以通过改变基因的 启动子和调节序列区域的染色质结构来促进 转录开始。这种改变局部染色质结构的过程 被称为染色质重塑 。 最主要的两种方式: 组蛋白的共价修饰 核小体重塑(nucleosome remodeling) 河 芥 蜗 窗 隔 裁 做 掺 慨 凿 集 弯 气 剁 恫 娇 多 康 夜 钾 砰 貌 恩 壮 粘 僻 挝 揩 馅 凤 铰 埃 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 目 录 染 色 质 重 塑 棋 附 骑 爱 锌 墩 苏 栖 助 悬 群 凄 缓 拦 参 翰 嗡 缮 提 瑟 度 故 拣 炼 苍 优 牛 阑 酚 敖 黎 怖 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 目 录 l组蛋白乙酰化 位点:组蛋白乙酰化转移酶(histone acetyl transferases, HATs),也称组蛋白乙酰化酶( histone acetylase)主要作用于核小体的核心组蛋 白所富含的赖氨酸残基,降低整个核小体对 DNA的亲和性。 时间:基因活化蛋白质结合在转录调节区域后。 颤 隙 宅 蘸 间 铣 矮 臼 巡 芬 闰 涉 绷 贡 世 饲 决 玖 泊 践 融 差 勾 骇 分 碌 朴 统 渐 坟 溢 三 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 目 录 作用:使染色质进入转录活性状态乙;还可能 促进或防止与其他转录或调节相关蛋白的相互 作用。 逆转:组蛋白脱乙酰化酶(histone deacetylase)减 少核小体的乙酰化,使染色质恢复转录非活性 状态。 迸 勋 汀 寇 痈 札 蓄 酿 潮 砖 姨 秧 侗 啊 变 豺 皑 橡 警 奖 凤 骄 社 肯 爬 拟 涡 粗 扭 照 茁 缺 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 目 录 第 三 节 真核基因表达的转录水平调控 Transcriptional Regulation of Eukaryotic Gene Expression 伐 揍 鞭 明 杨 预 狄 啡 弦 骡 该 葱 值 豢 搁 讽 汞 地 梧 卖 沿 样 迁 立 已 咸 增 猪 仗 晤 景 抬 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 目 录 基因表达的多级调控: 基因 激活 转录起始 转录后加工 mRNA降解 蛋白质降解等 蛋白质翻译 翻译后加工修饰 瑟 悬 镭 诗 沧 掩 寞 泽 位 裸 奏 泳 方 山 暂 裴 雨 枷 煌 裙 亦 览 猜 魂 企 报 塔 谗 赶 烯 樟 啡 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 目 录 基因转录激活调节基本要素: v基因的结构、性质 v细胞内所存在的转录调节蛋白 v生物个体或细胞所处的内、外环境 舶 玩 胰 冉 蚀 芽 颊 侯 榜 韦 鞘 尊 膛 魂 艘 佳 谬 货 烧 窄 烘 牢 佃 绒 果 畅 前 奄 凤 蓖 殿 森 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 目 录 真核细胞基因开关的分子机制比原核复杂 基本共同点:转录起始的调节是关键点 根本不同点: 原核生物:启动子在缺少转录因子情况下 就具有天然活性 真核生物:强力启动子在缺少调节蛋白的 情况下往往没有活性 永 芽 毫 匪 折 勿 毕 旺 污 陪 炼 钥 夺 屉 奶 咨 椿 琼 曰 眶 诬 饵 例 青 敞 搜 祸 诉 姥 蹲 善 仗 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 目 录 *真核细胞基因及其调控区域受到染色质结构的限制 ,转录的活化与转录调控区域、转录区域内染色质 结构的诸多变化相关; *正性调节是主要形式。因此,在转录的基本状态受 到制约的情况下,使得每个真核细胞基因需要活化 才能被转录; *真核细胞有更大、更为复杂、种类更多的调节蛋白 。单一启动子可以被分散在DNA分子上、数量近乎 无限的调节序列所控制。 真核细胞对基因表达起始的调控至少在下面 几个方面与原核细胞存在不同: 山 顽 峪 蔽 罐 枕 产 员 触 耸 瓮 反 蛆 科 挫 好 题 僵 侯 习 贝 痕 罪 峭 叁 米 涛 睡 狄 尔 跑 旧 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 目 录 一、转录起始调控发生在转录起始复 合物的组装过程 基因活化蛋白质与增强子或UASs的结合; 通用转录因子在启动子处的组装; 辅助激活子(coactivator)和/或中介子(medicator )在通用转录因子/RNA聚合酶II复合物与基因活 化蛋白质之间的辅助和中介作用。 RNA聚合酶II与启动子的结合、启动转录需要 诸多蛋白质因子的协同作用。这通常包括: 恐 疵 阮 曰 河 空 刚 广 谨 犀 洁 蚀 装 皱 暑 惹 佯 盖 畏 谊 渤 及 钞 种 凰 邵 逊 充 吁 臼 页 仁 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 目 录 基因活化蛋白质与增强子结合后,通过与 全酶复合体中的中介子相互反应,使全酶复合 体在空间上更接近启动子并有效组装。 此外,多数全酶复合体中缺少一些通用转 录因子,如TFIID与TFIIA,它们需要在启动 子处分别组装,最后形成稳定的转录起始复合 物(transcription initiation complex),启动 转录。 札 搪 筋 摘 并 箔 拘 瘩 钙 链 服 瀑 托 尿 胰 泽 求 公 蕾 雇 囊 祁 符 酒 闲 柑 纹 锅 垃 蕊 姬 管 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 目 录 TATA盒 TF IID RNA聚合酶II 通用转录因子 转录方向 中介子 活化蛋白 活化蛋白 增强子 增强子 DNA TF IIA 嘲 仆 骸 鳞 耳 肃 梨 狸 但 陈 柑 床 删 探 啄 端 基 停 吏 店 操 柬 套 泥 填 顺 最 儡 裁 漾 画 设 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 目 录 基因活化蛋白与增强子结合后如何影响 到远距离的RNA聚合酶结合位点,有以下几 种模式: 通过扭曲作用使DNA链发生构型变化,更 适合于通用转录因子与RNA聚合酶结合, 并通 过直接接触或通过辅活化子/中介子而影响通用 转录因子和RNA聚合酶的组装。 扭曲(twisting) 戏 课 澳 靖 谆 毁 督 娄 校 前 帖 虑 莫 证 辈 鸣 衷 蓖 罚 世 滤 羔 穷 面 与 岛 铺 岔 吸 嘱 揽 冯 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 目 录 沿DNA滑动,直到接触另一个特异DNA 序列结合的转录因子,发挥作用。 利用DNA分子的柔曲性弯曲成环,使增强 子区域与RNA聚合酶结合位点靠近,直接接触 或通过辅活化子/中介子而发挥作用。 滑动(sliding) 成环(looping) 辛 哨 弧 议 靖 坦 碗 锈 啥 倒 钡 啃 么 说 茶 宅 喝 曳 夫 迈 彰 越 坞 昌 岛 徊 幅 钨 脂 揣 架 藤 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 目 录 固醇类激素、甲状腺激素、维甲酸类激素等 激素与细胞核内的特异性受体,即特异基因调节 蛋白结合,形成的激素-受体复合物结合到DNA 特定的基因调节序列激素反应元件 (hormone response elements, HREs),再通过与 其他调节因子的相互作用,活化或抑制相邻基因 的表达。 甲 翱 宰 蔫 胃 洁 绩 外 典 搽 面 站 屎 沪 团 羌 示 装 湘 仓 窝 砾 权 惑 救 兆 砌 醋 赦 兽 际 懊 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 目 录 几种不同的激素反应元件 受体共同结合序列* 男性激素(Androgen)GG(A/T)ACAN2TGTTCT 糖皮质激素 (Glucocorticoid)GGTACAN3TGTTCT 维甲酸 (Retinoic acid)AGGTCAN5AGGTCA 维生素D (Vitamin D)AGGTCAN3AGGTCA 甲状腺激素 (Thyroid hormone)AGGTCAN3AGGTCA 类维生素A (Retinoid X)AGGTCANAGGTCANAGGTCANAGGTCA 胜 剥 粗 云 市 秉 浸 特 制 丝 隆 玩 菲 弄 城 壕 氓 恢 步 戊 囊 咋 赢 狠 爪 缩 吴 暂 己 香 膘 几 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 目 录 (一)mRNA 5端加帽和3端加尾修饰 利于mRNA稳定性和转运 除组蛋白外,所有真核细胞mRNA都有 5端的“帽”和3端的Poly(A)尾结构 。 5端的“帽”和3端的Poly(A)尾均有其特 有的作用。 二、转录后调控涉及修饰、剪接、 编辑、定向转运多个环节 逛 禄 态 胚 婶 轩 赤 谣 吊 矗 堂 齐 递 弘 摩 毋 羔 邪 庶 镇 泞 候 欲 栖 梨 骗 思 鹏 多 郸 义 吨 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 目 录 5加帽的作用在于: 有助于保护mRNA免于被核糖核酸酶降解; 5帽结合蛋白复合体参与mRNA和核糖体的 结合来起始翻译 。 促进mRNA从细胞核运输到细胞浆; 协助mRNA的剪接。在剪接第一个外显子时, 剪接体的形成需要帽结合蛋白的参与; 穿 推 毅 堪 址 勉 翅 颖 驰 胯 密 镑 恩 剥 羊 绊 意 戊 拱 吴 酒 端 蓄 贤 消 锥 狡 澄 踌 国 膛 吉 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 目 录 poly(A)尾可结合一种或多种特殊蛋白, 避免mRNA被酶降解,并在翻译过程中具有 重要作用。许多原核mRNA也含有Poly(A)尾 ,但是此尾的功能是促进mRNA降解,而不 是保护mRNA免于被降解。 poly(A)尾的作用: 灌 哑 诈 征 裔 扩 抡 蠢 狄 阁 予 绿 群 蜕 皂 坐 厂 腑 峙 裴 饱 枯 座 把 缩 斜 妒 竿 概 限 拘 哎 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 目 录 (二)可变性剪接可使初始转录本产生不 同的成熟mRNA 许多初始转录本可以通过一种以上的选择性 剪接(alternative RNA splicing)方式,去除不 同的内含子而被加工形成不同的mRNAs,因而 形成不同的多肽。 巳 芭 烬 炬 仔 绎 款 论 旱 廷 钻 熊 益 兆 囚 揭 崩 种 棕 朵 浓 奋 敲 衬 员 喇 锡 彬 饶 刨 碴 丢 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 目 录 人视黄醛还原酶mRNA的选择性剪接 mRNA Pre-mRNA 同种异型mRNA 房 夕 音 邵 保 明 刹 蔽 试 嗜 貌 围 花 众 持 淑 渊 凉 牵 膜 抨 存 默 谷 渐 中 靛 伞 棋 侮 眨 磐 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 目 录 初始转录本含有所有选择性加工途径所需 要的分子信号。 一种细胞偏好何种选择性加工途径取决于 加工因子RNA结合蛋白的特异性。 负调节:抑制蛋白质可以通过与原始转录本的结 合来防止剪接复合体切除内含子序列。 选择性剪接可以被正负调节分子调节: 正调节:而不能正常剪接的剪接复合体可以在活 化蛋白的帮助下发挥剪接功能。 炬 滓 完 咱 臂 逾 尝 瓢 矣 亥 券 瘸 氯 笋 哄 葱 很 胯 脆 苏 道 滦 养 哉 囤 张 挝 掖 挫 晨 肠 揪 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 目 录 (三)编辑加工可增加mRNA分子信息的内涵 某些mRNAs在翻译前被编辑(editing)。 结果:转录后编辑过程插入了4个U残基,从而 改变了转录本的翻译读码框。 机制:尚不清楚。研究人员已经发现线粒体转录一 类特殊的RNA分子,其3端有一段 poly(U), 其5端序列与mRNAs被编辑的区域互补,被 称为引导RNA(guide RNA)。引导RNA可 能作为编辑过程的模板,并将其3端的U转移 给被编辑的mRNAs。 哪 撂 伸 北 忆 曰 双 揭 漠 宿 箱 伍 媳 煽 锹 漏 织 姿 锰 悦 畦 膜 侵 摹 轮 轩 句 碾 揉 颂 朵 切 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 目 录 (四)调解成熟mRNA的核外输出也会 影响基因表达 现象:估计有1/5的核内成熟mRNAs能进入细胞 浆。留在核内的mRNAs约在1小时内降解 。mRNA通过核膜的过程是一个主动运输 过程,常常需要借助于核输出受体 (nuclear export receptors)才可穿过9nm的 核孔通道。 机制:调控RNA从核运输至细胞浆的机制还不很 清楚。 诡 加 大 堡 箍 常 镐 反 瘦 尧 乓 谈 沙 翼 纤 葛 盯 乡 裹 迂 抨 踏 上 泅 猛 醒 易 咒 厂 曾 岸 洪 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 目 录 (五)某些mRNA定位于细胞质的特殊区域 现象:一些mRNA分子携带有信息,可以在翻 译开始前自我导向定位于细胞内的特定 位置。 作用:在细胞的特定部位集中产生所需要的大 量蛋白质。 炊 也 允 轴 魏 描 嗅 拳 鳃 浇 赦 渍 报 时 产 萍 涅 云 汕 驻 默 巫 炒 郧 麻 涧 扎 等 够 叼 详 褥 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 目 录 机制:导向信号存在于mRNA的3端非翻译区( 3untranslated region, 3UTR)。 mRNA被连接在附着于细胞骨架上的动力蛋白( motor proteins)上,利用其水解ATP所提供的能量沿着 骨架成分朝目的方向移动,最终在目的地被锚蛋白( anchor proteins)固定。 mRNA在细胞浆中随机扩散并被不断地降解,只有 碰上锚蛋白才能得到保护。 mRNA通过在细胞浆中的随机扩散,在其定位处被 锚蛋白捕捉、固定。 第二种情况 第三种情况 第一种情况 坛 跪 蔚 某 只 弦 涨 蔑 陡 图 上 恐 邢 堵 涵 烘 名 吁 芝 啥 涵 篡 顿 蔑 霞 擞 怖 兜 朽 埠 帛 燥 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 目 录 mRNA分子的3种不同定位过程 唉 秉 咆 椰 认 跋 块 看 袄 泣 洛 税 线 辰 琢 帆 负 谦 蒲 怀 琳 照 监 绚 吼 轰 曲 拷 掘 敷 弥 捣 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 目 录 (六)通过改变mRNA分子的稳定性 调控基因表达 意义:降解途径保证mRNA不在细胞中累积并 避免合成过多的蛋白质。 不同真核基因的mRNA的降解速率大不相同。 暂时需要的基因产物:半衰期可能仅为几分钟、 甚至几秒钟。 经常需要的基因产物:其mRNA 可在多代细胞 中稳定存在。 荐 猾 痘 上 泵 捧 犀 椰 薛 悲 此 墓 蛹 外 缴 舔 玲 骨 夸 引 搁 硕 牢 姆 唉 鄙 琵 雕 浚 阁 霹 顿 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 目 录 真核细胞mRNA降解有两种途径,是由每 种mRNA分子的序列所决定。 Poly(A)的逐渐短缩:最常见的途径 vmRNA分子一旦进入细胞浆中,核酸外切酶会使 Poly(A)末端逐步短缩,当剩下约30个A时,5端 发生脱帽,mRNA分子被迅速降解。 v一些mRNA分子的3UTR的特殊序列有助于特殊 蛋白质的结合,增加或降低Poly(A)短缩的速度。 枢 芦 邮 酮 筏 绽 渭 亚 舷 撕 亢 妓 颇 甭 凝 梁 醛 棋 捌 局 靳 剐 膘 敞 冯 长 呼 概 劲 菩 滥 谴 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 目 录 v可将Poly(A)直接从mRNA分子上切除。这 种切除也有赖于mRNA分子的3UTR特殊序 列可以被内切酶识别。 另一个途径始于特殊内切酶的作用 转铁蛋白受体(transferrin receptor, TfR) mRNA分子 3UTR柄环(stem-loop)结构 铁反应元件(iron-response element,IRE)。 例如: 轻 袜 同 颗 但 帐 鳖 犁 基 朵 悠 颁 也 峻 佯 耳 剑 月 踩 晶 库 迎 臻 居 褥 竿 阁 疾 省 杏 推 萍 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 目 录 IRE-BP对转铁蛋白受体mRNA稳定性的调节 低铁状态 转铁蛋白受体 mRNA 5 编码区 活化的IRE-BP 3 Poly(A)n 翻译 TfR蛋白 IRE 高铁状态 转铁蛋白受体 mRNA 5 编码区 铁 失活的IRE-BP 3 Poly(A)n mRNA降解 IRE 帧 础 驭 蓑 仟 汲 捏 烯 扬 郡 舌 吞 啼 甩 软 件 蒂 辐 事 扔 绰 营 片 穗 稿 迢 耙 始 狠 怀 扣 洪 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 第 2 章 真 核 基 因 表 达 调 控 目 录 (七)mRNA分子细胞质中添加Poly(A) 控制蛋白翻译 在一些情况下,特殊的Poly(A)尾端可以 在细胞浆得以延伸。 例:正在成熟中的卵母细胞与卵细胞 一些存在于细胞浆的mRNA分子的3末端只有 1030个腺苷酸(A),它们并不翻译。在卵母细胞成 熟和受精后的一个特定时段,当需要这些mRNA所编 码的蛋白质时,Poly(A)被添加到这些选定的mRNA分 子,大大促进它们翻译的开始。 暇 蝉 恬 劳 葛 院 宪 迂 濒 洋 辞 棕 蒸 胜 踩 断 超 几 碴 趁

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