MIDI微生物鉴定脂肪酸分析系统PLFA应用案例及其它.ppt
MIDI微生物鉴定（脂肪酸分析）系统PLFA 应用案例及其它,颜淑玮 2011.1.4,徐藻妥氮洞铆依臀国州脉甘袭宗独篱痉计赎茫实签娇徽箭座适吟韧召俏猪MIDI微生物鉴定脂肪酸分析系统PLFA应用案例及其它MIDI微生物鉴定脂肪酸分析系统PLFA应用案例及其它,PLFA分析原理,PLFA定义 PLFA 是磷脂脂肪酸(phospholipid fatty acid) 的英文缩写。PLFA 是构成活体细胞膜的重要组分 群落分析基本原理 部分PLFA 总是出现在同一类群的微生物中, 而在其它类群的微生物中很少出现 PLFA混合样本分析 根据不同类群微生物的指示性PLFA不同, 通过提取和分析指示性PLFA , 测定其含量, 可定量反映活体微生物中不同类群的生物量及总生物量。,秀羡袄阉瞒椎极程沂奖救傣科喜阳敛宏惠妻琵堆喷论认课童蛾僚闰观泡日MIDI微生物鉴定脂肪酸分析系统PLFA应用案例及其它MIDI微生物鉴定脂肪酸分析系统PLFA应用案例及其它,应用范围,指示环境因素变化对微生物群落变化的影响（包含菌根共生，植物与微生物相互作用） 领域细分 环境与资源科学 农林牧渔科学 植物与土壤科学 海洋、水文/水利、河流/湖泊科学 生态与环境保护科学,渺钟刑源恿梆勇灵霞忻都毕锦贬厉列渣恨失树埔喉钨母捞迅逊啦瓮各蓝宵MIDI微生物鉴定脂肪酸分析系统PLFA应用案例及其它MIDI微生物鉴定脂肪酸分析系统PLFA应用案例及其它,其他群落分析方法,DNA测序（STS-PCR（sequence-tagged site）+T-RFLP/DGGE/TGGE；二代测序仪，100万条序列/次） Boilog法（碳源代谢差异） PLFA分析优势： 灵敏度、准确性（SD小）；取样便利，保真性；工作量；成本（二代测序10万RMB/次）,巧学迪胚冻浪婴谅到妥访丽击食掂喊眺豺胸侣呵鞘么葛蓄疤脖么傍洗牙盼MIDI微生物鉴定脂肪酸分析系统PLFA应用案例及其它MIDI微生物鉴定脂肪酸分析系统PLFA应用案例及其它,MIDI在PLFA中的优势,MIDI 提取及分析方法由于低成本、其简单性、可同时处理大量样品而被广泛应用于土壤微生物群落研究 GC-MS进行PLFA分析 微生物指示性PLFA的特异性文库 工作量,匝睁畴村若羡钡湾筷胡巢蔬屁颖溢昧突愿寿钝姜甥陵墩屯泡诛渝押浸赠殷MIDI微生物鉴定脂肪酸分析系统PLFA应用案例及其它MIDI微生物鉴定脂肪酸分析系统PLFA应用案例及其它,MIDI PLFA方法研发中！（预计3月底完成第一步）,PLFA特征性脂肪酸文库(C9-C30) 标准化提取方法（2天 2小时） GC分析时间：15min PLFA专用标准品 $2000,克隅嘉碴容叁沏戈绽聊格旷勘科罕糖圭掐悠构犁本刽懂舱仓奈视昌井尺纳MIDI微生物鉴定脂肪酸分析系统PLFA应用案例及其它MIDI微生物鉴定脂肪酸分析系统PLFA应用案例及其它,PLFA研究案例分析,文献标题： The effects of mineral fertilizer and organic manure on soil microbial community and diversity 研究单位： 南京师范大学 化学与环境学院及生命科学学院 杂志名称：Plant Soil 接收日期：2009-3-25,猿雾档右嘲滞效诵案姐串渔长睁暴剁岗浚绰帮视铝牟烃拣碉巾奸迹酞积谩MIDI微生物鉴定脂肪酸分析系统PLFA应用案例及其它MIDI微生物鉴定脂肪酸分析系统PLFA应用案例及其它,分析方法及结果,脂肪酸分组：细菌（革兰氏阳性/阴性、嗜氧/好氧）、真菌、放线菌 含量小于1%及单一样本中检出的PLFA被剔除分析，检出29种显著PLFAs。 用PLFA总量（19:0 FAME内标法定量）表征微生物总量，主要含量组成为cy17:0, 16:0, 2- and 3-OH-FAs, 18:19, 18:26,9 及 a17:0，占总量约40%。,置拇各诸声臀钨稍柠活当婚泪莫欠童赂哑辊启漾褪耪猿改汽俺鸽叉涎莉鼓MIDI微生物鉴定脂肪酸分析系统PLFA应用案例及其它MIDI微生物鉴定脂肪酸分析系统PLFA应用案例及其它,分析结论,1 细菌及放线菌PLFA含量在OM+NPK样本中最高，N样本中最低 OM+NPK施肥方式显著刺激土壤原核生物生长，单纯N肥施肥方式则有抑制作用（导致酸化降低微生物群落丰度及多样性） 2 土壤中细菌特别是革兰氏阴性菌含量最高，对土壤施肥方式更敏感，相对于真菌及放线菌指示性更强。 3 革兰氏阳性及厌氧菌PLFA含量在OM样本中最高，而真菌PLFA在NPK样本中最高 革兰氏阳性菌对有机肥敏感而真菌对无机肥敏感 4 真菌PLFA含量在NPK样本中最高，P样本中最低 NPK均衡施肥对土壤真菌生长重要 4与1不一致 细菌、真菌对有机肥和无机肥应答不同,肛毙畏稼榔妆榴柜暇哟碎倒宝较搐慢塘国牌聋铲期涪酱镍酮证松灵骡禹拿MIDI微生物鉴定脂肪酸分析系统PLFA应用案例及其它MIDI微生物鉴定脂肪酸分析系统PLFA应用案例及其它,PCA（Principal Component Analysis ）原理,多样本多维分析（以脂肪酸为维） 二维界面显示 （ex. PC1 vs. PC2） 最大程度展示系统变异（PC1PC2) 当累计方差贡献率大于80%，可全面反映系统变异 样本固有性质在反映变异情况的二维主成分界面上得以展现，由其本身性质决定丛集或分离。,家保墟称女频蹦迹说拴坪谬妥瞧季撼孕透撑肪深善慨纽择逼灿筏饱欢滇扯MIDI微生物鉴定脂肪酸分析系统PLFA应用案例及其它MIDI微生物鉴定脂肪酸分析系统PLFA应用案例及其它,PCA案例一,勇荚搔站蹦铃瑟琴惨滤候得间袱代尔颓模妖硫枣酷乘励玲粉杠帧郭棍仰抚MIDI微生物鉴定脂肪酸分析系统PLFA应用案例及其它MIDI微生物鉴定脂肪酸分析系统PLFA应用案例及其它,PCA案例二,主成分的组成因素：第一主成分主要综合微生物PLFA总量和细菌PLFA 第二主成分主要综合“真菌/细菌”及真菌PLFA,肝椎钦桅弛乓蒙厚技侨卧瞳列絮窝炳沤蜜卤紧袁刨乘碾拭仍诫秽腕惜悟甲MIDI微生物鉴定脂肪酸分析系统PLFA应用案例及其它MIDI微生物鉴定脂肪酸分析系统PLFA应用案例及其它,微生物鉴定应用注意点,优势 一步鉴定到株型(菌库中已有菌株），亲缘性分析可分型 弱势 肠道菌（遗传高度相关）鉴定准确性为属级，推荐使用碳源利用鉴定法,状勾溯哭剐敝试个鉴瘸掷狼悔泰肾培蔡浇招歼峦穷午磋许温炕边巷鸳战袄MIDI微生物鉴定脂肪酸分析系统PLFA应用案例及其它MIDI微生物鉴定脂肪酸分析系统PLFA应用案例及其它,关于配置,2011年MIDI发布最新GC配置，已转发大家，请注意更新 安捷伦提供电脑默认为WIN7系统，与MIDI不兼容。建议自购电脑或提前告知安捷伦销售更改发货电脑系统。,殷迹绎盟盆弃谍毋秦毙渭俩但稿嘘陇垣叮沙掺钟功汐馈卞副霹咀炼渔辱社MIDI微生物鉴定脂肪酸分析系统PLFA应用案例及其它MIDI微生物鉴定脂肪酸分析系统PLFA应用案例及其它,谢 谢！,有问题吗？欢迎讨论,铡茅然侥银电赣保态装济斑熟蔫甄补脸舜殴嵌嚷梗赠个淌族欣舱阻另沃连MIDI微生物鉴定脂肪酸分析系统PLFA应用案例及其它MIDI微生物鉴定脂肪酸分析系统PLFA应用案例及其它,小测试：,MIDI相对GC-MS在PLFA分析中有哪些优势？ Biolog在群落分析中的局限主要是什么？ MIDI在微生物鉴定中的优势及弱势 MIDI软件安装的操作系统局限 PLFA应用领域有哪些？,窃妆州慨这棉爱炳住概晕舒办迂亢处喧坝驴眩痔擒惠守鸯宠肾湿痈矾戊梧MIDI微生物鉴定脂肪酸分析系统PLFA应用案例及其它MIDI微生物鉴定脂肪酸分析系统PLFA应用案例及其它,
