医学文献检索概述.ppt

仇 晓 春,上海交通大学医学院信息资源中心,医学文献检索概述,提 纲,医学文献检索概况 循证医学概论 循证医学资源检索及数据库介绍,一、医学文献检索概况,涉及人体的医学研究必须遵从普遍接受的科学原则，应对科学文献和相关资料全面了解，并有充分的实验和动物试验（如有必要）的基础上进行。 -世界医学协会赫尔辛基宣言 11/30,1997年1月至2005年9月Pubmed每月的文献检索数量增长惊人,医学文献的种类,全文型数据库(一次文献) Elsevier、BMJ、EBSCO host、Springer、Wiley、 BMC、PLoS CHKD、万方数据、维普 文摘型数据库(二次文献) Medline(Pubmed)、Embase、SCI CBMdisc、CBA 事实型数据库(三次文献) Cochranelibrary 、 Clinical Evidence、 EBMR、Uptodate,常用医学文献数据库的类型,拖曳网自然语言搜索引擎,智能信息资源整合系统,Pubmed数据库,PubMed是美国国家医学图书馆(NLM)下属的国家生物技术信息中心(NCBI)开发的、基于WWW的医学数据库查询系统。 网址： http:/www. pubmed.gov http:/www.pubmed.com http:/www. pubmed.org http:/www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed,Pre-Medline,Medline,New Data,Collect,PubMed,Process,PubMed与Medline,PubMed基本检索,自由词检索 主题词检索 布尔逻辑检索 字段限制检索 著者检索 刊名检索 日期或日期范围检索 截词检索 强制检索,对于自然医学语汇中同义词、近义词学名与俗名的处理 例： Cancer，Tumor * Neoplasms (近义词) German Measles * Rubella (同义词) Vitamin C * Ascorbic Acid (学、俗名) Apoplexy * Cerebrovascular Disorders(同义词) Deoxyribonucleic Acid * DNA (繁、简称) 非典 *严重急性呼吸道综合症 乙酰水杨酸，阿斯匹林 *阿司匹林,MeSH作用1：规范自由词,MeSH作用2，扩展下位词（范畴表）,等级关系: Diseases C Neoplasms C4 Neoplasms by Site (NON MeSH) C4.588 Digestive System Neoplasms C4.588.274 Gastrointestinal Neoplasms C4.588.274.476 Intestinal Neoplasms. C4.588.274.476.411 Colonic Neoplasms C4.588.274.476.411.306 Colorectal Neoplasms C4.588.274.476.411.306.416 HereditaryNonpolyposis .C4.588.274.476.411.306.416.250,C6.240.476,按照学科性质，词义范围的上下类属和派生关系，将字顺表中的主题词分别划分为15个大类，依次用A-N及Z代表。,代表疾病类Diseases,肿瘤,消化系统疾病,检索限定选择,款目词,主题词树状结构,副主题词,检索结果,检索结果显示,http:/www.embase.com,Embase数据库,OVID数据库,TAYLOR & FRANCIS,SPRINGER,WILEY,ELSEVIER,CABi,Annual Reviews,LAWRENCE ERLBAUM,SIAM,NATURE,PALGRAVE,Karger,THIEME,ACS; RSC,KLUWER,BLACKWELL,AIP; APS IOP,IEEE CS,IEEE; ASCE; ASME; PEP,AAAS,SPIE,MIT,CORNELL (EUCLID),ROCKEFELLER,OUP,PROJECT MUSE,BIG FIVE,Mediums,University Press,Societies,FASEB,SWETS,OViD,EBSCO,ProQuest,Databases,西文全文型数据库：,Publisher,Manuscript,Only those who can afford expensive subscriptions or licences have access,Result:,传统期刊的出版模式,Publisher,Everyone has access All use is fair use,Result:,Manuscript,开放存取期刊的出版模式,Open Access Journal,features works of exceptional significance in all areas of biological science, from molecules to ecosystems, including works at the interface with other disciplines, such as chemistry, medicine, and mathematics Public Library of Science impact factor: 14.7,BioMed Central(BMC),Sinomed.imicams.ac.cn,Sinomed.imicams.ac.cn,二、循证医学概论,循证医学(Evidence-Based Medicine,EBM)遵循证据的科学。是指对病人的诊治必须基于当前可以得到的最佳临床研究结果，结合医生的经验，考虑病人的实际情况，并在尊重其选择和意愿前提下，制定对病人的治疗措施。,最佳临床研究结果,医生的经验,病人的实际情况,制定治疗措施,1793年, George Fordyce Attempt to improve the evidence of medicine 1948年，BMJ “A medical research council investigation. Streptomycin treatment of pulmonary tuberculosis” Br Med J. 1948:770-782(第一个RCT） 1966年,Meta分析方法被引用与医学领域对干预效果的评价Solari ME A method of combining the results of several clinical trials. Clinical Trials Journal, 1966,3:537-545,二、循证医学概论,1979年，系统性回顾研究(Systematic Review)方法学的建立,Archibald Leman Cochrane (1909-1988),二、循证医学概论,有益处,可能有益处,利弊相当,可能无益处,未知有效性,可能无效或有害,二、循证医学概论,三、循证医学资源检索,提出一个可以被回答的问题 检索文献资料 严谨的研判所找到的证据 整合临床上的专业并实际应用于个案的 诊疗 效果评估, Patient: 目标是哪些病人？ Intervention: 使用了哪一种治疗方法？ Comparison: 要跟什么比？ Outcome: 要比什么？,，分析整理信息需求：,PICO模型,三、循证医学资源检索,对于中风后的病患来说，使用抗凝血剂的治疗，比起使用抗血小板药物的治疗，是否在中风的复发率会有不同的影响,Patient: Stroke Intervention: Anti-coagulation Comparison: Anti-Platelet / Placebo Outcome: Recurrent rate,PICO模型,PICO检索,http:/babelmesh.nlm.nih.gov/pico.php,循证医学证据级别,原始研究证据 Medline、 Embase、 CBM 二次研究证据 EBMROVID、 Cochrane Library、 ACP Journal Club、 Dynamed、Uptodate 、 Best pratice ,三、循证医学资源检索,循证医学系统评价范例,0引言 1 资料与方法 1.1 纳入/排除标准 1.1.1 研究类型 1.1.2 研究对象 1.1.3 干预措施 1.1.4 测量指标 1.2 排除标准 1.3 检索策略 1.4 纳入试验的筛选 1.5资料提取 1.6 文献质量评价 1.7 统计分析方法 2 结果 2.1 文献筛选过程 2.2纳入研究的基本情况 2.3 纳入研究质量评价 2.4 Meta分析结果 3 讨论 4参考文献,循证研究的检索顺序,二次研究证据: 1, System(系统) 2, Summaries(概要) for 背景知识 UpToDate Clinical Evidence First Consult ACP Medicine 3, Synopses(精要) for 背景知识 ACP Journal Club Evidence-based medicine 4, Syntheses(系统评价) for 证据评读 Cochrane library- CDSR et al PubMed-Clinical Queries 的 Systematic Review 原始研究证据: 5, Studies (原始论著) for 证据评读 Cochrane Library - Clinical trials PubMed -Clinical queries的 Clinical study search Medline、Ebmase ( limit功能 ）,检 索 顺 序,Summaries-UpToDate,UpToDate 收录6000多个循证医学的主题资源，全部皆由 UpToDate的主编和4400 位的医师作者们执笔所撰写。是由作者们浏览 peer-reviewed 的期刊再加上专业，经验和意见而成的。文献中附有图片，包括图表，X光片，相片，影像文件等，及 MEDLINE 的引用文献摘要。并提供 Lexi-Comp 的药物信息并可以执行药物交互作用。,http:/www.uptodate.com,First Consult,检索页,结果页,Cochrane图书馆由六个主数据库组成。 包括：,Cochrane系统评价数据库 (CDSR) Cochrane疗效评价数据库 (DARE) Cochrane临床对照实验登记数据库 (CENTRAL) Cochrane 系统评价方法综述数据库 (CDMR) 卫生技术评估信息数据库 (HTA) 英国国家卫生服务系统经济评价数据库。(NHS EED),Cochrane图书馆,(www.thecochranelibrary.com),2000多个全面评价,Cochrane系统评价数据库 (CDSR),1400多个方案（进行中的评价）,Cochrane 疗效评价数据库 (DARE) 4,100 记录。 包括鉴定性评估及评价摘要。 必须达到最低品质标准。 包括CDSR中将要涉及的问题。 提供Cochrane 评审员及研究者需要Cochrane 数据库外其它渠道的关于卫生保健疗效评估的资讯。,Cochrane临床对照实验登记数据库(CENTRAL) 375,000记录 包括可能与Cochrane评价相关研究的登记。 世界上最大的随机临床对照实验数据库。 帮助Cochrane 评审员识别需要Cochrane评价的研究，及研究者找到其它医学专业领域中的研究。,Cochrane图书馆,Cochrane系统评价方法综述数据库(CDMR) 包括方法综述及规范。 全文评论检验了方法研究的益处 例如：编辑的同行评审能否提高生物医学研究报告的品质？,卫生技术评估信息数据库 (HTA) 包括卫生保健技术评估的信息，包含卫生技术评估机构正在进行的项目及已完成出版物的详细说明。,Cochrane图书馆,在所有文章中检索词汇: schizo*, drugs（药品）, atypical（异型的）及 antipsychotic（抗精神病的）。,在图书馆的所有数据库中检索。,在所有记录中检索,www.theCochranelibrary.org,检索结果如下,使用Cochrane图书馆中不同数据库下的检索结果。,点击这些链接，限定您的检索结果只评论或是协议。,用这些链接保存或编辑您的检索方法。,www.theCochranelibrary.org,Cochranelibrary MeSH检索,Use the Thesaurus to search for MeSH descriptors,Select the MeSH tree you wish to search.,Add search qualifiers.,Select Search History. To combine searches, enter their number together with Boolean operator of choice in this case AND.,Your combined search will then come up in your Search History. Click it to run it.,The combined search (#1 AND #2) returns results across all the databases.,Cochranelibrary检索历史,检索证据的顺序,二次研究证据: 1, System(系统) 2, Summaries(概要) for 背景知识 UpToDate Clinical Evidence First Consult ACP Medicine 3, Synopses(精要) for 背景知识 ACP Journal Club Evidence-based medicine 4, Syntheses(系统评价) for 证据评读 Cochrane library- CDSR et al PubMed-Clinical Queries 的 Systematic Review 原始研究证据: 5, Studies (原始论著) for 证据评读 Cochrane Library - Clinical trials PubMed -Clinical queries的 Clinical study search Medline、Ebmase ( limit功能 ）,检 索 顺 序,Pubmed、Embase循证文献的限定,Pubmed,Embase,示例,Insecticide-treated vs non-insecticide-treated bed nets for preventing malaria,Children peek out from under an ITN in their home in Uganda. Children under the age of 5 and pregnant women are most vulnerable to malaria infections.,malaria search,#1 malaria* #2 plasmodium* #3 “blackwater fever” #4 “marsh fever” #5 “Malaria“Mesh #6 #1 or #2 or #3 or #4 or #5,Marsh Fever Fever, Marsh Paludism Remittent Fever Fever, Remittent Infections, Plasmodium Infection, Plasmodium Plasmodium Infection Plasmodium Infections,bed-net search,#7 nets* or bednet* or bed-net* or curtain* or “mosquito net” or insecticide-treated or “insecticide treated” #8 Exp“Bedding and Linens”mh Mosquito Nets #9 “Mosquito control” Mesh #10 #7 or #8 or #9,RCT search,#11 randomized controlled trial pt #12 controlled clinical trial pt #13 radomized tiab #14 placebo tiab #15 drug therapy sh #16 radnomly tiab #17 trial tiab #18 groups tiab #19 #11 or #12 or #13 or #14 or #15 or #16 or #17 or #18 #20 humans mh #21 #19 and #20,Search results,#6 and #10 and #21,Malaria,Bed-net,RCT,循证文献的临床应用,500种顶尖医学期刊和2000多种的医学二次文献、 循证医学文献资源、药物信息资源、临床诊疗指引,Annals of Family Medicine,American Family Physician,Cochrane Database of Systematic Reviews,BMC Clinical Pharmacology,http:/www.dynamicmedical.com/sources.php,DynaMed,內容结构系统化、便于临床实际应用 Content is organized in an easy-to-use, clinically-practical format.,General Information (including ICD-9& 10 codes) 概述 Causes & Risk Factors 致病因素及危险因子 Complications & Associated Conditions 并发症与相关症状 History 病史 Physical 身体检查 Diagnosis 诊断 Prognosis 预后 Treatment 治疗 Prevention & Screening 预防及检查 References (including reviews & guidelines) 参考文献 Patient Information 病患信息 Acknowledgements 版权说明,DynaMed,Electronic patient records,循证研究文献管理工具,Endnote主要功能,在线搜索文献：直接从网络搜索相关文献并导入到Endnote的文献库内 ,并实现去重等功能; 建立文献库和图片库：收藏，管理和搜索个人文献和图片、表格; 定制文稿：直接在Word中格式化引文和图形，利用文稿模板直接书写合乎杂志社要求的文章,谢 谢！,仇 晓 春 上海交通大学医学院 信息资源中心 Tel: 021-64679741 13301982855 Email: tsg2shsmu.edu.cn,