医学文献检索概述.ppt
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1、仇 晓 春,上海交通大学医学院信息资源中心,医学文献检索概述,提 纲,医学文献检索概况 循证医学概论 循证医学资源检索及数据库介绍,一、医学文献检索概况,涉及人体的医学研究必须遵从普遍接受的科学原则,应对科学文献和相关资料全面了解,并有充分的实验和动物试验(如有必要)的基础上进行。 -世界医学协会赫尔辛基宣言 11/30,1997年1月至2005年9月Pubmed每月的文献检索数量增长惊人,医学文献的种类,全文型数据库(一次文献) Elsevier、BMJ、EBSCO host、Springer、Wiley、 BMC、PLoS CHKD、万方数据、维普 文摘型数据库(二次文献) Medline
2、(Pubmed)、Embase、SCI CBMdisc、CBA 事实型数据库(三次文献) Cochranelibrary 、 Clinical Evidence、 EBMR、Uptodate,常用医学文献数据库的类型,拖曳网自然语言搜索引擎,智能信息资源整合系统,Pubmed数据库,PubMed是美国国家医学图书馆(NLM)下属的国家生物技术信息中心(NCBI)开发的、基于WWW的医学数据库查询系统。 网址: http:/www. pubmed.gov http:/ http:/www. pubmed.org http:/www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed,Pre-Medl
3、ine,Medline,New Data,Collect,PubMed,Process,PubMed与Medline,PubMed基本检索,自由词检索 主题词检索 布尔逻辑检索 字段限制检索 著者检索 刊名检索 日期或日期范围检索 截词检索 强制检索,对于自然医学语汇中同义词、近义词学名与俗名的处理 例: Cancer,Tumor * Neoplasms (近义词) German Measles * Rubella (同义词) Vitamin C * Ascorbic Acid (学、俗名) Apoplexy * Cerebrovascular Disorders(同义词) Deoxyribo
4、nucleic Acid * DNA (繁、简称) 非典 *严重急性呼吸道综合症 乙酰水杨酸,阿斯匹林 *阿司匹林,MeSH作用1:规范自由词,MeSH作用2,扩展下位词(范畴表),等级关系: Diseases C Neoplasms C4 Neoplasms by Site (NON MeSH) C4.588 Digestive System Neoplasms C4.588.274 Gastrointestinal Neoplasms C4.588.274.476 Intestinal Neoplasms. C4.588.274.476.411 Colonic Neoplasms C4.5
5、88.274.476.411.306 Colorectal Neoplasms C4.588.274.476.411.306.416 HereditaryNonpolyposis .C4.588.274.476.411.306.416.250,C6.240.476,按照学科性质,词义范围的上下类属和派生关系,将字顺表中的主题词分别划分为15个大类,依次用A-N及Z代表。,代表疾病类Diseases,肿瘤,消化系统疾病,检索限定选择,款目词,主题词树状结构,副主题词,检索结果,检索结果显示,http:/,Embase数据库,OVID数据库,TAYLOR & FRANCIS,SPRINGER,WI
6、LEY,ELSEVIER,CABi,Annual Reviews,LAWRENCE ERLBAUM,SIAM,NATURE,PALGRAVE,Karger,THIEME,ACS; RSC,KLUWER,BLACKWELL,AIP; APS IOP,IEEE CS,IEEE; ASCE; ASME; PEP,AAAS,SPIE,MIT,CORNELL (EUCLID),ROCKEFELLER,OUP,PROJECT MUSE,BIG FIVE,Mediums,University Press,Societies,FASEB,SWETS,OViD,EBSCO,ProQuest,Databases,
7、西文全文型数据库:,Publisher,Manuscript,Only those who can afford expensive subscriptions or licences have access,Result:,传统期刊的出版模式,Publisher,Everyone has access All use is fair use,Result:,Manuscript,开放存取期刊的出版模式,Open Access Journal,features works of exceptional significance in all areas of biological scienc
8、e, from molecules to ecosystems, including works at the interface with other disciplines, such as chemistry, medicine, and mathematics Public Library of Science impact factor: 14.7,BioMed Central(BMC),S,S,二、循证医学概论,循证医学(Evidence-Based Medicine,EBM)遵循证据的科学。是指对病人的诊治必须基于当前可以得到的最佳临床研究结果,结合医生的经验,考虑病人的实际情况
9、,并在尊重其选择和意愿前提下,制定对病人的治疗措施。,最佳临床研究结果,医生的经验,病人的实际情况,制定治疗措施,1793年, George Fordyce Attempt to improve the evidence of medicine 1948年,BMJ “A medical research council investigation. Streptomycin treatment of pulmonary tuberculosis” Br Med J. 1948:770-782(第一个RCT) 1966年,Meta分析方法被引用与医学领域对干预效果的评价Solari ME A m
10、ethod of combining the results of several clinical trials. Clinical Trials Journal, 1966,3:537-545,二、循证医学概论,1979年,系统性回顾研究(Systematic Review)方法学的建立,Archibald Leman Cochrane (1909-1988),二、循证医学概论,有益处,可能有益处,利弊相当,可能无益处,未知有效性,可能无效或有害,二、循证医学概论,三、循证医学资源检索,提出一个可以被回答的问题 检索文献资料 严谨的研判所找到的证据 整合临床上的专业并实际应用于个案的 诊疗
11、 效果评估, Patient: 目标是哪些病人? Intervention: 使用了哪一种治疗方法? Comparison: 要跟什么比? Outcome: 要比什么?,,分析整理信息需求:,PICO模型,三、循证医学资源检索,对于中风后的病患来说,使用抗凝血剂的治疗,比起使用抗血小板药物的治疗,是否在中风的复发率会有不同的影响,Patient: Stroke Intervention: Anti-coagulation Comparison: Anti-Platelet / Placebo Outcome: Recurrent rate,PICO模型,PICO检索,http:/babelme
12、sh.nlm.nih.gov/pico.php,循证医学证据级别,原始研究证据 Medline、 Embase、 CBM 二次研究证据 EBMROVID、 Cochrane Library、 ACP Journal Club、 Dynamed、Uptodate 、 Best pratice ,三、循证医学资源检索,循证医学系统评价范例,0引言 1 资料与方法 1.1 纳入/排除标准 1.1.1 研究类型 1.1.2 研究对象 1.1.3 干预措施 1.1.4 测量指标 1.2 排除标准 1.3 检索策略 1.4 纳入试验的筛选 1.5资料提取 1.6 文献质量评价 1.7 统计分析方法 2 结
13、果 2.1 文献筛选过程 2.2纳入研究的基本情况 2.3 纳入研究质量评价 2.4 Meta分析结果 3 讨论 4参考文献,循证研究的检索顺序,二次研究证据: 1, System(系统) 2, Summaries(概要) for 背景知识 UpToDate Clinical Evidence First Consult ACP Medicine 3, Synopses(精要) for 背景知识 ACP Journal Club Evidence-based medicine 4, Syntheses(系统评价) for 证据评读 Cochrane library- CDSR et al Pu
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