浙江大学刘振伟教授高级培训班膜片钳技术数据处理与分析.ppt
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1、Clampfit10膜片钳实验数据的处理与分析2014年4月23-25日杭州 浙江大学膜片钳技术高级培训班膜片钳技术高级培训班刘振伟刘振伟炭移件噬定旧鲁这猿弧遵粮乖缀窘肆剖存员纲磕溯遣蛙囱神秋岔于剁琢拆浙江大学-刘振伟教授高级培训班-膜片钳技术数据处理与分析浙江大学-刘振伟教授高级培训班-膜片钳技术数据处理与分析一、膜片钳实验数据的处理一、膜片钳实验数据的处理二、全细胞记录数据的分析二、全细胞记录数据的分析三、单通道记录数据的分析三、单通道记录数据的分析四、突触放电活动数据的分析四、突触放电活动数据的分析2Patch clamp training classApr.23-25,2014内容内容
2、俊婴炒湘纵荣疙圣忻恶暑武窘揖疤龋拣棺笺器王姻竿颧摘哲返分汞赎教萄浙江大学-刘振伟教授高级培训班-膜片钳技术数据处理与分析浙江大学-刘振伟教授高级培训班-膜片钳技术数据处理与分析3Patch clamp training classApr.23-25,2014膜片钳实验数据的处理膜片钳实验数据的处理一、基线的调零一、基线的调零二、坏点的去除二、坏点的去除三、滤波三、滤波四、数据文件内部四、数据文件内部/之间的数学运算之间的数学运算藏幻譬酮泄撮竹聂穗诀狞雪枢蒋标呛仿眼范民攫样辞绕申吃畴蔼未条呜玻浙江大学-刘振伟教授高级培训班-膜片钳技术数据处理与分析浙江大学-刘振伟教授高级培训班-膜片钳技术数据处
3、理与分析4Patch clamp training classApr.23-25,2014膜片钳实验数据的处理膜片钳实验数据的处理一、基线的调零一、基线的调零l 基线的确认基线的确认 全细胞记录基线易确认,单通道记录基线不易确认。单通道开放时间较长所记录的时间较短同时开放的通道数目较多且长时间持续开放确定通道电流的方向:电流方向向上,最负向是基线位置,反之亦然。如何确定:膜片两侧液体、钳制电位单通道电流基线的确认单通道电流基线的确认如果通道开放时电流向上,则基线在最下面的位置基线通道开放孙瀑棒烫恍七吊追缠母耍菲芥尹刨撮响汗选胯槽关沽烛杆杨稠捷时夯辨这浙江大学-刘振伟教授高级培训班-膜片钳技术数
4、据处理与分析浙江大学-刘振伟教授高级培训班-膜片钳技术数据处理与分析5Patch clamp training classApr.23-25,2014膜片钳实验数据的处理膜片钳实验数据的处理狸永射昆喷阀腺丁牺通位它纶冗为涂嗽匪论瓜标豪晒姚案膜嘴宅出遥寸皇浙江大学-刘振伟教授高级培训班-膜片钳技术数据处理与分析浙江大学-刘振伟教授高级培训班-膜片钳技术数据处理与分析6Patch clamp training classApr.23-25,2014膜片钳实验数据的处理膜片钳实验数据的处理l 基线不在零点的原因基线不在零点的原因 封接电阻的改变:漏电流失调电位的存在:偏移、漂移噪声的干扰:交流干扰高
5、通滤波的影响:对记录线的起始部位产生影响榜糠楞暖胃饼奥匠驮尚轻斤圈菊痛炕妙奸盂删搪绘喧存凄恢措芽旁嚷近勒浙江大学-刘振伟教授高级培训班-膜片钳技术数据处理与分析浙江大学-刘振伟教授高级培训班-膜片钳技术数据处理与分析7Patch clamp training classApr.23-25,2014膜片钳实验数据的处理膜片钳实验数据的处理l 基线调零方法基线调零方法打开Analyze/Adjust/Baseline(1)Subtractmeanof(去除均值法):适用于去除直流偏移。(2)Subtractslopeof(去除斜率法):适合于去除持续线性漂移。(3)Subtractfixedval
6、ue(去除固定值法):适用于去除直流偏移。数值有正负之分。(4)Adjustmanually(手工调零法):适合于单通道电流的基线或基线漂移无规律。议帽敝棘岳戏镭边折拽皂垛座估凹昼珍窑蛮獭警书百赠您厘拙丧请福烬蹿浙江大学-刘振伟教授高级培训班-膜片钳技术数据处理与分析浙江大学-刘振伟教授高级培训班-膜片钳技术数据处理与分析8Patch clamp training classApr.23-25,2014膜片钳实验数据的处理膜片钳实验数据的处理坐标零点坐标零点EpochA段(1)Subtractmeanof(去除均值法)(2)Subtractslopeof(去除斜率法)兢会烃浮札惕镀嗣臣笑臃乌愁
7、吝袜嗣饱奎级挂颓玄闰映搭眨鼎铜会囚圃憾浙江大学-刘振伟教授高级培训班-膜片钳技术数据处理与分析浙江大学-刘振伟教授高级培训班-膜片钳技术数据处理与分析9Patch clamp training classApr.23-25,2014膜片钳实验数据的处理膜片钳实验数据的处理(3)Subtractfixedvalue(去除固定值法)(4)Adjustmanually(手工调零法)悸酞奏豺布纪黎暗辗砌娃更脊僳闪植地烁惦放唯烛凸萄四志桌棉舵湘笔逛浙江大学-刘振伟教授高级培训班-膜片钳技术数据处理与分析浙江大学-刘振伟教授高级培训班-膜片钳技术数据处理与分析10Patch clamp training
8、classApr.23-25,2014膜片钳实验数据的处理膜片钳实验数据的处理l 基线调零的注意事项基线调零的注意事项(1)有些只相对值(如电流幅度的变化值),不需要将基线调零。但多数情况需要基线调零,建议都要进行基线调零。(2)对于基线变动复杂的数据,基线调零可能会用到上述的几种方法。(3)对于某些基线变动,Clampfit中的基线调零方法可能也无法准确调零。建议最好在采集数据时就设法调整好基线。江斤茬伯卑缔死攻疟崭哭逢长辞资究迅袍蒸馒柬猴葛诸逆否摸监沼停蔬底浙江大学-刘振伟教授高级培训班-膜片钳技术数据处理与分析浙江大学-刘振伟教授高级培训班-膜片钳技术数据处理与分析11Patch cla
9、mp training classApr.23-25,2014膜片钳实验数据的处理膜片钳实验数据的处理l Clampfit演示基线调零方法演示基线调零方法许猩馅催蹋罩柯聘不庸恍疡镇似等狠蒜捌痹滨裳堤茬回治帜昔唤柞镊珍募浙江大学-刘振伟教授高级培训班-膜片钳技术数据处理与分析浙江大学-刘振伟教授高级培训班-膜片钳技术数据处理与分析12Patch clamp training classApr.23-25,2014二、坏点的去除二、坏点的去除l 坏点产生的原因坏点产生的原因 刺激伪迹:给标本施加刺激时产生。电容瞬变电流:电容的充放电反应。瞬时脉冲干扰(Glitch):打开电源开关(日光灯、仪器设备
10、开启时)手机来电:一过性高频。人手靠近记录探头:高幅、高频。膜片钳实验数据的处理膜片钳实验数据的处理图俞奖秆哈设灸斜譬吝迈与夸扩鲍嘱纂涕亿闺皇甸河召悼金获佯阔慧潍铆浙江大学-刘振伟教授高级培训班-膜片钳技术数据处理与分析浙江大学-刘振伟教授高级培训班-膜片钳技术数据处理与分析13Patch clamp training classApr.23-25,2014l 坏点的赋值坏点的赋值 (1)Datavalueatcursor1:Cursor1的数值。(2)Meanbetweencursor1.2:Cursor1-2之间均值。(3)Meanbetweencursor3.4:Cursor3-4之间均
11、值。(4)Straight-linefitbetweencursor1.2:Cursor1-2之间的直线拟合值。(5)Fixedvalue(pA/mV):输入一个固定的数值。膜片钳实验数据的处理膜片钳实验数据的处理变我胜禁衍竣溪篷项珍维犬膀剧架卑铸陀锨斋酌稗妙步粕样剁旷驰碾首纱浙江大学-刘振伟教授高级培训班-膜片钳技术数据处理与分析浙江大学-刘振伟教授高级培训班-膜片钳技术数据处理与分析14Patch clamp training classApr.23-25,2014膜片钳实验数据的处理膜片钳实验数据的处理l Clampfit演示去除坏点演示去除坏点鹊彪尽趁语湍袋什夕肤溪状瑞涟盈寥碗补匣罩就
12、怖薄犀掷棕黎佬割沸砌洛浙江大学-刘振伟教授高级培训班-膜片钳技术数据处理与分析浙江大学-刘振伟教授高级培训班-膜片钳技术数据处理与分析15Patch clamp training classApr.23-25,2014l 注意事项注意事项 (1)坏点太多时,应在记录前予以去除。(2)坏点持续时间短,如果出现持续时间较长的坏点,则数据要废弃。膜片钳实验数据的处理膜片钳实验数据的处理烤衫云垦促趴边汾簿刚额褒吭丙词笆拙珍舅刚胀碾俯抡芍粮眺谱贿置臼肋浙江大学-刘振伟教授高级培训班-膜片钳技术数据处理与分析浙江大学-刘振伟教授高级培训班-膜片钳技术数据处理与分析16Patch clamp trainin
13、g classApr.23-25,2014三、滤波三、滤波l 信号采集前的滤波信号采集前的滤波 全细胞通道电流记录:1-2kHz全细胞突触活动记录:10kHz单通道电流记录:10kHz动作电位记录:10kHz膜片钳实验数据的处理膜片钳实验数据的处理签戒掏黑摧揉嫉渭澄接卒通蚊棱蔑废柴翻午询碱掸霍酣赞惑大署竟致苍垂浙江大学-刘振伟教授高级培训班-膜片钳技术数据处理与分析浙江大学-刘振伟教授高级培训班-膜片钳技术数据处理与分析17Patch clamp training classApr.23-25,2014l 信号采集后的滤波信号采集后的滤波 膜片钳实验数据的处理膜片钳实验数据的处理连人佰帕杀副冗
14、向忱巷凭砍仿蜗贤宠挑缺活不带锅氏光茅轰位汰腿哼靴瓢浙江大学-刘振伟教授高级培训班-膜片钳技术数据处理与分析浙江大学-刘振伟教授高级培训班-膜片钳技术数据处理与分析18Patch clamp training classApr.23-25,2014 Lowpass Highpass Bandpass Notch Electrical Interference l Clampfit滤波类型滤波类型 膜片钳实验数据的处理膜片钳实验数据的处理乘洛辟呛恍疼程赔川扳改吧废榴破哩咖页毙鼠宁粮屁埠诱砰榜肘陇旁跺腆浙江大学-刘振伟教授高级培训班-膜片钳技术数据处理与分析浙江大学-刘振伟教授高级培训班-膜片钳技术
15、数据处理与分析19Patch clamp training classApr.23-25,2014l Lowpass 最为常用。Clampfit根据采样定理与Nyquist定理自动算出f-3dB范围并显示在该框底部。7种类型:(1)8-poleBessel:数据失真小,普遍用于时域数据。(2)Boxcar:数码滤波器,用于时域数据。当前数据点及其前后一些数据点(取决于Smoothingpoints,取3-99中的奇数)的平均值赋予当前数据点,完成滤波。Smoothingpoints值越大,数据幅度削减越大。(3)Gaussian:数码滤波器,同Boxcar,但当前数据点在平均值中所占的比例较大
16、4)RC(8-coincident-pole):用于时域数据。(5)RC(single-pole):用于时域数据。(6)8-poleButterworth:用于频域数据。(7)8-poleChebyshev:用于频域数据。膜片钳实验数据的处理膜片钳实验数据的处理草埂攘售喇返砧要帘帧疫惨窗威知涕徽拂靴视喻襟舒外端待毋捌卿邮沁示浙江大学-刘振伟教授高级培训班-膜片钳技术数据处理与分析浙江大学-刘振伟教授高级培训班-膜片钳技术数据处理与分析20Patch clamp training classApr.23-25,2014膜片钳实验数据的处理膜片钳实验数据的处理l Clampfit演示演示Low
17、pass滤波滤波寥张曲号纳殆急夷昆研租柏砰浆抖斩氦路新吹峰戮权城已霸询结坷翼犬购浙江大学-刘振伟教授高级培训班-膜片钳技术数据处理与分析浙江大学-刘振伟教授高级培训班-膜片钳技术数据处理与分析21Patch clamp training classApr.23-25,2014l Highpass又称交流耦合(ACCoupling),可削弱低频信号而通过高频信号。Clampfit提供两种:8-poleBessel,单极RC采用-f-3dB,Clampfit自动计算出f-3dB范围并显示在该框底部。最常见的是在神经元上进行细胞内记录时使用高通滤波器,它可降低膜电位的低频振荡对突触电流的干扰。膜片钳
18、实验数据的处理膜片钳实验数据的处理皿嘶疼痞折脊衡咨索狠钙开涕淹慕钎贸袖快朔蛀鹊学棱酒粹迂勃米曲惟泡浙江大学-刘振伟教授高级培训班-膜片钳技术数据处理与分析浙江大学-刘振伟教授高级培训班-膜片钳技术数据处理与分析22Patch clamp training classApr.23-25,2014膜片钳实验数据的处理膜片钳实验数据的处理l Clampfit演示演示Highpass滤波滤波昂围庸掺梗烁习狠警传孵饿典鬼规买利钢剂些椒吗皂伎鉴熔质卢仇寨备饰浙江大学-刘振伟教授高级培训班-膜片钳技术数据处理与分析浙江大学-刘振伟教授高级培训班-膜片钳技术数据处理与分析23Patch clamp train
19、ing classApr.23-25,2014l Bandpass相当于低通滤波与高通滤波的交叉,需要同时设定高通滤波与低通滤波。高通滤波的f-3dB不能高于低通滤波的f-3dB。带通滤波用于欲记录的信号频率较为单一和固定时,对其它频率的噪声进行滤波。膜片钳实验数据的处理膜片钳实验数据的处理祁杨肘健剑嚣晾翱丽眉叼渣猫锰肋波讫花姿聚琴圾恃髓奄同蚊戒择紧阁青浙江大学-刘振伟教授高级培训班-膜片钳技术数据处理与分析浙江大学-刘振伟教授高级培训班-膜片钳技术数据处理与分析24Patch clamp training classApr.23-25,2014l Notch带阻滤波:削弱某一特定频率(如50
20、Hz交流)信号。中心频率(Centerfrequency):10-3,000Hz。频率宽度(3dBwidth):频率宽度。-3dBwidth越窄,滤波需要的数据点越多,滤波效果越好。膜片钳实验数据的处理膜片钳实验数据的处理肘臼缠进乞擞汽箭夸阮赠即烧冬锻冷百蛀蹈迢鬼启遂耳帕孟虹韦堪邢味熄浙江大学-刘振伟教授高级培训班-膜片钳技术数据处理与分析浙江大学-刘振伟教授高级培训班-膜片钳技术数据处理与分析25Patch clamp training classApr.23-25,2014膜片钳实验数据的处理膜片钳实验数据的处理l Clampfit演示演示Notch滤波滤波曼柠奥旬颁偏旧棚来庆昨鹿养驱链担
21、毕菱徊植穆迷忿竖牲持牲吃墓揣像穗浙江大学-刘振伟教授高级培训班-膜片钳技术数据处理与分析浙江大学-刘振伟教授高级培训班-膜片钳技术数据处理与分析26Patch clamp training classApr.23-25,2014l Electrical Interference(EI)电干扰滤波器(Electricalinterferencefilter,EI)为数码滤波器。可同时去除50Hz及其谐波(100Hz、150Hz等)的复杂交流噪声。Harmonicsfrom1to:用于设定欲去除的交流谐波的最高数目,最大数目为20(对应于1 kHz),一般去除第1-3个就够了。Cyclestoav
22、erage:数目越大,-3dB频率宽度越窄,滤波效果越好,但需时越长。Referencefrequency:选50Hz。膜片钳实验数据的处理膜片钳实验数据的处理窃瞅钻频浩慧流巢痕酵粗喀眶罚搀窟梳舟庆猪荔挤宋簇而携亩刷叮芦梢的浙江大学-刘振伟教授高级培训班-膜片钳技术数据处理与分析浙江大学-刘振伟教授高级培训班-膜片钳技术数据处理与分析27Patch clamp training classApr.23-25,2014EI所需最少数据点的计算举例所需最少数据点的计算举例滤波器所需最少数据点(采样频率/50 Hz)Cycles to average若采样频率 10 kHz,则一个50 Hz正弦波周
23、期的采样点数 10 kHz/50 200 点若设定Cycles to average 10,则需要的最少采样点数 2,000点采样数据点不够的话,将不能清除谐波干扰。膜片钳实验数据的处理膜片钳实验数据的处理佰宙痔忍室狈弓诀呜噎卜渡苞抡斤孵往恭哪摄悸谬飞韦收饯省艰乱獭唉碉浙江大学-刘振伟教授高级培训班-膜片钳技术数据处理与分析浙江大学-刘振伟教授高级培训班-膜片钳技术数据处理与分析28Patch clamp training classApr.23-25,2014四、数据文件内部四、数据文件内部/之间的数学运算之间的数学运算l Analyze/Average Traces平均文件内任意几条相同的
24、Trace,获得平均后的一条Trace。要求:Clampex软件的Fixed-lengthevents、Episodicstimulation和High-speedoscilloscope模式。重复记录的信号,时程必须固定不变。膜片钳实验数据的处理膜片钳实验数据的处理蒋慕蛹颗之秀伪棺非娱铆瑰晌叁瘦坦皋桑仗得尔骋焚凹划胸睹降躁是饲途浙江大学-刘振伟教授高级培训班-膜片钳技术数据处理与分析浙江大学-刘振伟教授高级培训班-膜片钳技术数据处理与分析29Patch clamp training classApr.23-25,2014 降低信号噪声降低信号噪声信号频率谱与噪声频率谱一致或有重叠时,滤波不行
25、平均Trace的原理:设有N条Trace,则(见表):先累加所有N条Trace,此时信号幅度增大为原来的N倍,而噪声却只增大为原来的N倍。然后再除以Trace条数N,信号幅度不发生大的变化,而噪声幅度却降低为原来的1/N。膜片钳实验数据的处理膜片钳实验数据的处理猎锚诺射河妊便牛媒萄蝎打既串湘疏归齿傣桅锚桔晤兜狠张说每鳞犀葱找浙江大学-刘振伟教授高级培训班-膜片钳技术数据处理与分析浙江大学-刘振伟教授高级培训班-膜片钳技术数据处理与分析30Patch clamp training classApr.23-25,2014膜片钳实验数据的处理膜片钳实验数据的处理l Clampfit演示演示Aver
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