第四次分生讨论课问题四整合课件.ppt
《第四次分生讨论课问题四整合课件.ppt》由会员分享,可在线阅读,更多相关《第四次分生讨论课问题四整合课件.ppt(40页珍藏版)》请在三一文库上搜索。
1、按照因地制宜的原则,结合各部门项目历史经验的积累,制定出正确合理的项目实施流程,用高质量的流程指导项目的实施基因工程设计方案基因工程设计方案按照因地制宜的原则,结合各部门项目历史经验的积累,制定出正确合理的项目实施流程,用高质量的流程指导项目的实施有关该题目的具体分析有关该题目的具体分析已知目的基因的已知目的基因的cDNA序列序列(GenBank登登录号录号:AK135903.1),拟采用,拟采用基因工程基因工程技术技术在哺乳动物细胞中表达该序列中在哺乳动物细胞中表达该序列中的的133-1941位核苷酸序列,请设计实位核苷酸序列,请设计实验方案。验方案。按照因地制宜的原则,结合各部门项目历史经
2、验的积累,制定出正确合理的项目实施流程,用高质量的流程指导项目的实施该问题我们主要分五个个方面来实该问题我们主要分五个个方面来实行实验方案行实验方案1.目的基因的获取目的基因的获取2.表达载体的选择表达载体的选择3.外源基因导入宿主细胞外源基因导入宿主细胞4.目的基因的筛选与鉴定目的基因的筛选与鉴定按照因地制宜的原则,结合各部门项目历史经验的积累,制定出正确合理的项目实施流程,用高质量的流程指导项目的实施1.1.目的基因的获取目的基因的获取主要分以下几个方面进行阐述(1)对资料gene bank 中的基因的分析(2)cDNA的获取(3)cDNA的扩增(4)cDNA后续处理按照因地制宜的原则,结
3、合各部门项目历史经验的积累,制定出正确合理的项目实施流程,用高质量的流程指导项目的实施(1 1)对资料)对资料gene bank gene bank 中的基因的分析中的基因的分析经过在经过在经过在经过在pubmedpubmed中的中的中的中的nucleotidenucleotide中查找中查找中查找中查找AK135903.1AK135903.1号基号基号基号基因,得到如下结果:因,得到如下结果:因,得到如下结果:因,得到如下结果:MusmusculusinvitrofertilizedeggscDNAMusmusculusinvitrofertilizedeggscDNA,RIKENfull-
4、lengthenrichedlibrary,RIKENfull-lengthenrichedlibrary,clone:7420435F10clone:7420435F10product:zonapellucidaglycoprotein2product:zonapellucidaglycoprotein2fullinsertsequencefullinsertsequence小家鼠体外受精卵的小家鼠体外受精卵的小家鼠体外受精卵的小家鼠体外受精卵的cDNAcDNA日本理化研究所全长日本理化研究所全长日本理化研究所全长日本理化研究所全长序列文库序列文库序列文库序列文库卵透明带糖卵透明带糖卵透明带
5、糖卵透明带糖蛋白蛋白蛋白蛋白2 2完整的插入序列完整的插入序列完整的插入序列完整的插入序列按照因地制宜的原则,结合各部门项目历史经验的积累,制定出正确合理的项目实施流程,用高质量的流程指导项目的实施以下是查找到的全长基因序列该该该该cDNAcDNA序列序列序列序列 共共共共22342234个个个个bpbp的碱基的碱基的碱基的碱基按照因地制宜的原则,结合各部门项目历史经验的积累,制定出正确合理的项目实施流程,用高质量的流程指导项目的实施(2 2)cDNAcDNA的获取的获取分为以下几个步骤:分为以下几个步骤:.小鼠卵透明带糖蛋白小鼠卵透明带糖蛋白2的的mRNA的提取的提取.mRNA的逆转录为的逆
6、转录为cDNA.cDNA形成双链进行扩增形成双链进行扩增按照因地制宜的原则,结合各部门项目历史经验的积累,制定出正确合理的项目实施流程,用高质量的流程指导项目的实施.小鼠卵透明带糖蛋白小鼠卵透明带糖蛋白2 2的的mRNAmRNA的提取的提取&.mRNA.mRNA的逆转录为的逆转录为cDNAcDNA利用利用TRIZOL发抽提雌性小鼠的卵细胞中的所有发抽提雌性小鼠的卵细胞中的所有RNA得到得到以下图示结果:以下图示结果:5m7Gppp-AAA3(抽提的抽提的mRNA)5m7Gppp-AAA3(mRNA)-(cDNA)OilgoOilgo(dTdT)引物)引物)引物)引物 特异性特异性特异性特异性设
7、计的引物设计的引物设计的引物设计的引物(只对卵透只对卵透只对卵透只对卵透明带糖蛋白明带糖蛋白明带糖蛋白明带糖蛋白2mRNA2mRNA中序中序中序中序列特异性识别列特异性识别列特异性识别列特异性识别)AMVAMV反转录酶反转录酶反转录酶反转录酶,缓冲液,缓冲液,缓冲液,缓冲液第一股链合成第一股链合成第一股链合成第一股链合成 4545,60min60min按照因地制宜的原则,结合各部门项目历史经验的积累,制定出正确合理的项目实施流程,用高质量的流程指导项目的实施.cDNA.cDNA形成双链进行扩增形成双链进行扩增 5m7Gppp-AAA3(mRNA)-TTT(cDNA)-AAA3-TTT5RNas
8、eHDNA-pol缓冲液缓冲液第二股链的合成第二股链的合成第二股链的合成第二股链的合成 1414 2h2h双链双链双链双链DNADNA得到稳定的得到稳定的得到稳定的得到稳定的cDNAcDNA双链双链双链双链(也就是得到了(也就是得到了(也就是得到了(也就是得到了AK135903.1AK135903.1号号号号cDNAcDNA)按照因地制宜的原则,结合各部门项目历史经验的积累,制定出正确合理的项目实施流程,用高质量的流程指导项目的实施(3 3)cDNAcDNA的扩增的扩增首先我们必须得设计好引物,本次实验的目的是扩增出133-1941位中的核苷酸链。因此在扩增之前必须得先设计primer设计引物
9、的方法:走以下是设计引物的一个过程:按照因地制宜的原则,结合各部门项目历史经验的积累,制定出正确合理的项目实施流程,用高质量的流程指导项目的实施设计引物的过程:设计引物的过程:使用使用pubmed中查找到中查找到AK135903.1的的cDNA序列后使用序列后使用后进入页面后可以筛后进入页面后可以筛选出建议的选出建议的primer。经过之前讲的原则的。经过之前讲的原则的分析后得到了一对扩增引物(包含了分析后得到了一对扩增引物(包含了133-1941位点的扩增片段)位点的扩增片段)见下所示见下所示见下所示见下所示按照因地制宜的原则,结合各部门项目历史经验的积累,制定出正确合理的项目实施流程,用高
10、质量的流程指导项目的实施Tm:55-65Tm:55-65GC%GC%:40%-60%40%-60%按照因地制宜的原则,结合各部门项目历史经验的积累,制定出正确合理的项目实施流程,用高质量的流程指导项目的实施cDNAcDNA的扩增的扩增-35-forwardprimerReverseprimer-3-5进行进行进行进行PCRPCR扩增扩增扩增扩增进行进行进行进行PCRPCR扩增后,就得到高浓度的扩增后,就得到高浓度的扩增后,就得到高浓度的扩增后,就得到高浓度的cDNAcDNA分子了分子了分子了分子了按照因地制宜的原则,结合各部门项目历史经验的积累,制定出正确合理的项目实施流程,用高质量的流程指导
11、项目的实施(4 4)cDNAcDNA的后续处理的后续处理获得高浓度的cDNA分子之后,由于末端扩增出的片段与表达载体并不匹配,因此为了更好的进行表达载体的构建,因此我们还需要对获得懂得cDNA进行后续的处理。以下为扩增后的cDNA分子处理:-AAA3-TTT5-AAA3-TTT5T4DNAT4DNA连接酶连接酶连接酶连接酶 dNTPdNTP人工合成接头人工合成接头人工合成接头人工合成接头修齐末端37 10min人工接头人工接头人工接头人工接头按照因地制宜的原则,结合各部门项目历史经验的积累,制定出正确合理的项目实施流程,用高质量的流程指导项目的实施2.2.表达载体的选择与构建表达载体的选择与构
12、建(1)表达载体的选择)表达载体的选择我们从题目中知道扩增出来后的基因序列我们从题目中知道扩增出来后的基因序列我们从题目中知道扩增出来后的基因序列我们从题目中知道扩增出来后的基因序列10k10k一般一般一般一般选用质粒作为表达载体。一下是有关表达载体的对比选用质粒作为表达载体。一下是有关表达载体的对比选用质粒作为表达载体。一下是有关表达载体的对比选用质粒作为表达载体。一下是有关表达载体的对比示意图。示意图。示意图。示意图。按照因地制宜的原则,结合各部门项目历史经验的积累,制定出正确合理的项目实施流程,用高质量的流程指导项目的实施(2 2)表达载体的构建)表达载体的构建目的基因与表达载体的构建目
13、的基因与表达载体的构建人工合成的基因接头常常在表达载体上都人工合成的基因接头常常在表达载体上都有特定的限制酶切割位点,用同样的限制有特定的限制酶切割位点,用同样的限制酶对表达载体进行切割后进行拼接。酶对表达载体进行切割后进行拼接。剪接好的剪接好的剪接好的剪接好的cDNA-cDNA-剪接好的质粒剪接好的质粒剪接好的质粒剪接好的质粒在在在在DNADNA连接酶的作连接酶的作连接酶的作连接酶的作用下连接用下连接用下连接用下连接表达载体构建成功表达载体构建成功表达载体构建成功表达载体构建成功按照因地制宜的原则,结合各部门项目历史经验的积累,制定出正确合理的项目实施流程,用高质量的流程指导项目的实施PCR
14、PCR引物的选取原则引物的选取原则引物应用核酸系列保守区内设计并具有特异引物应用核酸系列保守区内设计并具有特异引物应用核酸系列保守区内设计并具有特异引物应用核酸系列保守区内设计并具有特异性。性。性。性。产物不能形成二级结构。产物不能形成二级结构。产物不能形成二级结构。产物不能形成二级结构。引物长度一般在引物长度一般在引物长度一般在引物长度一般在15301530碱基之间。碱基之间。碱基之间。碱基之间。G+CG+C含量在含量在含量在含量在40%60%40%60%之间。之间。之间。之间。碱基要随机分布。碱基要随机分布。碱基要随机分布。碱基要随机分布。引物自身不能有连续引物自身不能有连续引物自身不能有
15、连续引物自身不能有连续4 4个碱基的互补。个碱基的互补。个碱基的互补。个碱基的互补。引物之间不能有连续引物之间不能有连续引物之间不能有连续引物之间不能有连续4 4个碱基的互补。个碱基的互补。个碱基的互补。个碱基的互补。引物引物引物引物5 5端可以修饰。端可以修饰。端可以修饰。端可以修饰。引物引物引物引物3 3端不可修饰。端不可修饰。端不可修饰。端不可修饰。引物引物引物引物3 3端要避开密码子的第端要避开密码子的第端要避开密码子的第端要避开密码子的第3 3位。位。位。位。返回返回返回返回按照因地制宜的原则,结合各部门项目历史经验的积累,制定出正确合理的项目实施流程,用高质量的流程指导项目的实施目
16、的基因导入受体细胞植物的遗传转化转基因动物技术按照因地制宜的原则,结合各部门项目历史经验的积累,制定出正确合理的项目实施流程,用高质量的流程指导项目的实施植物遗传转化的主要方法农杆菌介导的遗传转化基因枪法电击法注射法化学药剂诱导转化花粉管通道法按照因地制宜的原则,结合各部门项目历史经验的积累,制定出正确合理的项目实施流程,用高质量的流程指导项目的实施转基因动物按照因地制宜的原则,结合各部门项目历史经验的积累,制定出正确合理的项目实施流程,用高质量的流程指导项目的实施 (受精卵原核)显微注射法 迄今较为普遍最有成效(小鼠、绵羊、猪、大鼠、兔、牛、鱼.)导入的外源基因片段可长达导入的外源基因片段可
17、长达50kp,且无需载体。且无需载体。难以控制整合率,检测必须等难以控制整合率,检测必须等到子代出生。到子代出生。按照因地制宜的原则,结合各部门项目历史经验的积累,制定出正确合理的项目实施流程,用高质量的流程指导项目的实施逆转录病毒感染法 (小鼠、家禽)逆转录病毒核酸 单链RNA 反转录酶 反转录 细胞核基因组 双链DNA 整合率高 100%逆转录病毒载体对于多细胞转化的优越性(培育转基因禽类研究中有广泛应用,目前制备转基因禽类最有效和最成功的方法)只能转移小片段DNA(10kb)潜在的致癌性重组重组整合整合按照因地制宜的原则,结合各部门项目历史经验的积累,制定出正确合理的项目实施流程,用高质
- 配套讲稿:
如PPT文件的首页显示word图标,表示该PPT已包含配套word讲稿。双击word图标可打开word文档。
- 特殊限制:
部分文档作品中含有的国旗、国徽等图片,仅作为作品整体效果示例展示,禁止商用。设计者仅对作品中独创性部分享有著作权。
- 关 键 词:
- 第四 次分生 讨论 问题 整合 课件
