基因工程克隆载体09.pptx
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1、基因工程载体与受体细胞 Vector and host cell载体的概念载体应具有的特性载体的类型目录 目的外源基因分离后,是无法自主进入到宿主细胞并进行复制表达的,必须有一个运载工具将其运达宿主细胞,才能达到复制、扩增和表达的目的载体的概念 将外源目的基因带入宿主细胞并能与其一起复制、表达的基因运载工具就叫做基因载体或基因工程载体 基因操作的核心工具载体应具有的特性 在受体细胞中可以独立地进行自我复制。因此,载体本身必须是一个复制单位即复制子(replicon),具有复制起始点,而且插入外源基因后不会影响载体自身的复制能力。能够带动一定长度的外源基因一起复制 易于引入宿主细胞 在宿主细胞中
2、具有尽可能多的拷贝数,以利外源基因扩增 在质粒非必需区有供外源基因插入的多克隆位点(multiple cloning sites,MCS)具有一定的容纳外源基因的幅度,即容量 具有合适的选择标记 载体的分子量要小:降低对转化率的影响;利于容纳较大的外源基因;拷贝高;易于分离;减少了不必要酶切位点 在细胞中稳定性高 易于从宿主细胞中分离、纯化和鉴定 质粒本身必须是安全的 最好具有广泛的宿主适应性、核酸序列背景清楚 按其来源和本质可分为以下7种:质粒载体(plasmid)噬菌体载体 COS质粒(cosmid)。也叫粘粒载体。是质粒与的组合 噬菌粒载体(phagemid)是质粒与f1的组合 病毒载体
3、DNA病毒为主 人工染色体载体 穿梭载体(shuttle)载体的类型 按功能区分:克隆载体:也叫转移载体,只起转运,扩增作用 表达载体:带有表达功能,即有启动子,可转录和/或翻译 测序载体:只产生单链DNA用于测序,如M13、T载体、U载体 转录及调控载体 按照所需宿主细胞的类型分:真核(表达)载体 原核(表达)载体 穿梭载体质粒载体Plasmid 质 粒 定义:独立于染色体的自主复制的DNA物质。编码非染色体控制的遗传性状特 性1、复制通常一个质粒含有一个与相应的顺式作用控制要素结合在一起的复制起始区(整个遗传单位定义为复制子)复制子(Replicon):Genome能独立进行复制的单位,每
4、个复制子都含有一个复制起点 2、拷贝数 严紧型(stringent plasmid):低拷贝 松弛型(ralaxed plasmid):高拷贝质粒复制子复制子拷贝数拷贝数pBR322 及其衍生质粒pMB1 1520pUC 系列质粒及其衍生质粒突变的 pMB1500700pACYC 及其衍生质粒 p15A10212pSC101 及其衍生质粒pSC1015 ColE1ColE115203质粒的不相容性(plasmid incompatibility)两个质粒在同一宿主中不能共存的现象称质粒的不相容性。不相容的质粒一般都利用同一复制系统4、生物学特性(分子标记)质粒可以赋于宿主细胞不同的表型,如抗药
5、性、结合转移特性、产肠毒素或溶血素等 质粒表型的表示法:F+/F-、Ampr/Amps、Tetr/Tets、Ampr/Tets、Kanr、Strr、Cmlr、Neor 5、质粒的转移和丢失(清除)带有一个tra基因,可以自主地在宿主细胞间通过控制细菌配对和结合而发生转移的质粒叫接合型(conjugative)质粒,又叫自我转移性质粒。无此基因而无此功能者叫非接合型或非自我转移性质粒(no-conjugative plasmid)非自我转移性质粒:R质粒、Col质粒 自我转移性质粒:F质粒及Ent质粒(可产生肠毒素)基因工程中由于使用非接合型质粒,因此质粒的转移需人工条件,一般是用化学(氯化钙)
6、物理(电击)或其它方法(脂质体)改变细胞膜通透性,使质粒DNA进入细胞,该过程叫转化 质粒在自然条件下可从宿主菌中消失,或在人工条件下消失,这叫质粒的消除,俗称丢失。基因工程中质粒,特别是重组质粒的丢失是非常不幸的事 可促使质粒丢失的因素:吖啶橙、结晶紫、溴化乙锭、利福平、SDS、紫外线等质粒载体的概念 质粒载体是以细菌天然质粒的各种组件为基础,经人工改造、构建而成的特殊质粒 外源基因的载体,是基因工程的工具质粒的基本条件1、复制起点:自我增殖,一个或两个(shuttle)2、标记基因选择标记基因:用于鉴别目标 DNA(载体)的存在,将成功转化了载体的宿主挑选出来 筛选标记基因:用于将特殊表
7、型的重组子挑选出来标记基因选择标记 氨苄青霉素抗性基因(Ampicillin resistance gene,Ampr)四环素抗性基因(Tetracycline resistance gene,Tetr)氯霉素抗性基因(chloramphenicol resistance gene,Cmr,cat)卡那霉素和新霉素抗性基因(kanamycin/neomycin resistance gene,kanr,neor)蔗糖致死基因 SacB:含蔗糖的培养基上 sacB 基因的表达对大肠杆菌来说是致死的,因此该基因可用于插入失活筛选重组子筛选标记1.-互补(-complementation)-互补是指
8、 lacZ 基因上缺失近操纵基因区段的突变体与带有完整的近操纵基因区段的-半乳糖苷酶(-galactosidase,由 1024 个氨基酸组成)突变体之间实现互补2.插入失活3.GFP筛选标记2.插入失活3.GFP质粒的基本条件3、若干限制酶单一识别位点4、小的分子量、高的拷贝数常用质粒载体克隆载体克隆载体主要用于扩增或保存 DNA 片段pBR322系列pUC系列pUC18/19 pGEM系列:多功能质粒载体是由pUC质粒改建而来。在多克隆位点两侧多了两个来自不同噬菌体的启动子,即T7和SP6启动子,可用于克隆、表达、转录及测序等。质粒载体的受体细胞 基因工程中使用的菌株叫做工程菌,都是经过人
9、工筛选、改造的菌株 受体菌的人工改造是接受外源DNA和阳性转化子筛选的基础,改造重点:R(限制阴性)、M(修饰阴性)、red (重组缺陷型,即不能与外DNA发生重组)及抗性,与载体的表型互补(LacZ M15)(1)DH5 具有互补作用,适用于多种质粒载体(2)HB101 无互补作用(3)JM系列 具有互补作用噬菌体载体噬菌体载体双链DNA噬菌体载体单链DNA噬菌体载体双链DNA噬菌体载体 噬菌体是一种双链DNA病毒,大小约48 502bp,在噬菌体颗粒中它是以线状形式存在,线状分子的两端有一个12个核苷酸的、5-端突起的、可互补的粘性末端(Cohesive end site,COS)。当侵入
10、宿主细胞后,线状DNA分子借助粘性末端连结成环状分子 野生型噬菌体基因组DNA 的MW为48Kb,所以包装上限:105%48Kb=51Kb 必须区段28 Kb,所以克隆能力为51-28=23 Kb 噬菌体作为载体的优点:a.可容纳较大的外源DNA片段b.具有较高的感染效率c.由于能裂解宿主细胞,容易提取载体DNA或重组DNAd.用载体组建的DNA或cDNA文库易于长期保存 柯斯质粒载体 粘粒载体,由Collins和Hohn于1978年构建 Cosmid:cos site-carry plasmid,带有粘性末端位点的质粒。是人工构建的含有 DNA的cos位点和质粒复制子的特殊类型的质粒载体 特
11、点:具有质粒和噬菌体载体的双重特点可以插入较大的外源基因(3145kb)柯斯质粒载体质粒复制子、MCS、选择标记cos位点及包装序列(末端酶,能识别两个相距适宜的cos位点),体外包装,高效转染,但不产生子代单链噬菌体载体 单链噬菌体包括M13、f1、fd,均为丝状,亲缘关系密切,长度均为6.4kb,单链环状正股DNA分子 优点:胞内为双链,胞外为单链。复制型为双链环状DNA,可按细菌质粒使用。单链可用作测序、制备探针、定点诱变。无论双、单链,均不需包装即可感染大肠杆菌,体内包装不受DNA分子大小限制噬菌粒(phagemid,phasmid)质粒载体和单链噬菌体载体结合而成的载体 优点:分子量
12、小(3.0Kb)、克隆能力大(10Kb)、稳定遗传以及用来制备单链或双链DNA(有辅助病毒存在时,载体就以噬菌体的模式增殖,产生单链DNA。若无辅助病毒存在,则以质粒的形式复制,产生双链DNA)等pEMBL(f1与pUC8组成)pBluescript(f1与pBR322组成)。pGEM-T Easy(3kb),俗称“T载体”(pGEM与f1组成)pUC118/119(M13与pUC18组成)噬菌体的受体菌 噬菌体的常用宿主菌均为大肠杆菌,但不同性质的载体应选择不同遗传标记的菌株。应查有关资料 M13最常用的宿主菌为JM系列(JM101110)酵母人工染色体(YAC)真正的人工染色体要在寄主细胞
13、中稳定地复制并遗传下去,必须具备三个元件:复制起始区(origin of replication),参与染色体DNA 复制起始结构的形成;着丝粒(centromere),负责染色体向子细胞的传递;端粒(telomere),对染色体DNA 两个末端起封口和保护作用 YAC 能容载长达9001000kb片段。缺点:1)存在嵌合现象(chimerism),即一个YAC克隆中的插入子可能来自两个或多个不同的片段,嵌合体的比例达到10%50%,这种现象使染色体步行(chromosome walking)和基因分离难度加大;2)稳定性差,插入片段存在重排和丢失现象;3)插入片段的分离和纯化困难;4)转化效
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