2013新农大考研生化资料.docx
《2013新农大考研生化资料.docx》由会员分享,可在线阅读,更多相关《2013新农大考研生化资料.docx(25页珍藏版)》请在三一文库上搜索。
1、静态生物化学氨基酸等电点当氨基酸以兼性离子形式存在,即氨基酸的静电荷为0,这个PH值称为等电点蛋白质由20种L-氨基酸以肽键相连构成的生物大分子(出自导言)/ 生活细胞内含量最丰富,功能最复杂的生物大分子,并参与了几乎所有的生命活动和生命过程(正文1段1句)多肽通常由10100氨基酸分子脱水缩合而成的化合物叫多肽(百度百科)蛋白质一级结构肽链中氨基酸的排列顺序蛋白质二级结构在一级结构的基础上进行缠绕折叠所形成的主链上原子局部空间排列不涉及其他肽键片段间的相互关系或侧链构象(笔记)/ 肽链主链不同钛段通过自身的相互作用、形成氢键,沿某一主轴盘旋折叠而形成的局部空间结构(P42第一句)-螺旋当某一
2、段肽链中所有的C的扭角分别相等时,则这一段肽链的主链就会围绕一个中心轴形成规则的螺旋构象蛋白质结构域存在于球状蛋白质分子中的两个或多个相对独立的、在空间上能辨认的三维实体,每个由二级结构组合而成,充当三级结构的部件,其间由单肽链连接蛋白质三级结构在二级结构基础上进一步在空间自由卷曲折叠构成一个很不规则但具有特定构象的蛋白质分子结构(笔记)/ 多肽链在二级结构的基础上通过侧链基团的相互作用进一步卷曲折叠,借助次级键维系使二级结构相互配置而形成的特定的构象(P46)蛋白质四级结构由两条或两条以上具有三级结构的多肽链聚合而成特定构象的蛋白质分子。每一条多肽链称为一个亚基蛋白质等电点当蛋白质在某一PH
3、溶液中其分子静电荷为0时溶液的PH值蛋白质变性在外界因素作用下,蛋白质原有的高度规律性的空间结构遭到破坏,一级结构不变,蛋白质生物活性丧失的现象酶细胞产生的一类蛋白质可在细胞内外起催化作用,加快体内化学反应的进行(笔记)/生物体内一类具有催化活性和特定空间构象的生物大分子,包括蛋白质和核酸(答案)多酶复合体几个酶聚合而成的复合体米氏方程V=VMAXS/(Km+S)Km酶的特征物理常数可逆抑制作用抑制剂与酶可逆结合,使酶活性降低,可用透析等方法恢复活力变构酶除具有酶的活性中心外,还具有与调节物结合的调节中心的寡聚酶同工酶催化相同化学反应,而酶蛋白的分子结构、理化性质不同的一组酶核酶某些去蛋白质组
4、分的RNA分子具有与全酶相同的催化活性酶的活力单位酶分子中直接与底物结合,并和催化作用直接相关的部位比活力单位质量样品中的酶活力维生素维持机体正常生命活动不可缺少的一类小分子有机化合物核酸多个核苷酸彼此通过3,5-磷酸二酯键连接所形成的多聚核苷酸核苷酸核苷中的戊糖羟基被磷酸酯化,形成核苷酸核酸的一级结构核苷酸的排列顺序增色效应(减色效应)DNA变性(复性)后,在260nm处的紫外吸收显著增高(降低)的现象核酸变性核酸双螺旋的氢键断裂,变成单链,并不涉及共价键的断裂Tm(溶解温度/DNA熔点)50%的双链DNA发生变时的温度退火变性DNA在缓慢冷却时,可以复性,此过程称为退火核酸复性变性DNA在
5、适当条件下,又可使两条彼此分开的链重新缔结为双螺旋结构超螺旋以DNA双螺旋为骨架,围绕同一中心轴形成的螺旋结构,是在DNA双螺旋的基础上的进一步螺旋化2 / 25分子杂交形成杂交分子的过程单糖是最简单的糖,不再被水解成更小的糖单位双糖两个单糖的缩合产物多糖多个单糖基以糖苷键连接而形成的高聚物三酰甘油脂肪酸中的甘油三元酯甘油磷脂广泛存在于动物和微生物中一类含磷酸的复合脂类胆固醇甾醇族中最主要的一类固醇类化合物存在于动物细胞膜及少数微生物中1)氨基酸的分类及其酸碱性的判断(分类)非极性氨基酸:丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、脯氨酸、苯丙氨酸、色氨酸、蛋氨酸极性氨基酸酸性氨基酸:天冬氨酸、谷氨酸碱
6、性氨基酸:精氨酸、组氨酸非解离的极性氨基酸:甘氨酸、丝氨酸、苏氨酸、半胱氨酸、酪氨酸、天冬氨酸(酸碱判断)要使其能够带正电,水解和电离后,总的来说氨基酸上的NH3要多于COO,而生成一个NH3就要得到一个OH,生成一个COO就要得到一个H,因此得到的OH要比H+多,因而显示出碱性;相反,要是带负电的话,那么就显示出酸性2)氨基酸pK值计算及氨基酸在电场中的泳动迁移方向 氨基酸等电点计算非极性氨基酸和极性不带电荷氨基酸:PI=1/2(PK1+PK2) 酸性氨基酸:PI=1/2(PK1+PK2) 碱性氨基酸:PI=1/2(PK2+PK3) PI值若小于溶液Ph值,往正极移动,反之往负极3)氨基酸的
7、化学反应原理及应用:茚三酮反应、2.4-二硝基苯反应、异硫氰酸酯反应、丹磺酰氯反应茚三酮反应在弱酸条件下,氨基酸与茚三酮共热生成紫色化合物,脯氨酸与羟脯氨酸则与茚三酮共热生成黄色化合物 用于氨基酸定量和定性分析2,4-二硝基苯反应弱碱性溶液中,氨基酸的-氨基与2,4-二硝基苯反应,生成黄色的二硝基苯氨基酸 用于测定肽链N-末端氨基酸异硫氰酸酯反应在弱碱性条件下,氨基酸的-氨基与PITC反应,最终生成PTH衍生物 测定氨基酸序列丹磺酰氯反应专一地与链N-端-氨基反应生成丹磺酰-肽,后者水解生成的丹磺酰-氨基酸具有很强的荧光,可直接用电泳法或层析法鉴定出N-端是何种氨基酸4)蛋白质一级、二级、超二
8、级、结构域及三级、四级结构的相互关系及维持各级结构的主要作用力 一级二级超二级结构域三级四级一级肽键、二硫键 二级氢键 三级疏水作用力、配位键 四级配位键 (盐键、范德华力未知)5)分离蛋白质常用方法及其原理前处理以适当方式将组织细胞破碎,是蛋白质以溶解状态释放出来,并保持其天然构象和原有生物活性 组织捣碎机、匀浆器、超声波破碎法(微生物高压挤压、溶菌酶、超声波法)粗分级从蛋白质混合液中去除大量杂质 盐析、等电点沉淀、超滤、有机溶剂分级细分级进一步提纯 凝胶过滤、吸附层析、离子交换层析、反向高效液相层析、亲和层析、凝胶电泳、等电聚焦6)蛋白质变性的原因及变性后蛋白质结构的变化变性原因:物理因素
9、加热、射线、超声波、高压处理等 化学因素强酸、强碱、重金属盐、生物碱试剂、有机溶剂等结构变化:一级结构不变,组成成分和相对分子质量不变 二、三级以上的高级结构发生巨大改变或破坏,致使蛋白质分子表面的结构发生变化,亲水基团相对减少,疏水基团大量暴露在分子表面,蛋白质颗粒失去水化层,极易引起分子间相互聚集而产生沉淀7)蛋白质二级结构的基本构象单位及特征基本构象-螺旋:右手螺旋,一圈3.6个氨基酸残基,沿螺旋轴上升0.54nm,中心轴垂直上升0.15nm,氢键与中心轴平行-折叠:肽键平面之间折叠成锯齿状结构,侧链R基团交错于锯齿状结构上下方,氢键方向与折叠的长轴基本垂直-转角:维系转角的有4个氨基酸
10、残基无规则卷曲8)酶的活性中心、底物结合部位、催化部位及变构部位之间是什么关系活性中心内必需基团底物结合部位、催化部位 外必需基团变构部位9)酶反应中米氏常数Km、酶反应速度的计算Km见定义 V=VMaxS/Km10)影响酶反应速度的因素及影响因素的原理 1)底物浓度 底物浓度较低时,反应速度随底物浓度增加而升高,反应速度与底物浓度近乎成正比;底物浓度较高时,反应速度增加不明显。底物浓度继续增大时,反应速度则趋于极限值 2)酶浓度 在酶促反应系统中,当底物浓度大大超过酶浓度,使酶被底物饱和时,反应速度与酶浓度变化成正比 3)温度 温度低于最适浓度时,升高温度可以提高反应速度;高于最适温度,升高
11、温度降低反应速度 4)PH 钟形曲线升高,最适(最高),降低 5)激活剂 增加反应速度 6)抑制剂 a)不可逆抑制作用 通常以共价键与酶活性中心上的必需基团相结合,不能用透析等物理方法去除 b)可逆抑制作用 以非共价键与酶可逆结合,可以用物理方法去除 a竞争性抑制 底物与抑制剂竞争性地与酶活性中心的同一部位结合。增加底物浓度可解除竞争性抑制剂作用。当竞争性抑制剂存在时,km增大,Vmax不变 b非竞争抑制剂 此类抑制剂与酶的结合不在同一位点。当非竞争性抑制剂存在时,km不变,Vmax减小 C反竞争抑制剂 抑制剂只能与酶与底物的复合物结合,当此类抑制剂存在时,km和Vmax都减小11)酶促反应动
12、力学中竞争性抑制、非竞争性抑制、反竞争性抑制的不同点及Vmax、Km值的变化(见上一题)12)DNA双螺旋结构及超螺旋结构的特点 双螺旋a) 由两条反向平行的多核苷酸链组成双螺旋结构b) 碱基位于内侧,碱基平面与纵轴垂直,碱基之间的距离0.34nmc) 磷酸和脱氧核糖在外侧,彼此通过磷酸二酯键连接,形成骨架,糖环与主轴平行d) 双螺旋直径2nm,顺轴方向每隔0.34nm有一个核苷酸核苷酸夹角36o,沿中心轴转一圈有10个氨基酸e) 两条链碱基之间形成的氢键连接,A-T(2个氢键)C-G(3个氢键)超螺旋 常见的是左手螺旋13)DNA热变性的特点及熔解温度Tm值变性特点a)粘度下降 b)增色效应
13、 c)浮力密度升高 d)生物活性部分或全部丧失 e)比旋下降Tm(概念略) Tm的影响因素DNA的均一性(均一性越高,溶解温度的范围越小);G-C含量(G-C)%=(Tm-69.3)2.44;介质离子强度(介质离子强度较低,DNA的Tm较低)14) DNA碱基对数、螺旋数及碱基百分比组成的计算碱基对数=DNA长度/0.34nm(DNA长度换算成nm)螺旋数=碱基对数/10碱基百分比:(G+C)%=(Tm-69.3)2.44G/C=GC比/2 (A+T)%=100-GC比G/C=AT比/215) RNA的主要类型及比较各类型的一级、二级及三级结构和功能细胞内主要RNA种类及功能名称英文缩写功能核
14、蛋白体RNArRNA核蛋白体组成成分信使RNAmRNA蛋白质合成模板转运RNAtRNA转运氨基酸不均一核RNAhnRNA成熟mRNA的前体小核RNAsnRNA参与hnRNA的剪接,转运小胞浆RNAscRNA/7SL-RNA蛋白质内质网定位合成的信号识别体的组成成分小核仁snoRNA参与rRNA的加工和修饰 tRNA结构(二级:三叶草式)P23 1.70-90核苷酸组成,沉降系数4S 2.A-U/G-C构成双螺旋区为臂,不配对部分为环,4臂4环 3.氨基酸臂:叶柄,包括3CpC-pAOH,5PG 4.tRNA的3个核苷酸反密码子反密码环 5.左臂一个二氢嘧啶环,环上有二氢尿嘧啶 6.右臂一个TC
15、环,反密码臂和右臂之间有一个可变环 7.碱基组成中含较多的稀有氨基酸(三级:倒L型)P23 接受氨基酸的3-CCA位于L一端,反密码子环另一端,二级结构基础上形成一些新的碱基对,使三叶草结构发生扭曲 rRNA结构 1.半数以上碱基可配对形成链内局部双螺旋 2.存在G-U和G-A非标准碱基配对 3.一般与特定蛋白质形成核蛋白体,参与蛋白质生物合成 mRNA结构 1.3末端有一个polyA的尾巴结构 2.5末端有m7G帽子结构 3.m7G以5-5连接方式连接16)tRNA二级结构的组成特点及功能(见上题)17)比较DNA和RNA二级结构特点(见12、15题)18)生物体内的多糖分布和组成形式及作用
16、P137 这里略)19)生物体内脂类的种类、组成和各自的作用(未知) 动态生物化学生物氧化生物细胞将糖、脂、蛋白质等燃料分子氧化分解,最终生成CO2和H2O并释放出能量的作用氧化磷酸化电子从NADH或FADH2经电子传递链传递到分子氧形成水,同时偶联ADP磷酸化生成ATP的过程底物水平磷酸化在底物氧化过程中,形成某种高能中间代谢物,再通过酶促磷酸集团转移反应,直接偶联ATP的形成P/O比每消耗一个氧原子所产生的ATP分子数电子传递链(呼吸链)生物氧化的中间产物氧化脱下的氢,其电子沿着氧化还原电位高低排列的一系列电子传递体传递给O2的体系糖酵解在细胞质内,糖在不需要氧的条件下,经磷酸化和裂解,
17、逐渐分解为丙酮酸并 生成ATP的过程TCA循环途径丙酮酸氧化为乙酰CoA和乙酰CoA的乙酰基部分经过一个循环式系列反应最终氧化为CO2和H2O,并且释放出大量能量磷酸戊糖途径细胞质中,由6-P-G直接氧化脱羧,生成二氧化碳、NADPH和5-磷酸核酮糖,并进行单糖磷酸酯相互转变再生6-P-G的过程TCA回补反应三羧酸循环不仅是产生ATP的途径,它的中间产物也是生物合成的前体,可导致草酰乙酸浓度下降,从而影响三羧酸循环的运转因此必须不断补充才能维持其继续进行糖异生 由非糖有机物转化为葡萄糖的过程脂肪酸的-氧化脂肪酸在体内的氧化是从羧基端-碳原子开始的,碳链逐次断裂,每次产生一个乙酰CoA(书221
- 配套讲稿:
如PPT文件的首页显示word图标,表示该PPT已包含配套word讲稿。双击word图标可打开word文档。
- 特殊限制:
部分文档作品中含有的国旗、国徽等图片,仅作为作品整体效果示例展示,禁止商用。设计者仅对作品中独创性部分享有著作权。
- 关 键 词:
- 2013 农大 考研 生化 资料
