XX医院多模态大数据一体化平台项目（一期）采购需求.docx

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1、XX医院多模态大数据一体化平台项目（一期）采购需求一、建设背景1、健康中国建设背景2016年，中共中央、国务院印发了“健康中国2030”规划纲要，提出健康中国2030主题”共建共享、全民健康”，要求大力加强国家临床医学研究中心和协同创新网络建设，加强资源整合和数据交汇，建设临床医学数据示范中心，深化健康医疗大数据在临床和科研领域的应用.推动健康科技创新.推进医学科技进步。2、国家大数据战略背景2016年6月，国务院办公厅发布了关于促进和规范健康医疗大数据应用发展的指导意见，将健康医疗大数据纳入了国家大数据战略，体现了国家对健康医疗信息化的重视。指导意见提出，夯实健康医疗大数据应用基础，推动健康

2、医疗大数据资源共享开放；全面深化健康医疗大数据应用，推进健康医疗行业治理大数据应用和健康医疗临床和科研大数据应用，培育健康医疗大数据应用新业心、O3、先进技术发展背景近年来，大数据、人工智能、多模态数据融合等先进技术迅猛发展，如海量数据处理与存储技术、机器学习技术、NLP技术、大模型技术、以及数据融合技术等，扩展了医疗数据可用模态与维度，对医疗数据在临床、科研、运营等智慧应用中提供了新的思路和研究方法。二、建设目标一期项目建设XXXX医疗中心多模态大数据一体化平台，赋能医院学科建设和临床发展，促进高质量科研成果产出和转化，进一步提升医院高质量发展水平和全国影响力。汇聚XXXX医疗中心一院多区临

3、床、科研等业务数据，数据模态覆盖结构化数据、临床文本、影像、病理、生信等全维度、多模态数据；通过大数据和AI等先进技术，对不同模态数据进行汇集、标注、提取、处理，实现数据统一结构、统一标准、统一管控，覆盖数据采集、治理、服务和监管等全生命周期；建设湖仓一体大数据平台，在此基础上建设临床专病数据库与多模态Al科研平台，支持医院相关人员开展数据资产管理、科研数据管理、医学研究、数据分析、模型验证等活动，挖掘多模态数据价值，持续提升临床医疗质量、科研效率和科研水平，加速医疗数据治理及成果转化，带动医疗水平迈上新台阶。同时按DCNM三级标准建立医院多模态数据全生命周期管理体系。三、建设范围一期项目建设

4、范围覆盖XXXX医疗中心一院五区HISEMR,LISRISPACS、重症、手麻、科研等相关业务系统；数据模态覆盖结构化数据、临床文本数据、影像数据、病理数据、生信数据等。四、建设要求4.1整体要求（1）须根据医院信息平台建设标准以及建设目标进行整体规划设计，提供详细的设计和建设方案，并符合国家一系列医疗信息化建设标准和规范。（2）系统应满足医院湖仓一体多模态大数据平台与科研应用的总体需求。各应用系统的软、硬件设计均应考虑满足总体需求,有统一数据结构和术语体系。（3）符合现行医院体系结构、科研模式和业务流程，能够满足医院一定时期内对多模态数据治理与临床、科研、运营等工作的需求；能够提高医疗质量与

5、医学科研效率，提升医疗与科研水平。（4）系统设计需要充分考虑医院现有信息化建设情况，遵循现有以医院信息集成平台为核心的业务架构，并支持与医院信息集成平台、CDR等平台进行对接，改善医院现有架构体系，提升运行效率。(5)系统应达到国内领先的水平。系统应该具备在今后五年时间里的生存能力，并且在可持续发展性上应具有灵活扩展与升级空间；在大数据技术、AI技术选择方面，以及软件功能编制方面，均应具有一定程度的超前性和扩展性。(6)系统建设期间需要根据医院要求免费定制相关功能，以满足医院发展需要。同时平台建设满足医院国产化信创的相关要求。4.2建设依据和参考规范(1)国家卫生信息化标准基础框架(2)中国卫

6、生信息标准基础数据集(3)中国医院信息基本数据集标准(4)卫生信息数据规范指南(5)电子病历基本数据集(6)国家卫生与人口信息字典(7)卫生信息数据元目录(8)医学数据影像通信基本数据集(9)电子病历基本架构与数据标准(Io)临床检验结果共享系统互操作行规范（三）基于电子病历的医院信息平台建设技术解决方案(12)卫生综合管理信息平台建设指南(13)全国医院信息化建设标准与规范(试行)(14)医院信息平台应用功能指引(15)医院信息建设应用技术指引(试行)(16)医疗机构医疗大数据平台建设指南(征求意见稿)(17)国际疾病分类(ICD-9、ICD-10、ICD-H)(18)医学数字化影像通讯标准

7、DICOM3(19)规范化临床医学术语标准SNOMEDCT(20)观测指标标识符逻辑命名与编码系统LoINC(21)医疗卫生领域信息交换标准HL7V3(22)临床文档架构CDAR2(23)医疗信息系统集成规范IHE(24)中华人民共和国计算机信息系统安全保护条例(国务院令第147号)(25)计算机信息系统安全保护等级划分准则(GB17859-1999)(26)信息安全等级保护管理办法(公通字200743号)(27)卫生行业信息安全等级保护工作的指导意见(卫办发(2On)85号)(28)信息系统安全等级保护实施指南(GB/T25058-2010)(29)信息系统安全等级保护基本要求(GB/T22

8、239-2008)(30)信息系统等级保护安全设计技术要求(GB/T25070-2010)(31)信息系统安全等级保护测评要求(GB/T28448-2012)(32)信息安全技术网络安全等级保护测评要求(GB/T28448-2019)(33)中华人民共和国个人信息保护法4.3架构要求采用目前主流大数据架构技术体系，保证具有未来3-5年的技术先进性。使用数据湖仓一体化技术进行医院数据资源架构设计，构建医院数据资源底座。多模态大数据支撑平台进行多模态数据的统一采集和整合，采集方式包括批式、流式和接口等不同方式，采集数据类型包括结构化数据、半结构化数据、非结构化数据，并进行数据异构整合与处理，包括自

9、然语言处理、数据标化、特征提取、逻辑转换等，支持数据治理流程化、可视化、标准化等，支持数据溯源管理。湖仓一体化数据中心需支持医院基于多模态数据应用场景，满足全方位的科研数据需求；满足数据要素交易及医院临床、运营等相关数据需求。4.4基本技术要求(1)支持多层的应用架构，支持B/S、C/S架构。(2)支持基于组件的设计：用户可以根据需要按角色组合和配置组件。(3)支持跨数据库平台数据存取技术：在物理存储层，系统应该具有良好的跨数据库平台技术。(4)支持虚拟化及超融合技术：实现服务器虚拟化、存储虚拟化、网络虚拟化和桌面虚拟化等。(5)全面支持国产信创相关要求。(6)支持用户自定义配置的工作流程管理

10、提供工具和功能，根据因环境或内部流程的变化而配置产品，使之能良好适应需求的变化，持续支撑医院业务发展。(7)支持医院自定义：医院可以灵活的使用现有功能组件建立自己的应用，支持将开发的组件通过应用程序工具加入到应用。(8)支持TCP/IP协议、HTTP、HTTPS；(9)对数据库的访问支持ODBC,COM和JDBC；(10)支持XML、WebSerVice、HL7、ICD-10、SNOMEDASTM协议等国际信息交换标准；(U)支持DlCoM标准、支持UNICODE编码。(12)支持信息安全技术：医院信息化需要引入技术手段来保障信息系统的安全性，如身份认证、受限数据访问、数字签名、数据留痕、数

11、据审计、数据加密、数据脱敏等。(13)平台各项技术参数与性能要求满足DCMM3级相关要求。4.5平台要求(1)支持平台技术架构设计：实现医疗业务协同和统一管理。(2)以消息机制为技术核心。(3)通过预制的适配器能融合多种技术，如.NET、JAVAo(4)支持开发定制化的适配器。(5)能融合多种数据库，如事务性数据库ORACLE、Cache,SQLServer和分析型数据库MPP、Hive,全面支持国产信创数据库。(6)支持多种应用标准，如XML、Jsono(7)支持多种通讯协议，如TCP/IP。(8)支持WEBSERVICES。(9)提供平台性能监视器功能，能对设定的关键指标进行监控。五、技术

12、要求5.1多模态大数据平台（数据资产平台）序号功能模块技术参数要求1总体要求整合XXXX医疗中心一院五区临床、科研、运营数据，包括医院历史数据和未来产生的实时数据，形成一个数据资源覆盖全面的、实时的多模态大数据中心。支持将一院五区多源异构数据进行聚合，为保证数据中心存储数据的准确性，在将数据进入中心前，源数据将经过“抽取一转换一加载”等过程，将医院相关信息系统的历史数据及增量数据进行集成接入。通过多模态大数据平台，对医院临床、科研、运营数据进行结构化、标准化的整合治理，形成院级规范化、标准化、高质量的智能大数据中心。要求进行统一的医院数据资源架构设计，确保医院数据资源管理和使用合理，避免重复建

13、设、多头采集、数据治理不统一等问题。2数据湖与数据仓库支持建设湖仓一体化架构的医院数据资源底座，采用主流的数据湖管理平台，统一对接临床、科研、运营各类业务系统数据，进行数据的统一采集和整合。支持多种采集方式，包括但不限于批式、流式和接口等不同方式。支持各种类型数据采集，包括但不限于结构化数据、半结构化数据、非结构化数据。要求医院湖仓一体化数据中心将支撑医院未来临床、科研、运营应用层面的数据需求。原则上未来其它基于医院数据分析相关应用系统，不再直接对接原生产系统，所需数据均从数据湖中获取。支持各类临床数据内容，包括但不限于结构化临床数据、影像序歹U、病理标本、基因样本和测序原始数据，将数据进行整

14、合关联，形成数据湖。支持数据进行T+1或者实时的增量和补全。序号功能模块技术参数要求支持将数据湖中的数据资源依照OMOPCDM模型进行映射，建立患者主索引、重构相关的临床表关系、进行归一、处理无效的映射数据的关联关系、依照标准进行数据字段清洗、进行医学标准化、形成标准的医学数据仓库。支持根据医院信息，获取医院的系统信息生成数据源，可获取医院下的所有的表生成表信息；通过这些表信息可以创建HIVE表（采集表、增量溯源表、全量采集表、全量溯源表、备份采集表等）。提供选择工具，通过数据源信息，选择数据源以及数据源下的表获取该表字段，生成数据传输的语句，进行执行。支持选择数据合并、备份、复制所需的源库与

15、源表；以及目标库和目标表就可以生成合并所需要的语句，执行合并、备份、复制操作。支持选择所需要补全的表，可以向父级补全和向子级补全。支持根据mapping工作台创建项目，在项目下创建数据表进行原始数据到CDM及字典数据的转换，运行映射语句。支持进行数据推送,推送到OraCIe、CliCkhoUse、MySQL等数据库中。3数据采集与汇聚元数据采集：元数据信息文件导入和元数据信息自动采集，包括数据表结构、字段长度、字段类型等信息。数据模型维护：标准数据模型的维护，包括新增、查询、编辑模型等。采集统计：支持针对数据抽取、数据处理的情况进行统计和可视化展示，包括采集的数据量、数据合并处理的情况等。数据

16、源管理：对抽取数据源的可视化管理，可对数据源禁用、启用等操作，数据源敏感信息加密处理。采集信息管理：采集系统信息的透明化管理，包括采集的系统情况、数据表范围情况、数据表关联关系等；序号功能模块技术参数要求数据抽取配置：支持全院业务系统数据抽取,包括患者基本信息、患者就诊记录、医嘱、手术、诊断、放化疗、电子病历文本等数据；支持多种数据抽取引擎，满足多源异构的数据类型及数据库类型；支持输入、输出组件自定义配置，输入输出组件多样化，灵活应用；支持采集SQL解析功能，自动解析抽取所需元数据；支持全量/增量不同类型抽取项目配置，分类管理；支持采集优先级、采集时间、采集周期可视化配置；执行项目分类管理，抽

17、取项目可并行、串行执行配置；抽取日志记录，详细记录抽取数量，抽取执行开始、结束时间，抽取耗时，抽取执行过程日志详细展示，支持日志分析，报错告警处理。数据合并管理：支持数据合并可视化操作配置，按照不同的数据类型，执行不同的数据合并方式。数据质检：支持数据抽取质检，保证源和目标数据的一致性；支持数据合并、补全等数据处理过程环节质检。4数据深度治理数据治理是针对采集完成后的数据，进行一系列ETL转换生产下游各个应用可以使用的数据的过程o数据治理过程主要以后端任务的方式执行，配合前端一些日志、统计、配置、部署和质检功能。数据治理总览提供可视化的数据治理流程架构图，能够清晰的展示数据从数据源采集、数据治

18、理过程、到形成各类主题的全过程可视化。数据清洗支持EMPl（主索引）、数据去重、前归一、表关系重构、基础清洗、增量ID记录、自定义清洗、病人维度病例维度数据补全和CDM数据合并等数据清洗功能，序号功能模块技术参数要求支持所有任务均按照配置化的方式是实现，可以通过更改配置表的内容变更数据的治理内容，同时包含任务日志记录、异常监控、参数调优等功能支持按照任务模块详细记录数据清洗任务的维护、排错、修改流程。数据解析支持对非结构化EMR数据，如入院记录，出院记录，病程记录，首次病程记录，放疗记录，化疗记录，手术记录，死亡记录等原始数据（XML,HTML,TEXT）通过预处理，解析规则（关键字匹配，CD

19、M映射），后处理的方式解析成结构化数据的功能。数据标化支持基于数据清洗后的数据，将需要标化的数据依照SNOMEDCT标准（也支持ICD标准）进行数据标准化，形成标准数据集。5自然语言处理自然语义处理NLP支撑处理医学信息的非结构化数据（如病理、病历、检查报告等）的自然语义解析，可以通过自然语义平台自动识别解析医学信息，同时提供手动勾选不同医学信息的后结构化处理选项，支持中文分词、词性标注、句法分析、依存关系及与SNOMEDeT的映射；除此以外，自然语言处理提供了词法级、句法级、篇章级、向量级以及综合文本审核等数十个模块的文本处理能力，帮助医院为日常工作或运营降本、增效和创新。支持自定义结构化提

20、取内容，支持自定义结构化颗粒细度。支持集成可视化文本标注功能，标注人员可对直接文本进行标注。支持文本上传后，自动进行分词和断句。支持集成实体和关系模板设定的功能，满足对所需要提取的实体名和关系进行设定，具有自动化显示标注内容和实体间关系的功能。支持模型训练功能，自然语言处理模型可以通过标注好的文本数序号功能模块技术参数要求据进行主动学习和训练，使标注准确率得到提升。支持字典匹配、否定词识别、时间表达式抽取、正则表达式以及RUTA规则等。支持根据词与词之间的得分、信息牖、词频等信息来发现新词。系统训练模型功能：根据医院的数据情况，对系统中自然语言处理模型进行训练，以便自然语言处理模型能够更加精确

21、的处理医院各项临床文本数据。训练模型：包括训练预标注模型、训练日志查看等功能。其它功能：显示控制、新建项目、日志管理等功能。支持语料学习功能，建立满足后续训练和实际数据结构化处理需求的语料库，包括医学语料学习集（测试集、训练集管理）、模型管理、实体/关系库管理（添加实体、添加关系）等功能。提供至少100种文本自然语言处理模型，提供具体的模型清单，至少包括主诉现病史、个人史、婚育史、月经史、既往史、家族史、体格检查、生命体征、入院评分、专科检查、首次病程记录、病程记录、抢救记录、出院记录、临床诊断等。支持基于大模型技术的自然语言处理。6智能术语映射支持术语构建，根据自己设置的术语集规则，建立自己

22、的术语；支持术语查询、审核、设置等功能；支持国际标准临床术语SNOMEDCT（临床医学系统术语）、LOINC（观测指标标识符逻辑命名与编码系统）、MedDRA（国际医学用语词典）、ICD-IO编码（国际疾病分类TO）（国标版）的对照映射；支持建立术语映射或标化任务等任务管理功能；支持术语映射，用户可对术语映射进行手工调整；支持智能算法推荐，通过智能算法进行批量的映射，提高效率；支持术语审核，对标化人员标化的结果进行审核。支持基于大模型技术的术语智能映射。序号功能模块技术参数要求7数据质控管理对治理的全流程进行数据质控，数据质控的环节包括数据入湖、数据入仓、数据仓库内的清洗转换，以及专病库。针对

23、不同环节的数据质控可以统一配置，分别质控，规则引擎可以不同，数据质控方向可以不同，但是质控逻辑和质控流程应该统一，从而达到一平台多质控的目的。整个工作流程建立规则库、通过选择规则库形成质检方案、通过执行方案生成质检报告。数据质控首页。支持统计质检规则数、质检方案数、方案执行调度情况、质检通过情况规则库配置。支持添加质检规则，形成质检规则库，并且对规则可以编辑、删除、维护方案管理。支持添加方案，选择规则，配置质检执行时间和频度质检报告。支持通过执行方案，生成质检报告8数据溯源管理支持数据溯源功能，在数据进入数据治理环节，经过多次的数模型映射和处理后，能够方便进行数据来源的追溯，掌握数据的源头。支

24、持血缘树基础功能o支持数据在后台治理过程中，在数据入湖、数据入仓、数据进入专病库三个环节进行标记，在溯源的时候通过基础功能收集数据在各个治理节点做的标记信息，生成血缘树，并能够保存。支持血缘树数据治理功能。支持编辑保存后的血缘树，可对无用的节点进行裁剪，优化血缘树。支持血缘树数据溯源功能。支持通过血缘树，进行数据溯源，展示溯源源点。9元数据管理支持元数据监控，对元数据整体情况进行统计分析，包括元数据数量、元数据类型数量、元数据关系数量等的统计，以及图表展7Jo支持元数据智能采集，并能够可视化设置相关采集配置参数。序号功能模块技术参数要求支持元数据管理，能够对技术元数据、业务元数据、操作元数据、

25、管理元数据等进行管理。支持元模型管理，包含字段、库、函数、索引、主键、存储工程、表、触发器、视图等的管理，依照原模型配置不同的数据源进行元数据读取，通过读取的元数据进行存储管理。支持对元数据进行分析，包括血缘分析、影响分析、数据地图等分析。10主数据管理支持对主数据进行采集，并对主数据信息进行维护，发布。支持主数据概览，支持对原始词、标准词、同义词、字典等相关数据进行可视化统计展示。支持数据标准管理，支持对数据湖、数据仓库、OMOP库等数据字典进行管理。支持数据映射管理，支持对不同的数据字典进行查询和管理。支持主数据模型管理，支持对各主数据模型进行管理与关联操作。11数据资产管理支持建立过统一

26、的数据资产目录，沉淀数据供给方生产的各类型数据，帮助数据医院快速了解和获取业务需要的高质量数据资产，促进医院数据资产发挥更大的业务价值。数据资产报告：支持对数据资产的全局及增量指标进行统计和展示资产目录概览：支持对公开共享的数据资产，可在资产目录进行搜索、目录列表查看资产目录管理：支持新建数据资产目录，并新建类目、设置类目编码规则、进行资源挂载等。资产生命周期管理：支持可以管理资产的发布，撤销等操作，资产发布申请被资产安全管理模块审批通过以后可以被阅读，未发布的资产不可被搜索和查看，已发布的资产可以撤销。资产安全管理：支持资产维护人员对不同类型（数据表，指标，序号功能模块技术参数要求API）的

27、数据资产进行申请审批，由相关负责人进行审批，审批通过后的数据资产则可以进行展示。12数据共享开放预留APl（应用程序接口）开放接口，支持第三方应用的改造与集成调用；支持全文语义检索、数据可视化、数据导出等应用共享。满足APl身份确认机制、患者去隐私、具有RESTfUl的API、支持JSON/XML数据格式、支持开放标准支持HL7V2、FHIR标准等传输等。支持对数据的使用、共享过程进行跟踪与审计。数据导出流程管理：支持与医院OA系统进行对接，实现数据申请、审批、导出的业务流程，记录操作日志，实现留痕追溯。支持对APl调用过程进行跟踪与审计。13任务调度管理支持大数据生产全流程手动、自动可视化调

28、度及数据治理过程查看；支持任务执行状态全流程监控及可视化展示；支持任务分布式定时、周期调度；调度工作流程，支持可视化定制及生命周期管理：包括启动、暂停、停止、重新运行等；支持调度任务实例执行过程留痕及执行策略、告警策略、调度权限灵活配置；支持任务调度的全生命周期可视化状态监控。14平台智能监控支持全方位软、硬件监控及告警；支持接入监控，能够对平台接入的机构和接入的系统进行可视化监控，能够列出接入机构和系统的列表，能够显示接入系统的状O支持业务监控，支持数据采集情况监控、数据解析情况监控、数据治理过程监控等方面的监控管理。支持服务器资源监控，包括对内存、硬盘、CPU负载等的监控和预警；序号功能模

29、块技术参数要求数据源监控，包括mysqlredisclickhouse等的线程池、内存、连接数、峰值等多个维度监控；支持对大数据集群、ElasticSearch集群及大数据基础组件服务的可用性监控及异常自动修复重试；数据治理业务监控，支持包括数据采集、解析、治理等全流程的概览、数量、状态、详细操作日志的监控查看。15数据安全与隐私保护本项目要求供应商提供数据安全管理平台，对所建立的大数据中心进行全方位的安全管理。遵循中华人民共和国个人信息保护法。数据留痕支持数据留痕查询，包括访问、使用等信息。数据的使用须经过伦理审查，符合伦理要求后方可使用。访问控制安全支持系统应用级安全，包括统一身份认证、统

30、一权限管理等，贯穿整个安全管理体系。支持数据分类分级办法，对全院的全部存量非结构化数据进行统一管理。支持数据传输至院内先在缓冲区进行安全校验，保障数据存储安全。支持通过身份认证，访问控制，数据审计等多维度保证数据访问安全。数据风险评估建立数据风险评估模型，训练形成医院的数据安全预警模型。数据传输安全数据入院过程：全程SSL链路加密+安全硬件防护+安全管理，保证数据安全。数据出院流程：通过ID匹配相关数据，只有查看权限，数据回传全程脱敏，患者端只显示自己数据，保证符合数据安全法，个序号功能模块技术参数要求人信息保护法的相关要求。支持对关键数据进行加密，支持对称加密、非对称加密、散列等算法，如RS

31、A、DSA,MD5等算法;支持国产加密算法。患者隐私保护支持患者数据隐私保护，在政府配套法规支持下，支持对患者个人信息中的敏感信息（如患者姓名、身份证号、电话、地址等）通过脱敏或加密规则进行数据的变形，实现敏感隐私数据的可靠保护，同时依然保持其他数据的格式和属性，保证其可识别性和可用性；个人数据采用重识别率可控的脱敏策略，数据脱敏后才能回传，有效保护患者隐私。数据授权管理数据的授权应当支持数据级别的授权，病人可以给指定的医生（或其他个人用户）、医疗机构（或其他机构）赋予数据的读、写权限，同时可以给定生效的时间范围。数据水印支持数据水印功能，支持水印信息自定义设置，导出需添加用户水印。16数据探

32、索工具面向技术人员提供SQL查询工具；可以实现跨库查询；采用符合习惯的SQL编辑器；SQL查询语句记录（SOL查询保存，SQL资产搜索等）；支持多用户协同；支持数据导出。17可视化数据开发工具1 .支持可视化编排数据加工逻辑；2 .支持分钟级、小时级、天级调度设置；3 .支持数据集输入组件、数据过滤组件、数据脱敏组件、表关联组件、数据集输出组件、CSV输出组件、Mysql输出组件、SQL序号功能模块子功能模块技术参数要求结果进行存储数据展示支持对接影像类型为DICOM的影像数据、CT、核磁、SPECT、PET-CT等影像审核流程配置配置标注审核流程，如一标一审、多标多审标签配置支持配置标注标签

33、3病理标注标注数据管理标注任务进行增、册Ik改、查等管理，为标注任务设置协同标注人员，审核人员，质控人员等，查询数据标注的进度，查询标注完成的数据结果等；支持数据上传成员进度统计在标注端统计当前用户的工作量病理阅片展示病理影像，提供常用的阅片工具病理工具阅片及标注所使用的专业工具、提供多种勾画工具，包括：移动、缩放、多边形、矩形、点、画笔勾画工具、长度测量、局部放大病灶标注（手工）支持手动选择标注工具进行勾画，支持病灶字段信息的新增、保存、修改、删除；支持提交至审核状态病灶标注（智能）支持对接模型、选择模型进行半自动标注，支持对模型标注结果修改、删除等操作，支持一键模型标注数据存储通过运用XM

34、L方式等对医学图像标注的结果进行存储数据展示支持全视野的数字化切片/全切片数字化图像（wholeslideimage,简称WSI）通过全自动显微镜或光学放大系统扫描序号功块子功能模块技术参数要求支持分析过程重要文件及分析结果文件的下载支持MultiQC展示QC结果，并支持MultiQC报告下载支持分析工具及版本信息的汇总下载Panel靶向测序变异检测分析支持任务新增、列表管理，参数配置，分析模块选择等；支持BED文件上传，支持提供默认BED文件支持主流测序平台的fastq数据格式支持双端测序数据和单端测序数据支持数据质控、突变位点分析、拷贝数变异分析、结构变异分析支持Somatic突变检测分析

35、即肿瘤组织和正常组织的配对分析支持仅有肿瘤样本的Somatic突变检测分析支持Germline突变检测分析支持用户根据不同分析类型选择相应的分析工具(比如FreeBayes、HaplotypeCallerStrelkaMutect2,Manta、TIDDIT、CNVKit等)支持分析过程中通过前端页面反馈分析进度支持通过前端页面在线查看分析结果支持分析过程重要文件及分析结果文件的下载支持MultiQC展示QC结果，并支持MultiQC报告下载支持分析工具及版本信息的汇总下载转录组测序表达定量检测分支持新增任务、任务列表管理，参数配置等；支持数据质控、比对参考基因组、表达定量分析支持主流测序平

36、台的fastq数据格式序号功能模块子功能模块技术参数要求析支持双端测序数据和单端测序数据支持不同比对工具的选择（STAR或者HlSAT2）支持不同表达定量工具的选择（Salmon或者RSEM）支持分析过程中通过前端页面反馈分析进度支持通过前端在线查看分析结果支持分析过程文件及分析结果文件的下载支持MultiQC展示QC结果，并支持MultiQC报告下载支持分析工具及版本信息的汇总下载基于质谱的代谢组数据定性及定量分析支持新增任务、任务列表管理，参数配置等；支持代谢组数据的Quantification及Identification分析支持MSl数据和MS2数据支持使用SIRIUS进行化学式鉴定支

37、持使用MS2Query进行相似化合物鉴定支持定量分析结果的汇总下载支持分析过程中通过前端页面反馈分析进度支持通过前端页面在线查看分析结果支持分析过程重要文件及分析结果文件的下载支持分析工具及版本信息的汇总下载生信临床科研工具集支持科研工具分析任务的管理包括添加、查看、删除、查询等操作。分析工具包括支持突变分析、基因表达分析、基因突变全景分析、M6AMethylationAnalysis分析、差异基因分析、桑基图、基因与生存工具、miRNAexpression、维恩图、WGCNA共表达网络调控、GSEA基因富集分析、临床信息、TMB、基因相关性分析、序号功能模块子功能模块技术参数要求批量相关分析

38、批量生存分析等16种分析工具分析结果支持下载和查看5.4专病科研分析系统序号功能模块子功能模块技术参数要求总体要求建设5个基于OMOP通用数据模型的专病库，开展专病科研分析工作；支持专病医疗质量分析，基于国家卫健委发布的专业医疗质量控制指标，实现质控指标分析、质量监测与评估、风险预警与干预，支持对接CDSS进行前端风险预警与干预。专病数据库数据采集1 .基于多模态科研大数据中心采集专病数据资源。2 .实现基于专病入组条件的专病数据自动采集入库。数据脱敏与加密支持数据脱敏和加密，保证科研的客观性和病人隐私的保密性。数据清洗支持专病数据清洗，包括数据缺失、数据重复、数据不准确等常见问题解决。数据

39、结构化和标准化1.支持数据结构化和标准化处理；2,支持SNOMEDCT术语体系。数据模型支持OMOP通用数据模型。数据校验支持数据完整性、一致性、准确性、一致性校验。专病统计首页专病库简报1.支持查看专病库内整体患者概要信息，包括全库患者数量，数据的时间序号功能模块子功能模块技术参数要求跨度，住院总人数，门诊总人数，性别分布，年龄分布，患者来源，就诊趋势。2.支持查看用药排名，手术排名，诊断排名，检查检验排名，合并症统计，治疗方式统计等。3.支持统计以多种形式展现，如：连续型指标采用条形图、柱状图、折线图等图表类型，分类型指标采用柱状图、饼图等图表类型。4.支持专病特有统计的定制化开发，如：巴

40、塞罗那分期、TNM分期。自定义布局支持用户根据自己喜好，自定义首页内容，各个数据项的位置。科研驾驶舱科研驾驶舱1.支持查看专病库内整体患者概要信息，包括全库患者数量，数据的时间跨度，住院总人数，门诊总人数，性别分布，年龄分布，患者来源，就诊趋势。2.支持查看用药排名，手术排名，巴塞罗那分期，综合分期，三分期，组织学类型，是否远处转移，是否靶向治疗等。3.支持统计以多种形式展现，如：连续型指标采用条形图、柱状图、折线图等图表类型，分类型指标采用柱状图、饼图等图表类型。4.支持专病特有统计的定制化开发。序号功能模块子功能模块技术参数要求智能搜索高级搜索L为具体指标设置搜索条件，精确搜索患者（例如：

41、TNM综合分期”包含“III期”）2.支持纳入、排除搜索，且支持两种搜索同时作用。3.搜索历史自动留存，并且可复用。4.搜索条件收藏，并且可复用。5.多个搜索条件之间的“并且”、“或者”关系灵活切换。6.支持同患者、同就诊两种维度查询。7.支持为搜索条件添加组，并且每个组之间的“并且”、“或者”关系灵活切换。8.不同类型数据不同搜索规则，数值型指标采用“大于”、“小于”、“等于等规则，文本型指标采用“等于”、“包含”、“不包含”等规则。9.支持在搜索条件上添加“首次”、“末次”的限定条件（例如：首次诊断名称包含“肝恶性肿瘤”）。10.计算全部条件节点综合搜索出的总患者数量。11.计算每个组搜

42、索出的患者数量。12.计算每个条件节点上搜索出的患者数量。事件搜索1.支持多条件组合，精确定义TO事件。2.支持基于TO事件，在其前后添加多序号功能模块子功能模块技术参数要求个限定条件。3.灵活配置事件前后多个条件之间的关系（例如：满足任意条件，满足全部条件）。4.支持多条件搜索，添加新事件搜索时可选择空白搜索或复制上一个事件搜索。5.支持在添加其他事件时，有示意图展示与TO事件的关系。快速搜索L支持通过用药名称、检验名称、手术名称进行快速搜索找到目标患者。搜索结果查看1.搜索结果数据概览，支持手术人次、住院人次、检验总人次、死亡人数、年龄/性别分布、就诊排名。2.支持查看患者360全景视图。

43、3.支持搜索出来的患者加入队列。4.支持搜索出来的患者加入科研项目。患者360全景视图患者360全景视图1.支持在人体图中展示患者诊断、手术的部位。2.患者诊疗事件按照时间可视化展JO3.支持查看每个诊疗事件的详情。4.支持查看每个诊疗事件的溯源文本。队列管理队列管理1.支持用韦恩图分析患者人群。2.支持队列中的患者加入到科研项目。序号功能模块子功能模块技术参数要求3.符合筛选条件的患者自动更新到队歹U。4.支持在队列中进行二次筛选，可对筛选出的患者另存为队列。5.支持患者列表字段自定义显示配置。6.队列内患者的可视化管理，如疾病、检验、检查、手术、用药信息等。7.支持数据导出。数据导出数据导

44、出1.导出格式支持SPSS、Excel,CSVo2.支持为待导出的指标限定时间阶段，导出特定一次的值（例如：首次诊断名称包含“单纯性疱疹”的当次就诊内“末次”C反应蛋白的值）。3.支持阶段内多种指标导出规则：首次、末次、最大值、最小值、平均值、求和、所有值等。4.支持在检验、用药的变量后面增加天数（例如：入院后持续服用“拜新同”多少天）。5.导出数据时支持使用概念集合进行设置，导出的数据中可查看相应概念集合的结果NYo6.保留所有用户的数据导出记录，便于管理。科研项目管理创建科研项目支持研究者根据课题需要创建回顾性科研项目和前瞻性科研项目，管理自己参与的科研项目，同时支持项目参序号功能模块子功

45、能模块技术参数要求与成员管理、项目相关参考文献附件管理；项目内支持搜索研究对象。研究对象支持数据检索出来的患者直接添加到项目中作为研究对象，支持已有队列的患者添加到项目中作为研究对象；研究对象支持剔除和增量加入。研究指标选取L支持根据课题需要，提取不同观测指标，且可以设置观测指标的基线时间,支持首次末次（例如：首次TACE术结束时间之后30天内）。2.支持观测指标的数据预览。3.支持观测指标的数据质量检查，可选择全部指标进行检查。4.观测指标支持实时自动保存。5.支持对研究对象某些观测指标的缺失值进行均数/中位数/随机数/删除替换。统计分析方法选取1.支持用户在创建项目，数据收集后，直接在平台上进行数据统计。目前版本支持相关分析、单因素分析、描述性分析、多因素分析、生存分析统计。统计分析结果可保存、方便管理科研成果。2.描述性统计。为科研项目中的变量进行基本统计量的计算，如构成比、均数、标准差、中心位、方差、极值、正态性检验等。3.单因素分析，支持单变量的单因素序号功能模块子功能模块技术参数要求组间比较，目前支持t检验、卡方检验、秩和检验、单因素方差分析。4.相关性分析支持两变